Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,399,667 | T→C | intergenic (‑141/+54) | fnr ← / ← ogt | DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR/methylated‑DNA‑‑[protein]‑cysteine S‑methyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,399,667 | 0 | T | C | 100.0% | 32.7 / NA | 11 | intergenic (‑141/+54) | fnr/ogt | DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR/methylated‑DNA‑‑[protein]‑cysteine S‑methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (8/3); total (8/3) |
AACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCCTTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTACAGCAAAAGATAACCTTC > NC_000913/1399603‑1399741 | aaCAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCCTTAAGTTGCTAAGGGTAACTTTAc < 2:266980/80‑1 (MQ=255) aaCAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCCTTAAGTTGCTAAGGGTAACTTTACa > 2:266993/1‑81 (MQ=255) atatTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCCTTAAGTTGCTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGc > 2:266994/1‑81 (MQ=255) atTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCCTTAAGTTGCTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTg > 1:267002/1‑81 (MQ=255) atTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCCTTAAGTTGCTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTg > 1:267003/1‑81 (MQ=255) aTGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCCTTAAGTTGCTCAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGcac > 1:266999/1‑80 (MQ=255) tGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCCTTAAGTTGCTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACaa < 1:266981/81‑1 (MQ=255) tctatTTGAAAACCCTTAAGTTGCTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTa > 1:266998/1‑80 (MQ=255) aaaCCCTTAAGTTGCTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTACAGCaa > 2:266997/1‑77 (MQ=255) tAAGTTGCTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTACAGCAAAAGATAACCtt > 2:266996/1‑81 (MQ=255) aGTTGCTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTACAGCAAAAGATAACCTTc < 2:266982/80‑1 (MQ=255) | AACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCCTTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTACAGCAAAAGATAACCTTC > NC_000913/1399603‑1399741 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |