| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 311,801 | G→A | intergenic (‑465/‑311) | ecpR ← / → ykgL | DNA‑binding transcriptional dual regulator MatA/uncharacterized protein YkgL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 311,801 | 0 | G | A | 100.0% | 71.9 / NA | 20 | intergenic (‑465/‑311) | ecpR/ykgL | DNA‑binding transcriptional dual regulator MatA/uncharacterized protein YkgL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (11/9); total (11/9) | |||||||||||
AGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGTTCG > NC_000913/311728‑311877 | aGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGcac > 1:65382/1‑80 (MQ=255) aaTATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACaa > 1:65374/1‑80 (MQ=255) tataAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAAt > 1:65381/1‑81 (MQ=255) cTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACa < 2:65357/81‑1 (MQ=255) tgatgaGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAgg < 2:65358/80‑1 (MQ=255) atgaGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGgtgt > 2:65377/1‑81 (MQ=255) tCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGAACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCa < 2:65359/81‑1 (MQ=255) aTTGAAGATGATTTACCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCaa < 1:65360/80‑1 (MQ=255) gAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAg > 2:65379/1‑81 (MQ=255) ttGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGaa > 1:823878/1‑80 (MQ=255) ccAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAAt < 2:65361/80‑1 (MQ=255) cAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAAtt > 2:65384/1‑80 (MQ=255) cAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAAtt > 2:65380/1‑80 (MQ=255) tCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAAc < 1:65363/81‑1 (MQ=255) tCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAAc < 2:65362/81‑1 (MQ=255) cAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACg > 1:65378/1‑81 (MQ=255) aGTAAGATATTTTAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACgg < 1:65364/81‑1 (MQ=255) ttAATGGATTAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACg > 1:65397/1‑81 (MQ=255) tAACATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGtt > 2:65385/1‑81 (MQ=255) aCATACCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGTTCg < 2:65365/81‑1 (MQ=255) | AGAATATAAAACTATGATGAGCTGTCATTGAAGATGATTTGCCAATCAGTAAGATATTTTAATGGATTAACATGCCGCACAAAATGGTTACAGGTGTTCATTCCAATAAGTAATGGAAAATTGAACGGGCGTATGTACGTCATCTGTTCG > NC_000913/311728‑311877 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |