| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 385,106 | T→C | intergenic (‑490/‑126) | yaiS ← / → tauA | putative deacetylase YaiS/taurine ABC transporter periplasmic binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 385,106 | 0 | T | C | 100.0% | 50.6 / NA | 15 | intergenic (‑490/‑126) | yaiS/tauA | putative deacetylase YaiS/taurine ABC transporter periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (11/4); total (11/4) | |||||||||||
GTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATG > NC_000913/385031‑385181 | gTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGCACGGAGTAATTGCATACTTa < 1:82352/79‑1 (MQ=255)gTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATActt < 1:82353/78‑1 (MQ=255) aaTGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATACTTAATCt > 2:82374/1‑81 (MQ=255) tgtgGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATACTTAATCttt > 2:82364/1‑81 (MQ=255) cATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATACTTAATCTTTCCTTAGCCGttttt < 1:82354/81‑1 (MQ=255) cATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATACTTAATCTTTCCTTAGCCGtttt < 2:82355/80‑1 (MQ=255) aaTGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATACTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAg > 1:82365/1‑80 (MQ=255) aTGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATACTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGaa > 1:82371/1‑81 (MQ=255) gtaATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATACTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAatcatc > 2:82369/1‑81 (MQ=255) ttCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATACTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGc > 2:82380/1‑80 (MQ=255) ccAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATACTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGAt < 2:82356/80‑1 (MQ=255) cAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATACTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATaa > 1:82377/1‑81 (MQ=255) ttGTTAGAACGGAGTAATTGCATACTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGa > 1:82370/1‑81 (MQ=255) aaTTGCATACTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTaat > 1:82378/1‑80 (MQ=255) gCATACTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTaatgaatg > 1:82372/1‑81 (MQ=255) gCATACTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTaatgaatg > 2:82389/1‑81 (MQ=255) | GTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATG > NC_000913/385031‑385181 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |