| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,316,255:1 | +C | 5.9% | coding (59/1548 nt) | PP_2038 → | long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,316,255 | 1 | . | C | 5.9% | 277.3 / 8.3 | 68 | coding (59/1548 nt) | PP_2038 | long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (36/28); new base C (2/2); total (38/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.11e-01 | |||||||||||
TATGGCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCAGAG > NC_002947/2316108‑2316400 | tATGGCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGt > 5:273843/1‑148 (MQ=255) tGGCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCATCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GAt < 5:42721/149‑1 (MQ=255) gCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGt < 8:315390/144‑1 (MQ=255) gCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGt > 7:315390/1‑144 (MQ=255) cATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGc < 2:115379/149‑1 (MQ=255) aCGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GAt < 5:174781/139‑1 (MQ=255) aCGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GAt > 6:174781/1‑139 (MQ=255) cGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGTCGATC‑ACCGCcaga < 4:214646/149‑3 (MQ=255) gCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCacac > 7:218784/1‑149 (MQ=255) cTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCgg < 6:273843/149‑1 (MQ=255) cTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCgg < 6:70462/149‑1 (MQ=255) gTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCt < 4:152198/148‑1 (MQ=255) ccGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAg > 4:121892/1‑149 (MQ=255) cGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCt < 6:277150/145‑1 (MQ=255) cGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCt > 5:277150/1‑145 (MQ=255) gCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTc < 8:360803/149‑1 (MQ=255) aCGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGACCCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGaac > 1:373213/1‑148 (MQ=255) aCGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGaac > 1:192361/1‑148 (MQ=255) aCGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGaac > 6:315845/1‑148 (MQ=255) gCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGaacaac < 4:355414/149‑1 (MQ=255) gCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCaa < 2:349315/148‑1 (MQ=255) atcgGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTg < 7:279683/149‑1 (MQ=255) cgGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑Ga > 3:343468/1‑91 (MQ=255) cgGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑Ga < 4:343468/91‑1 (MQ=255) ccGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGGACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTg > 1:316577/1‑149 (MQ=255) cGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGc < 5:281682/149‑1 (MQ=255) cGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGc > 4:391776/1‑149 (MQ=255) gTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCt > 4:336919/1‑149 (MQ=255) gacgaGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGc < 1:137524/94‑1 (MQ=255) gacgaGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGc > 2:137524/1‑94 (MQ=255) gaACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATATTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAgg < 2:29854/149‑1 (MQ=255) gaACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAgg < 3:336919/149‑1 (MQ=255) gaACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGAGGT‑GATCGAACGCCACACCCGGCTGACATTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAgg > 1:337487/1‑149 (MQ=255) aacaacaacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑Ga > 4:360600/1‑70 (MQ=255) aacaacaacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑Ga < 3:360600/70‑1 (MQ=255) caacaacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAGCAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAgg < 6:184978/146‑1 (MQ=255) caacaacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAGCAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAgg > 5:184978/1‑146 (MQ=255) aacaacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCAt > 6:335826/1‑149 (MQ=255) caacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCg < 3:391776/149‑1 (MQ=255) cGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTg > 1:256434/1‑118 (MQ=255) cGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTg < 2:256434/118‑1 (MQ=255) aCCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGc < 5:335826/149‑1 (MQ=255) cTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAAACAGCTGTCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGTGc > 1:233805/1‑147 (MQ=255) ttGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAg > 6:352067/1‑149 (MQ=255) ttGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAg > 8:67116/1‑149 (MQ=255) aCCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGt > 6:350087/1‑149 (MQ=255) tATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGc > 4:362047/1‑148 (MQ=255) tCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCAt > 5:131416/1‑149 (MQ=255) tCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGc > 5:327720/1‑134 (MQ=255) tCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGc < 6:327720/134‑1 (MQ=255) gAAGTACCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGgcg > 4:9433/1‑149 (MQ=255) ccAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAAc > 2:230000/1‑149 (MQ=255) ccAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGCGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAAc > 2:236219/1‑149 (MQ=255) aGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACcg > 1:247647/1‑149 (MQ=255) aGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACcg > 6:293656/1‑149 (MQ=255) tACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCgcgc < 8:218784/149‑1 (MQ=255) gCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAAc > 7:259928/1‑149 (MQ=255) gCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAAc > 4:349980/1‑149 (MQ=255) ccTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACt > 4:134906/1‑149 (MQ=255) taCGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGTCTGACCTTCGCTCTGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCTAACtggt < 2:373213/147‑1 (MQ=255) gtgtGGCGGTCGATC‑ACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTgg > 2:267600/4‑84 (MQ=38) gtgtGGCGGTCGATC‑ACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTgg < 1:267600/81‑1 (MQ=38) gtgtGGCGGTCGATC‑ACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACtggtgg > 1:332035/4‑147 (MQ=255) tCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAg < 3:362047/149‑1 (MQ=255) tCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAg > 5:83868/1‑149 (MQ=255) tGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAg > 1:391539/1‑147 (MQ=255) gCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCa < 2:42919/147‑1 (MQ=255) gCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCa > 2:4959/1‑147 (MQ=255) gCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCa > 3:104431/1‑147 (MQ=255) gCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCCCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCag < 5:350087/148‑1 (MQ=255) cGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCagag < 3:9433/149‑1 (MQ=255) | TATGGCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCAGAG > NC_002947/2316108‑2316400 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |