Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 399,509 | T→C | intergenic (‑176/‑84) | yaiY ← / → yaiZ | inner membrane protein/DUF2754 domain‑containing protein YaiZ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 399,509 | 0 | T | C | 100.0% | 61.4 / NA | 18 | intergenic (‑176/‑84) | yaiY/yaiZ | inner membrane protein/DUF2754 domain‑containing protein YaiZ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (8/10); total (8/10) |
TTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAAC > NC_000913/399436‑399583 | ttGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAAt < 1:82110/81‑1 (MQ=255) atatTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAAtgtt > 2:82134/1‑81 (MQ=255) gTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTAcacca > 1:82137/1‑78 (MQ=255) gTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAg < 2:82113/81‑1 (MQ=255) gTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAg < 2:82112/81‑1 (MQ=255) gTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAg < 2:82111/81‑1 (MQ=255) tGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGa > 1:82149/1‑81 (MQ=255) tCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGgttgt > 2:82133/1‑81 (MQ=255) cGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGgttgt < 2:82114/80‑1 (MQ=255) gTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGttgttg < 1:82115/81‑1 (MQ=255) aGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAat < 1:82116/81‑1 (MQ=255) aGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTG‑TCCAGAata > 1:82136/1‑81 (MQ=255) acaAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATg > 1:82135/1‑80 (MQ=255) ccTTAAGTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATgttgtt < 1:82117/81‑1 (MQ=255) gTTAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGt < 1:82118/81‑1 (MQ=255) ttAAATTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGtt < 1:82119/81‑1 (MQ=255) aaaTTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTaa > 2:82146/1‑81 (MQ=255) aaTTTACTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGTAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAAc > 2:82141/1‑81 (MQ=255) | TTGATGTTGGGAATATTCCCGAAGCGTGAATCTTCGTTGTGAGTCACAAAATGGCAACCTTAAGTTAAATTTATTAACAATTACGAAAATGTTGTCTACACCACAGACGGTTGTTGCAGAATATGCAAGGATGTTGTTTTTCGTTAAC > NC_000913/399436‑399583 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |