| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,953,931:1 | +G | 5.1% | coding (592/1977 nt) | PP_5606 ← | YVTN beta‑propeller repeat‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,953,931 | 1 | . | G | 5.1% | 327.5 / 11.2 | 79 | coding (592/1977 nt) | PP_5606 | YVTN beta‑propeller repeat‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (44/31); new base G (2/2); total (46/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.67e-01 | |||||||||||
CCCGGCACGTCGATCACTGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGAT > NC_002947/3953786‑3954078 | cccGGCACGTCGATCACTGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATc > 3:247027/1‑149 (MQ=255)cccGGCACGTCGATCACTGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATc < 4:59654/149‑1 (MQ=255)cccGGCACGTCGATCACTGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATc > 5:176425/1‑149 (MQ=255) ccGGCACGTCGATCACTGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATc > 7:22142/1‑148 (MQ=255) aCGTCGATCACTGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCAc > 4:378290/1‑149 (MQ=255) tCGATCACTGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCAcc > 6:261980/1‑147 (MQ=255) tCACTGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGAcc > 7:188969/1‑149 (MQ=255) tGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGGCCTTGc > 5:342867/1‑149 (MQ=255) tGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGc > 5:22121/1‑149 (MQ=255) tGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGAACACCGAGACCTTGc > 2:90998/1‑149 (MQ=255) ttACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAAGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGccc > 4:312480/1‑149 (MQ=255) cccACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTCTCGGTGATCGAT‑ACCGAAACCttca < 5:253768/143‑3 (MQ=255) cccACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTCTCGGTGATCGAT‑ACCGAAACCttca > 6:253768/1‑141 (MQ=255) cACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCg > 3:389307/1‑149 (MQ=255) cTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCggg > 6:147342/1‑148 (MQ=255) gCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCg < 8:188969/148‑1 (MQ=255) tgctgTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAAcc > 8:255225/1‑149 (MQ=255) tgctgTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAAcc > 3:387089/1‑149 (MQ=255) ctgTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCt < 1:396150/148‑1 (MQ=255) ttgttgCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAAccata > 1:144926/1‑144 (MQ=255) ttgttgCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGc < 5:261980/147‑1 (MQ=255) ttgttgCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGc < 4:165617/147‑1 (MQ=255) ttgttgCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCCGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCtt > 1:35264/1‑149 (MQ=255) ttgttgCCAACCCAAAGCCGATTCTGTTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGT‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACTC‑GGGTTAAGGTTTCGGT‑ATCTATAACCGAGACCTTTCCCCGCTTTTGTATCGACACGAAAACCTGCtt < 7:255225/149‑1 (MQ=255) tgttgCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTg > 7:176394/1‑149 (MQ=255) ttgCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTgtc < 4:170934/149‑1 (MQ=255) ttgCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTgtc < 3:378290/149‑1 (MQ=255) tgCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTgtcg > 7:327226/1‑149 (MQ=255) gCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCgg < 1:27396/122‑1 (MQ=255) gCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCgg > 2:27396/1‑122 (MQ=255) gCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTgtcg < 5:147342/148‑1 (MQ=255) gCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGAGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTgtcgt > 4:338932/1‑149 (MQ=255) cAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGtcgtcg > 7:124405/1‑149 (MQ=255) aaCCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGGCAAGGTCTCGGTGATCGAT‑ACCGAAACCttcacc > 3:205024/1‑108 (MQ=25) aaCCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGGCAAGGTCTCGGTGATCGAT‑ACCGAAACCttcacc < 4:205024/112‑5 (MQ=25) acaGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCtggtg > 6:56971/1‑149 (MQ=255) gCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGgcc > 2:176025/1‑149 (MQ=255) ccGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCATGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGAATCGCCACCAAAACATGCTTTTCGACGGTGGTGccc > 1:276493/1‑149 (MQ=255) ccGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGgccg < 4:389307/149‑1 (MQ=255) tGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCa < 4:26344/149‑1 (MQ=255) cTGGTCCGGCTGCACGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCCGCGTACAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑AACGATCACCGAGACCTTGCACCGCTCGGGTATCGACACAAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCact > 4:139446/1‑147 (MQ=255) gTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTc < 4:247027/147‑1 (MQ=255) gTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCa > 6:253776/1‑149 (MQ=255) gCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGgccgc > 2:323077/1‑149 (MQ=255) gCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGgccgc > 3:69343/1‑149 (MQ=255) gggCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCt < 4:69343/149‑1 (MQ=255) gggCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCt > 6:316203/1‑149 (MQ=255) gggCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCt < 1:323077/149‑1 (MQ=255) ggCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCt > 1:288422/1‑149 (MQ=255) gCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTgg < 8:124405/149‑1 (MQ=255) gCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGAACACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTgg < 1:90998/149‑1 (MQ=255) ccAAGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCACCGCTCGGGTATCGACACGGAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTgg > 4:320190/1‑148 (MQ=255) cACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCa < 5:56971/149‑1 (MQ=255) cACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAACGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCa < 3:312480/149‑1 (MQ=255) 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ggTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTAGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCt > 2:49868/1‑138 (MQ=255) cGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATg > 5:207122/1‑149 (MQ=255) gCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGGCCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATg < 6:342867/148‑1 (MQ=255) gCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATg < 7:271879/148‑1 (MQ=255) gCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCt > 5:128334/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCa > 8:312508/1‑149 (MQ=255) cGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGccc < 6:22121/149‑1 (MQ=255) cGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGccc < 8:176394/149‑1 (MQ=255) gCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCAc > 8:72749/1‑143 (MQ=255) gCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCAc < 7:72749/143‑1 (MQ=255) ccACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATg > 7:34533/1‑131 (MQ=255) ccACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATg < 8:34533/131‑1 (MQ=255) ccACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGccccc > 3:41414/1‑148 (MQ=255) aCGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTAGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCAc < 1:176025/149‑1 (MQ=255) gc‑gGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCg > 4:129231/1‑149 (MQ=255) tGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACAcc < 4:387089/149‑1 (MQ=255) tGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACAcc > 6:342444/1‑149 (MQ=255) gTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATg < 5:414051/117‑1 (MQ=255) gTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATg > 6:414051/1‑117 (MQ=255) gTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCgg < 5:316203/149‑1 (MQ=255) t‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGCCACCGTCGGGTCGAt > 8:252478/1‑148 (MQ=255) t‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGag > 6:126156/1‑147 (MQ=255) | CCCGGCACGTCGATCACTGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGC‑TGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGC‑GGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGAT > NC_002947/3953786‑3954078 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |