| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,603,273 | C→T | intergenic (‑415/‑204) | yjjP ← / → yjjQ | putative succinate exporter YjjP/DNA‑binding transcriptional repressor YjjQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,603,273 | 0 | C | T | 100.0% | 62.0 / NA | 18 | intergenic (‑415/‑204) | yjjP/yjjQ | putative succinate exporter YjjP/DNA‑binding transcriptional repressor YjjQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (10/8); total (10/8) | |||||||||||
TTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAG > NC_000913/4603206‑4603348 | ttaaatGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTTTCCAGGCTactgg > 2:26964/1‑77 (MQ=255) atgaatgTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTTTCCAGGCTATTTCAc > 2:926774/1‑79 (MQ=255) aatgTGATTTCTGTTTTTCGTTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGt > 2:926772/1‑81 (MQ=255) aatgTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGt < 2:926749/81‑1 (MQ=255) atgTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGtt < 2:926750/81‑1 (MQ=255) cTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGa > 2:926767/1‑81 (MQ=255) aTTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCt > 2:926765/1‑81 (MQ=255) aaGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCt > 2:926770/1‑81 (MQ=255) caacTTAATGTAGATATTTTAAATGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGt < 1:926751/81‑1 (MQ=255) aacTTAATGTAGATATTTTAAATGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTg < 2:926752/81‑1 (MQ=255) ttAATGTAGATATTTTAAATGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAg > 2:926766/1‑81 (MQ=255) gTAGATATTTTAAATGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAgttgtt > 1:926771/1‑81 (MQ=255) gTAGATATTTTAAATGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAgttgtt > 1:926778/1‑81 (MQ=255) aGATATTTTAAATGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTtgttgt > 1:926769/1‑81 (MQ=255) ttttAAATGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTgcagc < 2:926754/81‑1 (MQ=255) ttttAAATGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTgcag < 2:926753/80‑1 (MQ=255) aaTGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAg < 2:926755/81‑1 (MQ=255) aaTGTTTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAg < 1:926756/81‑1 (MQ=255) | TTAAATGAATGTGATTTCTGTTTTTCATTAAGTATTCCTAACAACTTAATGTAGATATTTTAAATGTCTCCAGGCTATTTCACCAGGTTATCATTTGATGCTAACCTTCTGACACATGCAGTGGAGTTGTTGTGCAGCAGGAG > NC_000913/4603206‑4603348 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |