Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	251,954	T→C	intergenic (+1/‑51)	dinB → / → yafN	DNA polymerase IV/antitoxin YafN

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	251,954	0	T	C	100.0%	75.8 / NA	22	intergenic (+1/‑51)	dinB/yafN	DNA polymerase IV/antitoxin YafN
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (8/14);  total (8/14)

CGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATC  >  NC_000913/251878‑252030                                                                             |                                                                             cgGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGACGta                                                                           >  1:55119/1‑80 (MQ=255)    tgtgCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACt                                                                       <  1:55089/81‑1 (MQ=255)             ggtggGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGta                                                               >  2:55120/1‑80 (MQ=255)              gtggGGCTGAATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGt                                                                <  1:55090/78‑1 (MQ=255)               tggGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTatat                                                            <  2:55091/81‑1 (MQ=255)                       cATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGgtgt                                                    <  2:55092/81‑1 (MQ=255)                       cATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGgt                                                      <  1:55093/79‑1 (MQ=255)                         tgtgACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGGtgtg                                                   >  2:55138/1‑80 (MQ=255)                                  gCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATtattat                                          <  1:55094/80‑1 (MQ=255)                                       aCCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGt                                    <  1:55095/81‑1 (MQ=255)                                        cccGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTa                                   <  2:55096/81‑1 (MQ=255)                                        cccGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTa                                   >  2:55128/1‑81 (MQ=255)                                            cAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCAc                               <  2:55097/81‑1 (MQ=255)                                               aTGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGGTGCGCATTATTATGAGGGTATCACTg                             >  1:55124/1‑80 (MQ=255)                                                 ggAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTAt                          >  1:55137/1‑81 (MQ=255)                                                      gACAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATc                     >  1:55131/1‑81 (MQ=255)                                                       aCAACTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCg                    <  2:55098/81‑1 (MQ=255)                                                           cTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCGAAtt                <  2:55099/81‑1 (MQ=255)                                                           cTGGTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCGAAtt                <  1:245689/81‑1 (MQ=255)                                                              gTGCTGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCGAATtct              <  1:55100/80‑1 (MQ=255)                                                                  tGGGATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCGAATTCTCGCt          >  1:55125/1‑80 (MQ=255)                                                                    ggATTATGACGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGa        <  2:55101/80‑1 (MQ=255)                                                                         atgacgTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATc  >  2:55129/1‑81 (MQ=255)                                                                             |                                                                             CGGTGTGCGTCTGGTGGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATC  >  NC_000913/251878‑252030

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑