| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,374,944 | G→A | V26M (GTG→ATG) | dcuD → | putative transporter DcuD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,374,944 | 0 | G | A | 100.0% | 56.6 / NA | 17 | V26M (GTG→ATG) | dcuD | putative transporter DcuD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (9/8); total (9/8) | |||||||||||
CAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGGTGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCGGTGTCTGGTTAGGGTTCGGTGGTGTACTCGATCC > NC_000913/3374867‑3375017 | caaTGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAgatgg > 2:594386/1‑81 (MQ=255) gTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGATGGTgct > 2:594396/1‑81 (MQ=255) cGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGATGGTgctgg < 1:594363/80‑1 (MQ=255) aTTATATCTGTCATCGTATTAACTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGATGGTGCTGGCTGCCGCa < 1:594364/81‑1 (MQ=255) atatCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGATGGTGCTGGCTGCCGCAgg > 2:594391/1‑80 (MQ=255) cATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGATGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCt > 1:594389/1‑81 (MQ=255) attaattaCGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGATGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTgatgat > 2:594387/1‑81 (MQ=255) attaCTATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGATGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGc > 1:594398/1‑81 (MQ=255) taCGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGATGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCgg > 1:594385/1‑81 (MQ=255) aTGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGATGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCGGTGTc < 1:594365/81‑1 (MQ=255) gATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGATGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCGGTGTCTGGTTAGGGtt > 1:594381/1‑81 (MQ=255) gATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGATGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCGGTGTCTGGTTAGGGt < 1:594366/80‑1 (MQ=255) aTCCTGAAAAACTACAAACCTCAGATGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCGGTGTCTGGTTAGGGtt < 2:594367/80‑1 (MQ=255) cTGAAAAACTACAAACCTCAGATGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCGGTGTCTGGTTAGGGTTCggt > 2:594392/1‑81 (MQ=255) aaaaaCTACAAACCTCAGATGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCGGTGTCTGGTTAGGGTTCggtggt > 1:594393/1‑81 (MQ=255) cAAACCTCAGATGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCGGTGTCTGGTTAGGGTTCGGTGGTGTACTc < 1:594368/79‑1 (MQ=255) cAAACCTCAGATGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCGGTGTCTGGTTAGGGTTCGGTGGTGTACTc < 1:594369/79‑1 (MQ=255) aCCTCAGATGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCGGTGTCTGGTTAGGGTTCGGTGGTGTACTCGATcc < 2:594370/81‑1 (MQ=255) | CAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGGTGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCGGTGTCTGGTTAGGGTTCGGTGGTGTACTCGATCC > NC_000913/3374867‑3375017 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |