New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5145719 | 64 (0.980) | 4 (0.070) | 3/244 | NT | 6.0% | coding (1035/1323 nt) | srmB | ATP‑dependent DEAD‑box RNA helicase |
? | NC_002947 | = 5145802 | 66 (1.100) | coding (952/1323 nt) | srmB | ATP‑dependent DEAD‑box RNA helicase |
CTTTTTCTTCTTGCTACCGGCCGCCTTGCCCGAGGCCTTGACCTTCTTCGGCCCGTTGTAGGTGCCCTTCACTTCCTTGATGACCCGGCGCTCGAACTGCTGCTTGAGGTAGCGCTCGATGCTCGACATCAGGTTCCAGTCGTTGTGGGTGATCAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5145563‑5145719 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtgatcaacTTCGACATGCCACGTAGCGGTGACGAGTACGTACACCGTGTGGGCCGTACCGGCCGTGCCGGTGGCGAAGGCCTGGCGATCTCGTTGATCACCCACAACGACTGGAACCTGATGTCGAGCATCGAGCGCTACCTCAAGCAGCAGTT < NC_002947/5145802‑5145657 CTTTTTCTTCTTGCTACCGGCCGCCTTGCCCGAGGCCTTGACCTTCTTCGGCCCGTTGTAGGTGCCCTTCACTTCCTTGATGACCCGGCGCTCGAACTGCTGCTTGAGGTAGCGCTCGATGCTCGACATCAGGTTCCAGTCGTTGTGGG > 4:103934/1‑149 TTTCTTCTTGCTACCGGTCGCCTTGCCCGAGGCCTTGACCTTCTTCGGCCCGTTGTAGGTGCCCTTCACTTCCTTGATGACCCGGCGCTCGAACTGCTGCTTGAGGTAGCGCTCGATGCTCGACATCAGGTTCCAGTCGTTGTGGGTG < 1:398064/148‑1 TTTCTTCTTGCTACCGGCCGCCTTGCCCGAGGCCTTGACCTTCTTCGGCCCGTTGTAGGTGCCCTTCACTTCCTTGATGACCCGGCGCTCGAACTGCTGCTTGAGGTAGCGCTCGATGCTCGACATCAGGTTCCAGTCGTTGTGGGTG < 8:229016/148‑1 TTTCTTCTTGCTACCGGCCGCCTTGCCCGAGGCCTTGACCTTCTTCGGCCCGTTGTAGGTGCCCTTCACTTCCTTGATGACCCGGCGCTCGAACTGCTGCTTGAGGTAGCGCTCGATGCTCGACATCAGGTTCCAGTCGTTGTGG < 1:231357/145‑1 TTTCTTCTTGCTACCGGCCGCCTTGCCCGAGGCCTTGACCTTCTTCGGCCCGTTGTAGGTGCCCTTCACTTCCTTGATGACCCGGCGCTCGAACTGCTGCTTGAGGTAGCGCTCGATGCTCGACATCAGGTTCCAGTCGTTGTGG > 2:231357/1‑145 TCTTGCTACCGGCCGCCTTGCCCGAGGCCTTGACCTTCTTCGGCCCGTTGTAGGTGCCCTTCACTTCCTTGATGACCCGGCGCTCGAACTGCTGCTTGAGGTAGCGCTCGATGCTCGACATCAGGTTCCAGTCGTTGTGGGTGATCAAC > 6:228451/1‑149 TACCGGCCGCCTTGCCCGAGGCCTTGACCTTCTTCGGCCCGTTGTAGGTGCCCTTCACTTCCTTGATGACCCGGCGCTCGAACTGCTGCTTGAGGTAGCGCTCGATGCTCGACATCAGGTTCCAGTCGTTGTGGGTGATCAAC > 8:363391/1‑143 TGCTGCTTGAGGTAGCGCTCGATGCTCGACATCAGGTTCCAGTCGTTGTGGGTGATCAACTTCGACATGCCACGTAGCGGTGACGAGTACGTACACCGTGTGGGCCGTACCGGCCGTGCCGGTGGCGAAGGCCTGGCGATCTCGTTGA > 2:77586/1‑148 CTGCTTGAGGTAGCGCTCGATGCTCGACATCAGGTTCCAGTCGTTGTGGGTGATCAACTTCGACATGCCACGTAGCGGTGACGAGTACGTACACCGTGTGGGCCGTACCGGCCGTGCCGGTGGCGAAGGCCTGGCGATCTCGTTGA < 1:77586/146‑1 CTTGAGGTAGCGCTCGATGCTCGACATCAGGTTCCAGTCGTTGTGGGTGATCAACTTCGACATGCCACGTAGCGGTGACGAGTACGTACACCGTGTGGGCCGTACCGGCCGTGCCGGTGGCGAAGGCCTGGCGATCTCGTTGATCACCC < 2:175210/149‑1 CTTGAGGTAGCGCTCGATGCTCGACATCAGGTTCCAGTCGTTGTGGGTGATCAACTTCGACATGCCACGTAGCGGTGACGAGTACGTACACCGTGTGGGCCGTACCGGCCGTGCCGGTGGCGAAGGCCTGGCGATCTCGTTGATCACCC < 3:392548/149‑1 AACTTCGACATGCCACGTAGCGGTGACGAGTACGTACACCGTGTGGGCCGTACCGGCCGTGCCGGTGGCGAAGGCCTGGCGATCTCGTTGATCACCCACAACGACTGGAACCTGATGTCGAGCATCGAGCGCTACCTCAAGCAGCAGTT < 2:277055/149‑1 CTTTTTCTTCTTGCTACCGGCCGCCTTGCCCGAGGCCTTGACCTTCTTCGGCCCGTTGTAGGTGCCCTTCACTTCCTTGATGACCCGGCGCTCGAACTGCTGCTTGAGGTAGCGCTCGATGCTCGACATCAGGTTCCAGTCGTTGTGGGTGATCAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5145563‑5145719 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtgatcaacTTCGACATGCCACGTAGCGGTGACGAGTACGTACACCGTGTGGGCCGTACCGGCCGTGCCGGTGGCGAAGGCCTGGCGATCTCGTTGATCACCCACAACGACTGGAACCTGATGTCGAGCATCGAGCGCTACCTCAAGCAGCAGTT < NC_002947/5145802‑5145657 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |