| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 329,433 | A→T | intergenic (‑99/‑30) | betI ← / → betT | DNA‑binding transcriptional repressor BetI/choline:H(+) symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 329,433 | 0 | A | T | 100.0% | 61.4 / NA | 18 | intergenic (‑99/‑30) | betI/betT | DNA‑binding transcriptional repressor BetI/choline:H(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (10/8); total (10/8) | |||||||||||
GGTGTTTATCTATTAAAGCGGTTATTGATTGGACGTTCAATATAAAATGTGTCTTAATTGTTACGAATTTGATTTTAAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACAGACCTTTCACACAGCAGGGAAAAGGACAAAATCAAT > NC_000913/329357‑329504 | ggTGTTTATCTATTAAAGCGGTTATTGATTGGACGTTCAATATAAAATGTGTCTTAATTGTTACGAATTTGATTTTtaa > 1:73327/1‑79 (MQ=255)ggTGTTTATCTATTAAAGCGGTTATTGATTGGACGTTCAATATAAAATGTGTCTTAATTGTTACGAATTTGATTTTtaa > 2:73322/1‑79 (MQ=255) tttATCTATTAAAGCGGTTATTGATTGGACGTTCAATATAAAATGTGTCTTAATTGTTACGAATTTGATTTTTAATAGTa < 2:73303/80‑1 (MQ=255) tttATCTATTAAAGCGGTTATTGATTGGACGTTCAATATAAAATGTGTCTTAATTGTTACGAATTTGATTTTTAATAGTa < 1:73302/80‑1 (MQ=255) ttAAAGCGGTTATTGATTGGACGTTCAATATAAAATGTGTCTTAATTGTTACGAATTTGATTTTTAATAGTAACAATAAc < 2:73304/80‑1 (MQ=255) aaGCGGTTATTGATTGGACGTTCAATATAAAATGTGTCTTAATTGTTACGAATTTGATTTTTAATAGTAACAATAACAGTg > 2:73333/1‑81 (MQ=255) gACGTTCAATATAAAATGTGTCTTAATTGTTACGAATTTGATTTTTAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACa < 1:73305/81‑1 (MQ=255) gTTCAATATAAAATGTGTCTTAATTGTTACGAATTTGATTTTTAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACAGAc > 2:73336/1‑81 (MQ=255) aaaTGTGTCTTAATTGTTACGAATTTGATTTTTAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACAGACCTTTcacaca < 1:73306/81‑1 (MQ=255) aaTGTGTCTTAATTGTTACGAATTTGATTTTTAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACAGACCTTTCACAcag < 2:73307/81‑1 (MQ=255) aaTGTGTCTTAATTGTTACGAATTTGATTTTTAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACAGACCTTTCACAcag < 2:73308/81‑1 (MQ=255) ttGTTACGAATTTGATTTTTAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACAGACCTTTCACACAGCAGGGAAAAGGa > 2:73340/1‑81 (MQ=255) gTTACGAATTTGATTTTTAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACAGACCTTTCACACAGCAGGGAAAAGGAc > 1:73344/1‑80 (MQ=255) tACGAATTTGATTTTTAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACAGACCTTTCACACAGCAGGGAAAAGGACaa > 2:73334/1‑80 (MQ=255) aCGAATTTGATTTTTAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACAGACCTTTCACACAGCAGGGAAAAGGACaaaa > 1:73349/1‑81 (MQ=255) aCGAATTTGATTTTTAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACAGACCTTTCACACAGCAGGGAAAAGGACaaaa > 1:73337/1‑81 (MQ=255) gAATTTGATTTTTAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACAGACCTTTCACACAGCAGGGAAAAGGACAAaatc < 2:73309/81‑1 (MQ=255) aTTTGATTTTTAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACAGACCTTTCACACAGCAGGGAAAAGGACAAaatcaa > 2:73341/1‑81 (MQ=255) aTTTGATTTTTAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACAGACCTTTCACACAGCAGGGAAAAGGACAAaatcaa > 2:73351/1‑81 (MQ=255) tttGATTTTTAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACAGACCTTTCACACAGCAGGGAAAAGGACAAaatcaat > 1:73335/1‑81 (MQ=255) | GGTGTTTATCTATTAAAGCGGTTATTGATTGGACGTTCAATATAAAATGTGTCTTAATTGTTACGAATTTGATTTTAAATAGTAACAATAACAGTGGGGATACTGGATGACAGACCTTTCACACAGCAGGGAAAAGGACAAAATCAAT > NC_000913/329357‑329504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |