| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,904,697 | T→C | F268S (TTC→TCC) | manZ → | mannose‑specific PTS enzyme IID component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,904,697 | 0 | T | C | 100.0% | 66.3 / NA | 20 | F268S (TTC→TCC) | manZ | mannose‑specific PTS enzyme IID component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (10/10); total (10/10) | |||||||||||
TGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTTCTTCGTCATCGGTATCGCTGGTTACGCTTGCGGCCTGCTGGGACTGTAAGACTGTTGTACACTACCGGGGCCTTTT > NC_000913/1904619‑1904773 | tGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGctcct > 1:325308/1‑81 (MQ=255) gTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCtccttc > 1:325319/1‑81 (MQ=255) aCCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGt > 2:325324/1‑81 (MQ=255) ccACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTc < 1:325297/81‑1 (MQ=255) ctgACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTCATCGGTAt < 1:325298/80‑1 (MQ=255) ctgACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTCATCGGTAt < 2:325299/80‑1 (MQ=255) aCCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTCATCGGTATCGCt < 2:325300/81‑1 (MQ=255) aCCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTCATCGGTATCGCt < 1:325301/81‑1 (MQ=255) tGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTCATCGGTATCGCTGGt < 2:325302/79‑1 (MQ=255) tgtgGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTCATCGGTATCGCTGGTTACGCTTGCg < 2:325303/81‑1 (MQ=255) gCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTCATCGGTATCGCTGGTTACGCTTGCGGCct > 1:325333/1‑81 (MQ=255) cTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTCATCGGTATCGCTGGTTACGCTTGCGGCctgc < 2:325304/79‑1 (MQ=255) caaaaGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTCTTCGGTATCGCTGGTTACGCTTGCGGCCTGCTGGGACTGt > 2:325327/2‑81 (MQ=255) aaGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTCATCGGTATCGCTGGTTACGCTTGCGGCCTGCTGGGACTGTAAg < 1:325305/81‑1 (MQ=255) aaGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTCATCGGTATCGCTGGTTACGCTTGCGGCCTGCTGGGACTGTAAg < 2:325306/81‑1 (MQ=255) tAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTCATCGGTATCGCTGGTTACGCTTGCGGCCTGCTGGGACTGTAAGACtg > 1:325328/1‑81 (MQ=255) aCCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTCATCGGTATCGCTGGTTACGCTTGCGGCCTGCTGGGACTGTAAGACtgtt > 1:325329/1‑81 (MQ=255) cTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTCATCGGTATCGCTGGTTACGCTTGCGGCCTGCTGGGACTGTAAGACTGTTGTaca > 2:325322/1‑81 (MQ=255) cTGTGGATCATCGTTGGCTCCTTCGTCATCGGTATCGCTGGTTACGCTTGCGGCCTGCTGGGACTGTAAGACTGTTGTaca > 2:325326/1‑81 (MQ=255) atcatcGTTGGCTCCTTCGTCATCGGTATCGCTGGTTACGCTTGCGGCCTGCTGGGACTGTAAGACTGTTGTACACTACCg > 2:325332/1‑81 (MQ=255) tGGCTCCTTCGTCATCGGTATCGCTGGTTACGCTTGCGGCCTGCTGGGACTGTAAGACTGTTGTACACTACCGGGGCCttt > 1:325342/1‑81 (MQ=255) ggCTCCTTCGTCATCGGTATCGCTGGTTACGCTTGCGGCCTGCTGGGACTGTAAGACTGTTGTACACTACCGGGGCCtttt > 2:325331/1‑81 (MQ=255) | TGGTACCACTGCTGCTGACCTTTGCTTGTATGTGGCTACTGCGCAAAAAAGTTAACCCGCTGTGGATCATCGTTGGCTTCTTCGTCATCGGTATCGCTGGTTACGCTTGCGGCCTGCTGGGACTGTAAGACTGTTGTACACTACCGGGGCCTTTT > NC_000913/1904619‑1904773 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |