| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,588,708 | C→T | S44S (TCG→TCA) | ydeS ← | putative fimbrial protein YdeS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,588,708 | 0 | C | T | 100.0% | 65.1 / NA | 19 | S44S (TCG→TCA) | ydeS | putative fimbrial protein YdeS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (10/9); total (10/9) | |||||||||||
GGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATTTTAATAACGCTATCTGCGGATAAAGCAG > NC_000913/1588632‑1588784 | ggACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGTGAAt > 2:292653/1‑81 (MQ=255) aCGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGTGAATcc > 1:292657/1‑81 (MQ=255) ggCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGTGAATCCGa < 1:292639/81‑1 (MQ=255) tGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGTGAATCCGAt > 2:292654/1‑79 (MQ=255) aCTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGTCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGTGAATCCGATGAGAc > 1:292693/1‑81 (MQ=255) cGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGTGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCAt < 1:292640/81‑1 (MQ=255) gAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGTGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGa < 1:292641/81‑1 (MQ=255) ttGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGTGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGAcgcg > 2:292661/1‑81 (MQ=255) gCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGTGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTa < 2:292642/81‑1 (MQ=255) tttttttGGAGATCTACGGTAAAATTAAGTGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAAtttt > 2:292669/1‑80 (MQ=255) tttttGGAGATCTACGGTAAAATTAAGTGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATTTtaa < 2:292643/80‑1 (MQ=255) tttGGAGATCTACGGTAAAATTAAGTGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATTTtaata < 1:292644/80‑1 (MQ=255) tGGAGATCTACGGTAAAATTAAGTGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATTTTAATAAc < 1:292645/80‑1 (MQ=255) ggAGATCTACGGTAAAATTAAGTGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATTTTAATAACGc > 1:292663/1‑81 (MQ=255) tAAAATTAAGTGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATTTTAATAACGCTATCTGCGTAt > 2:292664/1‑80 (MQ=255) aaaTTAAGTGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATTTTAATAACGCTATCTGCGGATa > 1:292658/1‑79 (MQ=255) aaTTAAGTGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATTTTAATAACGCTATCTGCGGATAAAg > 1:292655/1‑81 (MQ=255) aTTAAGTGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATTTTAATAACGCTATCTGCGGATAAAGc < 1:292646/81‑1 (MQ=255) aaGTGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATTTTAATAACGCTATCTGCGGATAAAGCAg < 2:292647/80‑1 (MQ=255) | GGACGGCTGGACTTGTGCTACCGGTCGTTGGAAATTGTCTGGCACTGTTTTTTTGGAGATCTACGGTAAAATTAAGCGAATCCGATGAGACTGTGCAGCCATAATCGAGGACGCGCCCGCTAATTTTAATAACGCTATCTGCGGATAAAGCAG > NC_000913/1588632‑1588784 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |