| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,802,110 | G→A | L317F (CTT→TTT) | waaO ← | UDP‑D‑glucose:(glucosyl)LPS alpha‑1,3‑glucosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,802,110 | 0 | G | A | 100.0% | 47.3 / NA | 14 | L317F (CTT→TTT) | waaO | UDP‑D‑glucose:(glucosyl)LPS alpha‑1,3‑glucosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (8/6); total (8/6) | |||||||||||
CCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGC > NC_000913/3802033‑3802185 | ccAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAACa > 2:735184/1‑80 (MQ=255) ttAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAACATATGtt < 1:735174/80‑1 (MQ=255) aaTGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAACATATGTTTTg > 2:735191/1‑81 (MQ=255) aTCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAACATATGTTTTGCGCTatat > 2:735193/1‑81 (MQ=255) aaataaaaAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAACATATGTTTTGCGCTATATCTTAattgattg > 2:735192/1‑81 (MQ=255) taaaaAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAACATATGTTTTGCGCTCTATCTTAATTGATTGCTa > 1:735195/1‑81 (MQ=255) aaaaaGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAACATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTAtt < 2:735175/81‑1 (MQ=255) aGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAACATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTc < 2:735176/81‑1 (MQ=255) aGATATCTATGCTTTTTAAACATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTAttc > 2:735201/1‑81 (MQ=255) aGATATCTATGCTTTTTAAACATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTAtt < 2:735177/80‑1 (MQ=255) tGCTTTTTAAACATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCa < 2:735178/77‑1 (MQ=255) ttttAAACATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAg > 2:735179/1‑81 (MQ=255) tttAAACATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAg > 2:735205/1‑80 (MQ=255) ttAAACATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGc < 1:735180/80‑1 (MQ=255) | CCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGC > NC_000913/3802033‑3802185 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |