| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,192,383 | A→G | intergenic (‑161/+132) | yehD ← / ← yehE | putative fimbrial protein YehD/DUF2574 domain‑containing protein YehE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,192,383 | 0 | A | G | 100.0% | 40.0 / NA | 12 | intergenic (‑161/+132) | yehD/yehE | putative fimbrial protein YehD/DUF2574 domain‑containing protein YehE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (8/4); total (8/4) | |||||||||||
TAAACACATTGTTTTATTGATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATGTAAATGGTATTGTTGATATCAATAAAAAAGCC > NC_000913/2192313‑2192455 | tAAACACATTGTTTTATTGATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTGTTAACTAtt > 1:398402/1‑80 (MQ=255) aTTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTGTTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAAt < 2:398389/81‑1 (MQ=255) aaaCAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTGTTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATg > 1:398418/1‑77 (MQ=255) aaCAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTGTTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGAt > 2:398405/1‑81 (MQ=255) aCAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTGTTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGAtt > 1:398403/1‑81 (MQ=255) ttAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTGTTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATg > 2:398411/1‑80 (MQ=255) aaCCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTGTTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATGTa > 2:398407/1‑80 (MQ=255) ttGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTGTTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATGTAAATGGt < 1:398390/81‑1 (MQ=255) cAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTGTTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATGTAAATGGTAtt < 2:398391/81‑1 (MQ=255) aaTATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTGTTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATGTAAATGGTAttg > 1:398404/1‑81 (MQ=255) ttAAGAGTGTTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATGTAAATGGTATTGTTGATATCAATAAAAAAGcc > 1:398427/1‑81 (MQ=255) tAAGAGTGTTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATGTAAATGGTATTGTTGATATCAATAAAAAAGcc < 1:398392/80‑1 (MQ=255) | TAAACACATTGTTTTATTGATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATGTAAATGGTATTGTTGATATCAATAAAAAAGCC > NC_000913/2192313‑2192455 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |