| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 752,848 | T→C | intergenic (‑53/+337) | ybgD ← / ← gltA | putative fimbrial protein YbgD/citrate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 752,848 | 0 | T | C | 100.0% | 62.7 / NA | 18 | intergenic (‑53/+337) | ybgD/gltA | putative fimbrial protein YbgD/citrate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (3/15); total (3/15) | |||||||||||
GCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATT > NC_000913/752770‑752920 | gCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGCAt < 1:158704/81‑1 (MQ=255) cAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGCAttt < 2:158705/81‑1 (MQ=255) aaTGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGCATTTg < 2:158706/81‑1 (MQ=255) tGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGCATTTGat < 1:158707/81‑1 (MQ=255) tttGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGCATTTGattatt < 2:158708/80‑1 (MQ=255) aCATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGCATTTGATTATTGCtagtttttagt < 1:158709/81‑1 (MQ=255) aaCAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGCATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTg > 2:158730/1‑81 (MQ=255) gagTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGCATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTa < 1:158710/81‑1 (MQ=255) tataGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGCATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGt < 1:158711/81‑1 (MQ=255) taGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGCATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGttt < 2:158712/81‑1 (MQ=255) taGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGCATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGttt < 2:158714/81‑1 (MQ=255) taGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGCATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGtt < 2:158713/80‑1 (MQ=255) gAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGCATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGtttt < 2:158715/80‑1 (MQ=255) tataGCTACGCCAGAATATCGCATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGc > 1:158728/1‑80 (MQ=255) taGCTACGCCAGAATATCGCATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCaa < 2:158716/80‑1 (MQ=255) aCGCCAGAATATCGCATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTa > 1:158731/1‑80 (MQ=255) cGCCAGAATATCGCATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTa < 1:158717/79‑1 (MQ=255) gAATATCGCATTTGATTATTGCTGGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAattatt < 1:158718/81‑1 (MQ=255) | GCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATT > NC_000913/752770‑752920 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |