Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,371,717 | T→C | V501A (GTA→GCA) | ycjM → | glucosylglycerate phosphorylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,371,717 | 0 | T | C | 100.0% | 54.8 / NA | 16 | V501A (GTA→GCA) | ycjM | glucosylglycerate phosphorylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (4/12); total (4/12) |
ATTACACTTCGTCGCAGCCATAACGAGTTTCATCCGGATAATAATTTTACCATTGATACGATTAATTCATCCGTAATGCGTATTCCAAGAAGTAACGCTGATGGTAATTGTCTGACTGGATTGTTTAATGTCAGTAAAAATATT > NC_000913/1371644‑1371787 | aTTACACTTCGTCGCAGCCATAACGAGTTTCATCCGGATAATAATTTTACCATTGATACGATTAATTCATCCGCAATGCg > 2:262775/1‑80 (MQ=255) cacTTCGTCGCAGCCATAACGAGTTTCATCCGGATAATAATTTTACCATTGATACGATTAATTCATCCGCAATGCGTAtt < 2:262751/80‑1 (MQ=255) gtcgCAGCCATAACGAGTTTCATCCGGATAATAATTTTACCATTGATACGATTAATTCATCCGCAATGCGTATTCCaag > 1:262773/1‑79 (MQ=255) ccATAACGAGTTTCATCCGGATAATAATTTTACCATTGATACGATTAATTCATCCGCAATGCGTATTCCAAGAAGTAACGc < 1:262752/81‑1 (MQ=255) aTAACGAGTTTCATCCGGATAATAATTTTACCATTGATACGATTAATTCATCCGCAATGCGTATTCCAAGAAGTAACGCTg < 1:262754/81‑1 (MQ=255) aTAACGAGTTTCATCCGGATAATAATTTTACCATTGATACGATTAATTCATCCGCAATGCGTATTCCAAGAAGTAACGCTg < 2:262753/81‑1 (MQ=255) ggATAATAATTTTACCATTGATACGATTAATTCATCCGCAATGCGTATTCCAAGAAGTAACGCTGATGGTAATTGTCTGAc > 2:262776/1‑81 (MQ=255) taataaTTTTACCATTGATACGATTAATTCATCCGCAATGCGTATTCCAAGAAGTAACGCTGATGGTAATTGTCTGACTg > 1:262780/1‑80 (MQ=255) atTTTACCATTGATACGATTAATTCATCCGCAATGCGTATTCCAAGAAGTAACGCTGATGGTAATTGTCTGACTGGATTg < 1:262756/80‑1 (MQ=255) atTTTACCATTGATACGATTAATTCATCCGCAATGCGTATTCCAAGAAGTAACGCTGATGGTAATTGTCTGACTGGATTg < 2:262755/80‑1 (MQ=255) ttACCATTGATACGATTAATTCATCCGCAATGCGTATTCCAAGAAGTAACGCTGATGGTAATTGTCTGACTGGATTGttt < 2:262757/80‑1 (MQ=255) tACCATTGATACGATTAATTCATCCGCAATGCGTATTCCAAGAAGTAACGCTGATGGTAATTGTCTGACTGGATTGTTTa < 2:262758/80‑1 (MQ=255) aTACGATTAATTCATCCGCAATGCGTATTCCAAGAAGTAACGCTGATGGTAATTGTCTGACTGGATTGTTTAATGTCAGt < 1:262759/80‑1 (MQ=255) aTTAATTCATCCGCAATGCGTATTCCAAGAAGTAACGCTGATGGTAATTGTCTGACTGGATTGTTTAATGTCAGTAAAAat < 1:262760/81‑1 (MQ=255) ttAATTCATCCGCAATGCGTATTCCAAGAAGTAACGCTGATGGTAATTGTCTGACTGGATTGTTTAATGTCAGTAAAAata < 2:262761/81‑1 (MQ=255) aTTCATCCGCAATGCGTATTCCAAGAAGTAACGCTGATGGTAATTGTCTGACTGGATTGTTTAATGTCAGTAAAAATAtt < 1:262762/80‑1 (MQ=255) | ATTACACTTCGTCGCAGCCATAACGAGTTTCATCCGGATAATAATTTTACCATTGATACGATTAATTCATCCGTAATGCGTATTCCAAGAAGTAACGCTGATGGTAATTGTCTGACTGGATTGTTTAATGTCAGTAAAAATATT > NC_000913/1371644‑1371787 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |