| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 960,227 | A→G | intergenic (+132/‑37) | aroA → / → ycaL | 3‑phosphoshikimate 1‑carboxyvinyltransferase/periplasmic protease YcaL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 960,227 | 0 | A | G | 100.0% | 47.6 / NA | 14 | intergenic (+132/‑37) | aroA/ycaL | 3‑phosphoshikimate 1‑carboxyvinyltransferase/periplasmic protease YcaL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (8/6); total (8/6) | |||||||||||
GTCGGCGTTTTTTTTCGGACCTTGTGAGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACATAATATTTATATATGATTAATCAACGGATGATTCACATGAAGAATACTAAATTACTGCTGGCGATTGCGACCTC > NC_000913/960151‑960301 | gTCGGCGTTTTTTTTCGGACCTTGTGAGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACgtaa > 1:193183/1‑80 (MQ=255) tCGGCGTTTTTTTTCGGACCTTGTGAGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACgtaata > 2:193186/1‑81 (MQ=255) tCGGCGTTTTTTTTCGGACCTTGTGAGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACgtaat < 1:193159/80‑1 (MQ=255) cGGCGTTTTTTTTCGGACCTTGTGAGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACGTAatat > 1:193184/1‑81 (MQ=255) gTTTTTTTTCGGACCTTGTGAGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACGTAATATTta > 1:193179/1‑80 (MQ=255) gtgAGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACGTAATATTTATATATGATTAATCAACg > 2:193182/1‑80 (MQ=255) gAGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACGTAATATTTATATATGATTAATCAACGgat > 2:193185/1‑81 (MQ=255) aGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACGTAATATTTATATATGATTAATCAACGgatg < 1:193160/81‑1 (MQ=255) ttGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACGTAATATTTATATATGATTAATCAACGGATGATTcac < 1:193161/80‑1 (MQ=255) gTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACGTAATATTTATATATGATTAATCAACGGATGATTCACATGAAGAATAc > 1:193188/1‑81 (MQ=255) aGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACGTAATATTTATATATGATTAATCAACGGATGATTCACATGAAGAATACt > 1:193189/1‑80 (MQ=255) gCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACGTAATATTTATATATGATTAATCAACGGATGATTCACATGAAGAATACTAAATTAc > 1:193178/1‑81 (MQ=255) cTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACGTAATATTTATATATGATTAATCAACGGATGATTCACATGAAGAATACTAAATTAct < 1:193162/81‑1 (MQ=255) tCAATGTAAGTTGTTGATACGTAATATTTATATATGATTAATCAACGGATGATTCACATGAAGAATACTAAATTActgct < 2:193163/80‑1 (MQ=255) tAAGTTGTTGATACGTAATATTTATATATGATTAATCAACGGATGATTCACATGAAGAATACTAAATTACTGCTGGCGAtt < 2:193164/81‑1 (MQ=255) gttgttGATACGTAATATTTATATATGATTAATCAACGGATGATTCACATGAAGAATACTAAATTACTGCTGGCGATTGc > 2:193193/1‑80 (MQ=255) gATACGTAATATTTATATATGATTAATCAACGGATGATTCACATGAAGAATACTAAATTACTGCTGGCGATTGCGACctc < 1:193165/80‑1 (MQ=255) | GTCGGCGTTTTTTTTCGGACCTTGTGAGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACATAATATTTATATATGATTAATCAACGGATGATTCACATGAAGAATACTAAATTACTGCTGGCGATTGCGACCTC > NC_000913/960151‑960301 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |