| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 421,154 | Δ1 bp | 5.3% | intergenic (+11/+7) | PP_0347 → / ← PP_0348 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 421,154 | 0 | T | . | 5.3% | 304.1 / 10.3 | 95 | intergenic (+11/+7) | PP_0347/PP_0348 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (44/46); new base . (3/2); total (47/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.85e-01 | |||||||||||
CATGTGCCAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTGGCAACGGCAATC > NC_002947/421008‑421302 | cATGTGCCAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTcc > 3:304059/1‑149 (MQ=255)cATGTGCCAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTcc > 4:360487/1‑149 (MQ=255) aTGTGCCAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCg < 6:176015/149‑1 (MQ=255) aTGTGCCAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCg < 4:79096/149‑1 (MQ=255) aTGTGCCAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCg < 4:272284/149‑1 (MQ=255) ccAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGt < 4:31014/148‑1 (MQ=255) cAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGt > 6:241028/1‑147 (MQ=255) cAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGt > 3:308280/1‑147 (MQ=255) cAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACGGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTcc > 5:287811/1‑148 (MQ=255) gCACGCCACCCATCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGt < 7:104956/149‑1 (MQ=255) aCGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTgg > 1:382836/1‑149 (MQ=255) aCCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGc < 2:204663/135‑1 (MQ=255) aCCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGc > 1:204663/1‑135 (MQ=255) aCCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCcgg > 4:195993/1‑149 (MQ=255) aCCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCcgg < 4:287004/149‑1 (MQ=255) aCCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCcgg < 4:323608/149‑1 (MQ=255) cccAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCt < 3:336949/135‑1 (MQ=255) cccAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCt > 4:336949/1‑135 (MQ=255) ccAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCcggcg > 3:9183/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCcggcg < 5:386832/149‑1 (MQ=255) cagctcagctTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCcggcgg > 6:303554/1‑149 (MQ=255) agctcagctTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCggt > 6:236610/1‑149 (MQ=255) tcagctTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCTGGCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTg > 1:282557/1‑137 (MQ=255) tcagctTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTg < 2:282557/136‑1 (MQ=255) tCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCt > 1:77074/1‑149 (MQ=255) cGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCt < 1:78767/148‑1 (MQ=255) cccGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTgg > 3:254762/1‑147 (MQ=255) cccGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCa < 1:136468/149‑1 (MQ=255) cGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAgt < 4:308280/149‑1 (MQ=255) cGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAgt < 7:327416/149‑1 (MQ=255) ccTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTc < 4:156667/149‑1 (MQ=255) ccTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTc > 1:153577/1‑149 (MQ=255) tGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCATCTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGc < 1:391529/148‑1 (MQ=255) cccGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAg > 8:315922/1‑149 (MQ=255) cccGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGC‑CCACTGACAGCGGAGCcggcg > 6:205702/1‑123 (MQ=255) cccGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGC‑CCACTGACAGCGGAGCcggcg < 5:205702/123‑1 (MQ=255) tGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCAc < 7:83425/149‑1 (MQ=255) aCCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCAct < 7:350464/148‑1 (MQ=255) ccGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCActgc > 5:253826/1‑149 (MQ=255) cGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCActgct < 8:157746/149‑1 (MQ=255) cACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTgcgc < 2:153577/149‑1 (MQ=255) aCGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGAGCTGCCAGGGACAGCCAGGCACTGATGcccc > 6:84785/1‑149 (MQ=255) aCGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGACCGCCGGC‑CCACTGACAGCGGAGCcggcggc < 3:138122/112‑2 (MQ=37) aCGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGACCGCCGGC‑CCACTGACAGCGGAGCcggcggc > 4:138122/1‑111 (MQ=37) ct‑gcGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCGGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGGCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCcctgcct < 2:339426/148‑1 (MQ=255) t‑gcGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTgg > 1:246130/1‑149 (MQ=255) gcgcAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGc < 7:315922/149‑1 (MQ=255) aaCTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGccagt < 2:146830/149‑5 (MQ=255) cTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCAGCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGGCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAAcgc < 4:254762/149‑1 (MQ=255) tGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAAcgcg > 4:15158/1‑149 (MQ=255) ccACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTAt > 4:124728/1‑148 (MQ=255) cACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCa < 4:9183/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGc > 2:183738/1‑149 (MQ=255) cAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACt > 1:258337/1‑149 (MQ=255) aGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGACTGGCTGACActgcca > 6:378783/1‑115 (MQ=255) aGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGACTGGCTGACActgcca < 5:378783/117‑3 (MQ=255) ccTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCg > 1:361754/1‑149 (MQ=255) gCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCGGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGttt < 7:136073/148‑1 (MQ=255) gCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGtttt > 1:79882/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCg > 1:370411/1‑149 (MQ=255) tCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGt > 2:151802/1‑149 (MQ=255) tCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGt > 3:136506/1‑149 (MQ=255) aGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTTGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTgg < 2:387909/149‑1 (MQ=255) gCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGgc > 8:141195/1‑149 (MQ=255) gCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGgc < 1:183738/149‑1 (MQ=255) tGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCgcagc > 2:387058/1‑149 (MQ=255) 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4:362826/1‑149 (MQ=255) gCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGca > 3:194557/1‑149 (MQ=255) ccAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGcac > 8:111531/1‑149 (MQ=255) ccAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGcac < 2:382836/149‑1 (MQ=255) cAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGcacc > 8:53296/1‑149 (MQ=255) cAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGcacc > 2:41561/1‑149 (MQ=255) cAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGcac > 4:147304/1‑148 (MQ=255) aaaaCTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGcacca > 8:128097/1‑149 (MQ=255) aaaaCTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGACGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGcacca > 6:415376/1‑149 (MQ=255) gTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACcgcg < 6:287811/147‑1 (MQ=255) gTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGc < 3:362826/149‑1 (MQ=255) tCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCg > 5:360153/1‑149 (MQ=255) gACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGt < 2:258337/148‑1 (MQ=255) gACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCACTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGACGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGt < 5:415376/148‑1 (MQ=255) aCTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTg < 5:303554/149‑1 (MQ=255) cTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGc < 3:269327/149‑1 (MQ=255) tGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCt > 8:41074/1‑149 (MQ=255) aGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCt < 2:77074/147‑1 (MQ=255) aGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTg < 5:236610/148‑1 (MQ=255) aGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTg < 2:246130/148‑1 (MQ=255) ggCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTGGc < 7:128097/149‑1 (MQ=255) caccgccgGC‑CCCCTGACAGCGGAGCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTgg > 1:257650/3‑148 (MQ=255) cgccgGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTGGCAAc > 5:335999/1‑149 (MQ=255) cgccgGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTGGCAAc < 6:253826/149‑1 (MQ=255) tCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTGGCAACgg < 7:182834/144‑1 (MQ=255) tCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTGGCAACgg > 8:182834/1‑144 (MQ=255) tCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTGGCAACGGCAAtc > 2:315229/1‑149 (MQ=255) | CATGTGCCAGCACGCCACCCAGCTCAGCTTCGCCCCGGCCTATGCCCGTGACCGGGCACGGCTGCT‑GCGCAACTGGCCCACTGGCAGTGCCTTGCATCAGCGGCTGGACCGGCTGTTGCCAAAACTGGTCGACTGAGGCCGCCGGCTCCGCTGTCAGTGG‑GCCGGCGGTGGTTGATCTGGCAGTGTCAGCCAGTCACTGCTGCGCCCTGCCTGGCGAACGCGTATCAGCCACTGGCCGTTTTCGTGGCGCAGCACCGCCCACGGCACCACCCCGGCGTTGCTGGCAACGGCAATC > NC_002947/421008‑421302 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |