| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,475,586 | C→T | P148L (CCG→CTG) | ydbD → | DUF2773 domain‑containing protein YdbD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,475,586 | 0 | C | T | 100.0% | 62.0 / NA | 18 | P148L (CCG→CTG) | ydbD | DUF2773 domain‑containing protein YdbD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (6/12); total (6/12) | |||||||||||
GGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCT > NC_000913/1475512‑1475659 | ggATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCTGTCTAc < 1:281074/81‑1 (MQ=255) accacTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCTGTCTACGATTa < 1:281075/80‑1 (MQ=255) aaTTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCTGTCTACGATTAAGGGGAGTa < 1:281076/80‑1 (MQ=255) aaTTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCTGTCTACGATTAAGGGGAGTAt > 2:281098/1‑81 (MQ=255) ccGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCTGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAAt < 2:281077/80‑1 (MQ=255) cGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCTGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATgc < 1:281078/81‑1 (MQ=255) gATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCTGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTgg > 2:281105/1‑81 (MQ=255) aaaTGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCTGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGa > 1:281099/1‑80 (MQ=255) aaTGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCTGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGat < 1:281079/80‑1 (MQ=255) aGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCTGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATc < 2:281080/81‑1 (MQ=255) gTATTTATCGACTCATATTACGATAATCTGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACa < 2:281083/79‑1 (MQ=255) gTATTTATCGACTCATATTACGATAATCTGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACAt < 2:281081/80‑1 (MQ=255) gTATTTATCGACTCATATTACGATAATCTGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATa < 1:281082/81‑1 (MQ=255) tCGACTCATATTACGATAATCTGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCAc > 2:281107/1‑81 (MQ=255) tatTACGATAATCTGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTgttgtt < 1:281084/81‑1 (MQ=255) aCGATAATCTGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGt > 1:281102/1‑81 (MQ=255) gATAATCTGTCTACGATTAAGTGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCt < 2:281085/81‑1 (MQ=255) gATAATCTGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCt > 1:281103/1‑81 (MQ=255) | GGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCT > NC_000913/1475512‑1475659 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |