New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2357793 | 49 (0.750) | 5 (0.080) | 5/250 | NT | 8.9% | coding (518/825 nt) | PP_2072 | AraC family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 2357821 | 56 (0.910) | coding (490/825 nt) | PP_2072 | AraC family transcriptional regulator |
CGGCGCAGGGTGACAAAGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTG > NC_002947/2357646‑2357941 | cggcgCAGGGTGACAAAGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGcgcg > 3:203925/1‑149 (MQ=255) gcAGGGTGACAAAGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCg < 5:2863/149‑1 (MQ=255) aGGGTGACAAAGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGc < 4:122048/149‑1 (MQ=255) tGACAAAGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGcc < 4:198991/149‑1 (MQ=255) aCAAAGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTg < 1:240108/149‑1 (MQ=255) aaaGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTGCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTgg > 1:100434/1‑149 (MQ=255) gCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCGCGGGCGCaagcgcctggattaccag < 4:64234‑M1/149‑19 (MQ=255) gggCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGTCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTGGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGgc < 7:37073/148‑1 (MQ=255) gggCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTTGCCTGTTCCAGCATGTCCATTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGgc < 6:294918/148‑1 (MQ=255) ggCGGGTGCCGTACCCCGTGCGAACGGCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATTTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGgcgc < 8:364620/149‑1 (MQ=255) tGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTg < 1:323921‑M2/149‑2 (MQ=255) tGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAgg < 3:403389/140‑1 (MQ=255) tGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAgg > 4:403389/1‑140 (MQ=255) tGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGAGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTgcgc < 2:17474‑M2/149‑5 (MQ=255) ccGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTgcgccc > 7:272980‑M2/1‑143 (MQ=255) gTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCaagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccga < 1:147589‑M1/149‑37 (MQ=255) cAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCaagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccgagc < 2:192792‑M1/148‑39 (MQ=255) cGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCCCTTGCGCCCGCGCGGCt > 8:186563/1‑149 (MQ=255) aGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGccgccg < 4:349060/149‑1 (MQ=255) cAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCaagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccg > 3:146781‑M1/1‑89 (MQ=255) cAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCaagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccg < 4:146781‑M1/124‑36 (MQ=255) aGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGc > 8:339300/1‑147 (MQ=255) gCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGcc < 8:346023/142‑1 (MQ=255) gCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGcc > 7:346023/1‑142 (MQ=255) gCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAgg < 4:203925/149‑1 (MQ=255) gCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAgg > 3:88229/1‑149 (MQ=255) cT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGc > 3:282872/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGc > 6:262184/1‑147 (MQ=255) gcgGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAgg < 5:187617/148‑1 (MQ=255) ggCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCa < 4:88229/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACa < 4:116116/149‑1 (MQ=255) gCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGcc < 7:219915/120‑1 (MQ=255) gCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAgg < 1:222237/147‑1 (MQ=255) cAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACgg > 3:277460/1‑110 (MQ=255) cAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACgg < 4:277460/110‑1 (MQ=255) cAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGt < 3:378683/148‑1 (MQ=255) aGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCGTGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGttc > 5:180350/1‑149 (MQ=255) aGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGATCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCTCAAGGCGATCGCCAGGTCATACACGGCGTCCTCtta > 4:64369/1‑148 (MQ=255) cATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCGTGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGttctt < 6:180350/149‑1 (MQ=255) aTGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCTAGGTCATACAGGGCGTCCTGttcttc < 5:262184/149‑1 (MQ=255) aTGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGttcttc < 7:339300/149‑1 (MQ=255) tgtTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGtt > 8:318867/1‑149 (MQ=255) gtTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTc > 3:353810/1‑149 (MQ=255) ttATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTcc < 7:318867/149‑1 (MQ=255) ttATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTcc < 2:100434/149‑1 (MQ=255) tGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAgc < 4:78231/149‑1 (MQ=255) acaTGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTg > 1:171368/1‑149 (MQ=255) aTGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGt > 5:339648/1‑149 (MQ=255) aTGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGt > 6:314569/1‑149 (MQ=255) tGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATgg > 7:79089/1‑134 (MQ=255) tGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATgg < 8:79089/134‑1 (MQ=255) aGGGGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTTTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCAc < 3:64369/149‑1 (MQ=255) ggTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACt < 4:353810/149‑1 (MQ=255) tgtTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGc < 2:323921/149‑1 (MQ=255) cATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTa > 8:289480/1‑149 (MQ=255) tgatgaAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTAc > 6:121826/1‑148 (MQ=255) gatgaAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAgg > 3:330074/1‑80 (MQ=255) gatgaAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAgg < 4:330074/80‑1 (MQ=255) gatgaAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACg > 4:179066/1‑148 (MQ=255) gCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataacactggacatgctggaacaggccagtggccgcgaacgctggagcctgtcgcgggactttcgcacgctg < 2:192792‑M2/148‑111 (MQ=255) tCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataacactggacatgctggaacaggccagtggccgcgaacgctggagcctgtcgcgggactttcgcacgctgtac < 1:147589‑M2/149‑114 (MQ=255) cGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataacactggacatgctggaacaggccagtggccgcgaacgctggagcctg > 3:146781‑M2/1‑35 (MQ=255) cGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataacactggacatgctggaacaggccagtggccgcgaacgctggagcctg < 4:146781‑M2/124‑90 (MQ=255) gggCGCaagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataacactggacatgctggaacaggccagtggccgcgaacgctggagcctgtcgcgggactttcgcacgctgtacgg > 7:272980‑M1/1‑6 (MQ=255) gcgcaagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataacactggacatgctggaacaggccagtggccgcgaactctggagcctgtcgcgggactttcgcacgctgtacggca < 2:17474‑M1/149‑146 (MQ=255) gcgTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGt < 7:289480/149‑1 (MQ=255) cgTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTg < 6:339648/149‑1 (MQ=255) caagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataacactggacatgctggaacaggccagtggccgcgaacgctggagcctgtcgcgggactttcgcacgctgtacggcacca < 1:323921‑M1/149‑149 (MQ=255) | CGGCGCAGGGTGACAAAGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCT‑CCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTG > NC_002947/2357646‑2357941 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |