New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5667574 = | 61 (0.940) | 5 (0.080) | 3/252 | NT | 8.3% | coding (121/402 nt) | PP_4975 | acyl‑CoA thioesterase |
? | NC_002947 | 5667616 = | 53 (0.850) | coding (79/402 nt) | PP_4975 | acyl‑CoA thioesterase |
TCTTGTTACGCACTTCGCACTTGAGGGTGATCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCATCTGTACTCCTGACCTGCTTGGCTAACGT > NC_002947/5667427‑5667722 | ttcaatggagcgaaggcagccgctctgccatcattgctacacgttagccaagcaggtcaggagtacagatgaactttcacacccgcaagtgggttaaacccgaagacctcaaccccaatggcaccctgttcggtggcagcctgttgcgc < 3:258075‑M1/2‑1 (MQ=255) ttcaatggagcgaaggcagccgctctgccatcattgctacacgttagccaagcaggtcaggagtacagatgaactttcacacccgcaagtgggttaaacccgaagacctcaaccccaatggcaccctgttcggtggcagcctgttgcg > 6:276191‑M1/148‑148 (MQ=255) tCTTGTTACGCACTTCGCACTTGAGGGTGATCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGc > 7:73216/1‑149 (MQ=255) aCGCACTTCGCACTTGAGGGTGATCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGa > 7:302311/1‑149 (MQ=255) cgcacttcgcacttGAGGGTGATCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGAt > 3:390208/1‑149 (MQ=255) gcacttcgcacttGAGGGTGATCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATg < 8:302311/149‑1 (MQ=255) gcacttGAGGGTGATCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAg < 6:109108/148‑1 (MQ=255) acttGAGGGTGATCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCg > 1:87591/1‑143 (MQ=255) cttGAGGGTGATCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGa < 8:208621/134‑1 (MQ=255) cttGAGGGTGATCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGa > 7:208621/1‑134 (MQ=255) tGATCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTACATCGCCGCctct < 6:359208/149‑1 (MQ=255) gATCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCtt > 5:151385/1‑149 (MQ=255) aTCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTc < 2:269685/149‑1 (MQ=255) tCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATcgccgc > 4:225666/1‑142 (MQ=255) tCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATcgccgc < 3:225666/142‑1 (MQ=255) tCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCACAGCGGGACGATGGCgg > 4:321538/1‑131 (MQ=255) gTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGAt > 6:127484/1‑149 (MQ=255) tGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATc < 4:197683/149‑1 (MQ=255) cacgttagccaagcaggtcaggagtacagatgaactttcacacccgcaagtgggttaaacccgaagacctcaaccccaatggcaccctgttcggtggcagcctgttgcGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCa > 1:260150‑M1/109‑148 (MQ=255) cacgttagccaagcaggtcaggagtacagatgaactttcacacccgcaagtgggttaaacccgaagacctcaaccccaatggcaccctgttcggtggcagcctgttgcGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAg > 1:408085‑M1/109‑149 (MQ=255) cacgtgagccacgcaggtcaggagtacagatgaactttcacacccgcaagtgggttaaacccgaagacctcaaccccaatggcaccctgttcggtggcagcctgttgcGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAg > 8:340193‑M1/109‑149 (MQ=255) cGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGACACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGt > 5:120213/1‑120 (MQ=255) cGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGACACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGt < 6:120213/120‑1 (MQ=255) gAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAgcgc > 8:13525/1‑148 (MQ=255) cgcgGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACa < 1:142832/149‑1 (MQ=255) ggTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGc > 3:217462/1‑149 (MQ=255) ggTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCAc < 2:87591/149‑1 (MQ=255) gCCCAGCTCGAAGATGTCACCCTGACGCCAAGCACTGACGAAGATGATTTCCGACATGTACTTCGTCACCACACGCTGGTTGACCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGACTCTTCATCGATCCAGAGCAACAGGCTGCCACCGAACa > 4:242630/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAgg > 3:351500/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAgg < 4:57429/149‑1 (MQ=255) ccAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAgg > 6:291695/1‑149 (MQ=255) tCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCAcc < 8:311024/137‑1 (MQ=255) tCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCAcc > 7:311024/1‑137 (MQ=255) gatgatGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGa > 2:182480/1‑83 (MQ=255) gatgatGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGa < 1:182480/83‑1 (MQ=255) gaactttcacacccgcaagtgggttaaacccgaagacctcaaccccaatggcaccctgttcggtggcagcctgttgcGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCa < 3:351648‑M1/40‑1 (MQ=255) gaactttcacacccgcaagtgggttaaacccgaagacctcaaccccaatggcaccctgttcggtggcagcctgttgcGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCa > 4:351648‑M1/78‑117 (MQ=255) atgTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTggg < 4:58140/149‑1 (MQ=255) aCCGTGCCGCGAAGCACGGACGCAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGa < 8:73216/149‑1 (MQ=255) cccTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAg < 4:217462/149‑1 (MQ=255) gAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCggg > 2:396612/1‑149 (MQ=255) gACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAAcc > 6:142057/1‑148 (MQ=255) gACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAAcc > 1:29166/1‑148 (MQ=255) aCGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGc > 8:93016/1‑100 (MQ=255) aCGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGc < 7:93016/100‑1 (MQ=255) gAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACt > 2:117870/1‑149 (MQ=255) gAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACt > 7:370479/1‑149 (MQ=255) ttGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCg > 6:120189/1‑149 (MQ=255) gATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCggg > 6:37461/1‑149 (MQ=255) gATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCggg > 7:38291/1‑149 (MQ=255) aTTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCggg < 5:142057/148‑1 (MQ=255) aTTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGgt < 6:151385/149‑1 (MQ=255) tttCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGgt < 2:93463/148‑1 (MQ=255) tCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGgtgt < 1:396612/148‑1 (MQ=255) cGACTTGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGGCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGa < 3:242630/148‑1 (MQ=255) cGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGaa < 3:190274/149‑1 (MQ=255) cGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGa < 1:117870/148‑1 (MQ=255) cGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGa > 4:190274/1‑148 (MQ=255) gTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCa > 8:146215/1‑149 (MQ=255) cTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCATc < 4:390208/148‑1 (MQ=255) cTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCATc < 5:37461/148‑1 (MQ=255) accacACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCATCTGTACTc < 8:370479/148‑1 (MQ=255) cacaCGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCATCTGTACTCCTg < 7:13525/149‑1 (MQ=255) acacGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGTACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCATCTGTACTCCTGa < 5:291695/149‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCATCTGTACTCCTGACCTg > 1:132414/1‑149 (MQ=255) gCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCAGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCATCTGTACTCCTGACCTg > 1:67680/1‑149 (MQ=255) cTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCATCTGTACTCCTGACCTGc < 5:127484/149‑1 (MQ=255) ggTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCATCTGTACTCCTGACCTGCtt > 2:257109/1‑149 (MQ=255) gTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCATCTGTACTCCTGACCTGCTTg < 4:274830/149‑1 (MQ=255) cccAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCATCTGTACTCCTGACCTGCTTGGCt > 4:254252/1‑148 (MQ=255) ccAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCATCTGTACTCCTGACCTGCTTGGCTaa > 4:258075/1‑149 (MQ=255) GCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCATCTGTACTCCTGACCTGCTTGGCTAACgt > 4:351500‑M1/1‑149 (MQ=255) | TCTTGTTACGCACTTCGCACTTGAGGGTGATCGAGGTGCGGCCGAACGCGGTAGCGGTGATGCCCAGCTCGATGATGTCACCCTGACGCGAAGCACTGACGAAGTTGATTTCCGACATGTACTTGGTCACCACACGCTGGTTGCCCAGCTGGACGATGGCGTAGATCGCCGCCTCTTCATCGATCCAGCGCAACAGGCTGCCACCGAACAGGGTGCCATTGGGGTTGAGGTCTTCGGGTTTAACCCACTTGCGGGTGTGAAAGTTCATCTGTACTCCTGACCTGCTTGGCTAACGT > NC_002947/5667427‑5667722 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |