Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,260,908 | A→G | N104D (AAC→GAC) | yjbM → | uncharacterized protein YjbM |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,260,908 | 0 | A | G | 100.0% | 45.5 / NA | 14 | N104D (AAC→GAC) | yjbM | uncharacterized protein YjbM |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (7/7); total (7/7) |
GCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAATTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTAT > NC_000913/4260836‑4260974 | gCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACGACAGCtt < 1:852135/80‑1 (MQ=255) gCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACGACAGCtt < 2:852134/80‑1 (MQ=255) tataCATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACGACAGCTTAAAatt < 2:852136/81‑1 (MQ=255) aaGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACGACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGc > 1:852158/1‑81 (MQ=255) aGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACGACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCt < 1:852137/81‑1 (MQ=255) gCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACGACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTg < 2:852138/81‑1 (MQ=255) tGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACGACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAATTTCACt > 2:852167/1‑81 (MQ=255) ttttttAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACGACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAATTTCACttt > 2:852170/1‑80 (MQ=255) aCGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACGACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAATTTCACTTTCATATTCt < 2:852139/81‑1 (MQ=255) aCGTTTGTTAATGCATGCCAGGAACATGATGACGACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAATTTCACTTTCATATTCt < 1:852140/81‑1 (MQ=255) aTGCCTGCCAGGAACATGATGACGACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAATTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACg > 2:852163/1‑81 (MQ=255) ccAGGAACATGATGACGACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAATTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGAtt > 2:852161/1‑80 (MQ=255) aGGAACATGATGACGACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAATTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTAt > 1:852169/1‑81 (MQ=255) aaCATGATGACGACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAATTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTAt > 1:852168/1‑78 (MQ=255) | GCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAATTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTAT > NC_000913/4260836‑4260974 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |