Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 982,175 | A→G | I377V (ATC→GTC) | ldtD → | L,D‑transpeptidase LdtD |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 982,175 | 0 | A | G | 100.0% | 64.0 / NA | 19 | I377V (ATC→GTC) | ldtD | L,D‑transpeptidase LdtD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (9/10); total (9/10) |
GCCCGCCCAGCGTGCTGGTGTGTTGGCTCTCAACATCCAGCGATTGCGCTTGCTGCCAACAGAGCTTTCTACCGGGATCATGGTTAACATTCCGGCCTATTCGCTGGTCTACTATCAGAACGGCAATCAGGTGCTGGATTCGCGAGTCAT > NC_000913/982099‑982248 | gcccgcccAGCGTGCTGGTGTGTTGGCTCTCAACATCCAGCGATTGCGCTTGCTGCCAACAGAGCTTTCTACCGGGGTCAt > 2:201568/1‑81 (MQ=255) gcccAGCGTGCTGGTGTGTTGGCTCTCAACATCCAGCGATTGCGCTTGCTGCCAACAGAGCTTTCTACCGGGGTCATGGt > 2:201557/1‑80 (MQ=255) gCGTGCTGGTGTGTTGGCTCTCAACATCCAGCGATTGCGCTTGCTGCCAACAGAGCTTTCTACCGGGGTCATGGTTAACAt > 1:201559/1‑81 (MQ=255) gTGCTGGTGTGTTGGCTCTCAACATCCAGCGATTGCGCTTGCTGCCAACAGAGCTTTCTACCGGGGTCATGGTTAACATTc < 1:201531/81‑1 (MQ=255) gTGCTGGTGTGTTGGCTCTCAACATCCAGCGATTGCGCTTGCTGCCAACAGAGCTTTCTACCGGGGTCATGGTTAACATTc < 1:201530/81‑1 (MQ=255) cTGGTGTGTTGGCTCTCAACATCCAGCGATTGCGCTTGCTGCCAACAGAGCTTTCTACCGGGGTCATGGTTAACATTCCgg < 1:201532/81‑1 (MQ=255) tgtTGGCTCTCAACATCCAGCGATTGCGCTTGCTGCCAACAGAGCTTTCTACCGGGGTCATGGTTAACATTCCGGCCTAtt > 2:201562/1‑81 (MQ=255) gCTCTCAACATCCAGCGATTGCGCTTGCTGCCAACAGAGCTTTCTACCGGGGTCATGGTTAACATTCCGGCCTATTCGCt < 1:201533/80‑1 (MQ=255) ccAGCGATTGCGCTTGCTGCCAACAGAGCTTTCTACCGGGGTCATGGTTAACATTCCGGCCTATTCGCTGGTCTACTAt > 2:201556/1‑79 (MQ=255) cAGCGATTGCGCTTGCTGCCAACAGAGCTTTCTACCGGGGTCATGGTTAACATTCCGGCCTATTCGCTGGTCTACTATCa < 1:201535/80‑1 (MQ=255) cAGCGATTGCGCTTGCTGCCAACAGAGCTTTCTACCGGGGTCATGGTTAACATTCCGGCCTATTCGCTGGTCTACTATCAg < 1:201534/81‑1 (MQ=255) aGCGATTGCGCTTGCTGCCAACAGAGCTTTCTACCGGGGTCATGGTTAACATTCCGGCCTATTCGCTGGTCTACTATCAg > 2:201566/1‑80 (MQ=255) tGCGCTTGCTGCCAACAGAGCTTTCTACCGGGGTCATGGTTAACATTCCGGCCTATTCGCTGGTCTACTATCAGAACGGc > 1:201569/1‑80 (MQ=255) cAACAGAGCTTTCTACCGGGGTCATGGTTAACATTCCGGCCTATTCGCTGGTCTACTATCAGAACGGCAATCAGGTGCTgg < 2:201536/81‑1 (MQ=255) aCAGAGCTTTCTACCGGGGTCATGGTTAACATTCCGGCCTATTCGCTGGTCTACTATCAGAACGGCAATCAGGTGCTGGAt < 2:201537/81‑1 (MQ=255) agagCTTTCTACCGGGGTCATGGTTAACATTCCGGCCTATTCGCTGGTCTACTATCAGAACGGCAATCAGGTGCTGGATTc > 1:201570/1‑81 (MQ=255) tttCTACCGGGGTCATGGTTAACATTCCGGCCTATTCGCTGGTCTACTATCAGAACGGCAATCAGGTGCTGGATTCGCGAg > 1:201563/1‑81 (MQ=255) cTACCGGGGTCATGGTTAACATTCCGGCCTATTCGCTGGTCTACTATCAGAACGGCAATCAGGTGCTGGATTCGCGAGTc < 1:201538/80‑1 (MQ=255) ccGGGGTCATGGTTAACATTCCGGCCTATTCGCTGGTCTACTATCAGAACGGCAATCAGGTGCTGGATTCGCGAGTCAt < 1:201539/79‑1 (MQ=255) | GCCCGCCCAGCGTGCTGGTGTGTTGGCTCTCAACATCCAGCGATTGCGCTTGCTGCCAACAGAGCTTTCTACCGGGATCATGGTTAACATTCCGGCCTATTCGCTGGTCTACTATCAGAACGGCAATCAGGTGCTGGATTCGCGAGTCAT > NC_000913/982099‑982248 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |