Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	3,354,361	G→A	intergenic (‑311/‑364)	yhcC ← / → gltB	radical SAM family oxidoreductase YhcC/glutamate synthase subunit GltB

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	3,354,361	0	G	A	100.0%	81.4 / NA	23	intergenic (‑311/‑364)	yhcC/gltB	radical SAM family oxidoreductase YhcC/glutamate synthase subunit GltB
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (9/14);  total (9/14)

TATAAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATT  >  NC_000913/3354289‑3354436                                                                         |                                                                            tataAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTtc                                                                     >  1:627196/1‑81 (MQ=255)     aaaTGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTctct                                                                  <  1:627173/80‑1 (MQ=255)      aaTGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTaa                                                                >  2:627218/1‑81 (MQ=255)       aTGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAAc                                                               <  1:627174/81‑1 (MQ=255)                 tGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCtt                                                     >  2:627193/1‑81 (MQ=255)                   tcgtcAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCtttt                                                   <  2:627175/81‑1 (MQ=255)                      tcAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGc                                                <  2:627176/81‑1 (MQ=255)                         gTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCtt                                             <  1:627177/81‑1 (MQ=255)                         gTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCt                                              >  1:627203/1‑80 (MQ=255)                              aGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGa                                        <  1:627178/81‑1 (MQ=255)                                gCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGAt                                       >  2:627202/1‑80 (MQ=255)                                gCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATa                                      <  1:627179/81‑1 (MQ=255)                                        aGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCAt                              <  1:627180/81‑1 (MQ=255)                                        aGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCAt                              >  2:627210/1‑81 (MQ=255)                                              aaCACACCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAAt                        >  1:627194/1‑81 (MQ=255)                                               acacacCTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAAt                        <  2:627181/80‑1 (MQ=255)                                                     cTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGt                  >  2:627201/1‑80 (MQ=255)                                                     cTTTATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTc                 <  2:627182/81‑1 (MQ=255)                                                        tATGACAGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCAtt              >  1:627213/1‑81 (MQ=255)                                                              aGTCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTtaataa        <  2:627183/81‑1 (MQ=255)                                                                tCAGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAg      <  1:627184/81‑1 (MQ=255)                                                                  aGGAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGa     <  1:627185/80‑1 (MQ=255)                                                                    gAATTAACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAAtt  <  2:627186/81‑1 (MQ=255)                                                                         |                                                                            TATAAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATT  >  NC_000913/3354289‑3354436

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑