| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,166,055 | C→T | intergenic (+370/‑30) | ycfP → / → ndh | UPF0227 protein YcfP/NADH:quinone oxidoreductase II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,166,055 | 0 | C | T | 100.0% | 69.9 / NA | 20 | intergenic (+370/‑30) | ycfP/ndh | UPF0227 protein YcfP/NADH:quinone oxidoreductase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (10/10); total (10/10) | |||||||||||
ATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTGAAAAAGATTGTGATTGTCGGCGGCGGTGCTGGT > NC_000913/1165979‑1166132 | aTTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAAtt > 2:230148/1‑81 (MQ=255)aTTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAAtt > 1:230141/1‑81 (MQ=255) ttCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAATTg < 2:230121/81‑1 (MQ=255) aaTAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAATTGGTtaa > 2:230149/1‑81 (MQ=255) aTAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTATTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAATTGGTtaat < 2:230122/81‑1 (MQ=255) tAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAATTGGTtaat > 1:230139/1‑80 (MQ=255) aGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAATTGGTtaata > 1:230138/1‑80 (MQ=255) gCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAATTGGTTAATaaa < 2:230123/81‑1 (MQ=255) aagaaCATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAATTGGTTAATAAAttt < 1:230124/81‑1 (MQ=255) aagaaCATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAATTGGTTAATAAAtt > 2:230142/1‑80 (MQ=255) agaaCATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAATTGGTTAATAAATTTa < 1:230125/81‑1 (MQ=255) cATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAATTGGTTAATAAATTTAAggg > 1:230156/1‑81 (MQ=255) gCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGtt < 1:230126/80‑1 (MQ=255) aCCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTAc < 2:230127/80‑1 (MQ=255) gttAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTg < 2:230128/80‑1 (MQ=255) taaGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAATAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTGaaa > 2:230137/1‑77 (MQ=255) tGTTAATAACCATTAATTAATAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTGAAAAAgattgtgat < 1:230129/79‑1 (MQ=255) aataaCCATTAATTAATAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTGAAAAAGATTGTGATTGTcg < 2:230130/80‑1 (MQ=255) aCCATTAATTAATAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTGAAAAAGATTGTGATTGTcggcggc > 2:230151/1‑81 (MQ=255) aattaaTAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTGAAAAAGATTGTGATTGTCGGCGGCGGTGCt > 1:230150/1‑81 (MQ=255) taataaTTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTGAAAAAGATTGTGATTGTCGGCGGCGGTGCtggt > 1:230155/1‑81 (MQ=255) | ATTCTCAATAGCGAAGAACATTTTCATTGCTGTAACCTGTTGTTAATTAAGAGCTATGTTAATAACCATTAATTAACAATTGGTTAATAAATTTAAGGGGGTCACGTTGACTACGCCATTGAAAAAGATTGTGATTGTCGGCGGCGGTGCTGGT > NC_000913/1165979‑1166132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |