| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,665,991 | A→G | intergenic (‑181/+189) | gadX ← / ← gadA | DNA‑binding transcriptional dual regulator GadX/glutamate decarboxylase A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,665,991 | 0 | A | G | 100.0% | 60.5 / NA | 18 | intergenic (‑181/+189) | gadX/gadA | DNA‑binding transcriptional dual regulator GadX/glutamate decarboxylase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (4/14); total (4/14) | |||||||||||
AGGATGATAATGTGTGATGTTCTACGGGCAGGATGACTGGATTTATAATACAAAAACGTGTTTAAGAACACAGGGAAATTAATAGTAAGCAAATAATCCCTTTTCGTGACATTAAAGGTAATCGCTACATTTAATAAACATTCATATAACATAT > NC_000913/3665914‑3666067 | aGGATGATAATGTGTGATGTTCTACGGGCAGGATGACTGGATTTATAATACAAAAACGTGTTTAAGAACACAGGGAAGTTa < 2:707933/81‑1 (MQ=255) atAATGTGTGATGTTCTACGGGCAGGATGACTGGATTTATAATACAAAAACGTGTTTAAGAACACAGGGAAGTTAATAGt < 1:707934/80‑1 (MQ=255) tAATGTGTGATGTTCTACGGGCAGGATGACTGGATTTATAATACAAAAACGTGTTTAAGAACACAGGGAAGTTAATAGTaa < 2:707935/81‑1 (MQ=255) tgtgATGTTCTACGGGCAGGATGACTGGATTTATAATACAAAAACGTGTTTAAGAACACAGGGAAGTTAATAGTAAGCaa < 2:707936/80‑1 (MQ=255) cTACGGGCAGGATGACTGGATTTATAATACAAAAACGTGTTTAAGAACACAGGGAAGTTAATAGTAAGCAAATAATCCCt < 2:707938/80‑1 (MQ=255) cTACGGGCAGGATGACTGGATTTATAATACAAAAACGTGTTTAAGAACACAGGGAAGTTAATAGTAAGCAAATAATCCCt < 2:707937/80‑1 (MQ=255) aGGATGACTGGATTTATAATACAAAAACGTGTTTAAGAACACAGGGAAGTTAATAGTAAGCAAATAATCCCTTTTCGTGa > 1:707955/1‑80 (MQ=255) gATGACTGGATTTATAATACAAAAACGTGTTTAAGAACACAGGGAAGTTAATAGTAAGCAAATAATCCCTTTTCGTGACAt < 2:707939/81‑1 (MQ=255) gATGACTGGATTTATAATACAAAAACGTGTTTAAGAACACAGGGAAGTTAATAGTAAGCAAATAATCCCTTTTCGTGACAt > 1:707956/1‑81 (MQ=255) aCTGGATTTATAATACAAAAACGTGTTTAAGAACACAGGGAAGTTAATAGTAAGCAAATAATCCCTTTTCGTGACATTaaa < 1:707940/81‑1 (MQ=255) gATTTATAATACAAAAACGTGTTTAAGAACACAGGGAAGTTAATAGTAAGCAAATAATCCCTTTTCGTGACATTAAAGGTa < 1:707941/81‑1 (MQ=255) tataATACAAAAACGTGTTTAAGAACACAGGGAAGTTAATAGTAAGCAAATAATCCCTTTTCGTGACATTAAAGGTAATc < 2:707942/80‑1 (MQ=255) cAAAAACGTGTTTAAGAACACAGGGAAGTTAATAGTAAGCAAATAATCCCTTTTCGTGACATTAAAGGTAATCGCTACAt < 2:707943/80‑1 (MQ=255) aaaaaCGTGTTTAAGAACACAGGGAAGTTAATAGTAAGCAAATAATCCCTTTTCGTGACATTAAAGGTAATCGCTACAtt > 2:707957/1‑80 (MQ=255) aaCGTGTTTAAGAACACAGGGAAGTTAATAGTAAGCAAATAATCCCTTTTCGTGACATTAAAGGTAATCGCTACATTtaa > 1:707959/1‑80 (MQ=255) gAACACAGGGAAGTTAATAGTAAGCAAATAATCCCTTTTCGTGACATTAAAGGTAATCGCTACATTTAATAAACATTCata < 2:707944/81‑1 (MQ=255) gggAAGTTAATAGTAAGCAAATAATCCCTTTTCGTGACATTAAAGGTAATCGCTACATTTAATAAACATTCATATAACata < 2:707945/81‑1 (MQ=255) ggAAGTTAATAGTAAGCAAATAATCCCTTTTCGTGACATTAAAGGTAATCGCTACATTTAATAAACATTCATATAACatat < 1:707946/81‑1 (MQ=255) | AGGATGATAATGTGTGATGTTCTACGGGCAGGATGACTGGATTTATAATACAAAAACGTGTTTAAGAACACAGGGAAATTAATAGTAAGCAAATAATCCCTTTTCGTGACATTAAAGGTAATCGCTACATTTAATAAACATTCATATAACATAT > NC_000913/3665914‑3666067 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |