New junction evidence
		seq id	position	reads (cov)	reads (cov)	score	skew	freq	annotation	gene	product
*	?	NC_000913	= 1428264	NA (NA)	36 (0.250)	10/288	17.0	77.3%	noncoding (531/1196 nt)	IS5	repeat region
	?	NC_000913	= 2066866	11 (0.070)					noncoding (488/1195 nt)	IS5	repeat region
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.

GGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTG  >  NC_000913/2066716‑2066874                                                                                                                                                       |         ggTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAg          >  1:1142356/1‑151 (MQ=32)  gTCAGGCNGCTCTTGGCATCGACAGCAGTGTGGGCCTTCATGCCATAGTGCCACTGATTGGCTTTCTTGGTCTGATGCATCTGCGGCTCGCGTTGCTGCTCTTTGTTATTGGTCGCGGTTGGTGCCCAAATGATGAGGGCATCGGCCAAgg         <  2:2150326/151‑1 (MQ=11)  gTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAgg         <  1:1177716/151‑1 (MQ=32)  gTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAgg         <  2:1585977/151‑1 (MQ=32)  gTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGGGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCCCTTTGGTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAgg         >  2:2361883/1‑151 (MQ=9)    cAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCAATATTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTg       <  1:836752/151‑1 (MQ=12)      ggCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTTGAGCTGCGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGGCCAAGGTggc     >  2:1481400/1‑149 (MQ=9)      ggCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGcc     >  1:2250241/1‑151 (MQ=31)      ggCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGcc     >  2:1842356/1‑151 (MQ=31)      ggCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTCTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGcc     >  2:2280746/1‑151 (MQ=14)      ggCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGGGCCACTGATGGCCTTTCGTGGTCTGGTTGATCTCCGTGGCGGTGTTCTTCTCTGTGGGCTGGGGCTGGCTGGTGGCCGCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGcc     >  1:1695029/1‑151 (MQ=2)         cGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTg  <  1:443239/151‑1 (MQ=31)                                                                                                                                                       |         GGTCAGGCCGCTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCGACCAAGGTGCCTTG  >  NC_000913/2066716‑2066874

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.