| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6075927 = | 94 (1.440) | 4 (0.060) | 4/250 | NT | 4.5% | coding (635/2289 nt) | PP_5328 | phosphate ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | 6075982 = | 82 (1.330) | coding (580/2289 nt) | PP_5328 | phosphate ABC transporter permease | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCGGGTAGGTGATCTTGTAGGTGTGCT > NC_002947/6075782‑6076074 | gggcagcgcgctggtggtgctgggcctgtccaatggccaggcgctggttttccagcacacctacaagatcacctacccggacaacaagaaaaccatcagccctggcatcgactacccgtacggcgagcaatcgttcgtgctcgacgAg < 1:317678‑M1/2‑1 (MQ=255) ggTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAgg < 1:373443/149‑1 (MQ=255) cagcgcgctggtggtgctgggcctgtccaatggccaggcgctggttttccagcacacctacaagatcacctacccggacaacaagaaaaccatcagccctggcatcgactacccgtacggcgagcaatcgttcgtgctcgacgAGCAgg > 5:177808‑M1/144‑149 (MQ=255) agcgcgctggtggtgctgggcctgtccaatggccaggcgctggttttccagcacacctacaagatcacctacccggacaacaagaaaaccatcagccctggcatcgactacccgtacggcgagcaatcgttcgtgctcgacgAGCAggg > 4:98985‑M1/143‑149 (MQ=255) aTGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTc > 2:73926/1‑149 (MQ=255) tggtggtgctgggcctgtccaatggccaggcgctggttttccagcacacctacaagatcacctacccggacaacaagaaaaccatcagccctggcatcgactacccgtacggcgagcaatcgttcgtgctcgacgAGCAGGGTGTCGc < 5:156450‑M1/13‑1 (MQ=255) atatTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCAtt > 2:57016/1‑149 (MQ=255) cttcACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCTGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCAttgacg < 8:219803/148‑1 (MQ=255) cttcACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCAttgacgt > 2:331292/1‑149 (MQ=255) ttcACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCAttgacgtt < 3:377031/149‑1 (MQ=255) tcACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCAttgacgtt > 2:407350/1‑148 (MQ=255) cACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCAttgacgtt < 6:289204/147‑1 (MQ=255) cACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCAttgacgt < 4:224737/146‑1 (MQ=255) aCCGTCTCGGTTATTTGCGGCAGTTCGATCCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCAGTGCGTGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCAttgacgatgac > 8:280440/1‑149 (MQ=255) aCCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCAttgacgttgac < 6:410700/149‑1 (MQ=255) tcgtttaTTTGCGGATGTTCGATGGGGTTCTGGTCGGTGGTGACGTCTT‑CGGTCATCATGTTTTACGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCTAGCAGCATGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGAc < 7:280440/143‑1 (MQ=255) ggTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCACCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGAc < 6:262151/147‑1 (MQ=255) gTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCAttgacgtt > 5:199784/1‑137 (MQ=255) gTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCAttgacgtt < 6:199784/137‑1 (MQ=255) tCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTg > 7:102281/1‑148 (MQ=255) aTTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTc > 1:30065/1‑149 (MQ=255) aTTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTc < 4:18510/149‑1 (MQ=255) tttGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTc > 7:119215/1‑148 (MQ=255) caggcgctggttttccagcacacctacaagatcacctacccggacaacaagaaaaccatcagccctggcatcgactacccgtacggcgagcaatcgttcgtgctcgacgAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTc < 8:55828‑M1/38‑1 (MQ=255) gCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAgc > 5:172520/1‑149 (MQ=255) cAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAgcg < 7:266962/146‑1 (MQ=255) cAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAgcg > 8:266962/1‑146 (MQ=255) aGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCAttgacgttgac > 2:257191/1‑128 (MQ=255) aGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCAttgacgttgac < 1:257191/128‑1 (MQ=255) ttCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGa > 1:177197/1‑131 (MQ=255) ttCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGa < 2:177197/131‑1 (MQ=255) cGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGccc < 1:57016/148‑1 (MQ=255) cGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGccc < 4:114184/148‑1 (MQ=255) gATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGcccc < 8:119215/148‑1 (MQ=255) aTGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTGCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCt > 1:229805/1‑149 (MQ=255) cagcacacctacaagatcacctacccggacaacaagaaaaccatcagccctggcatcgactacccgtacggcgagcaatcgttcgtgctcgacgAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCt > 6:156450‑M1/95‑149 (MQ=255) agcacacctacaagatcacctacccggacaacaagaaaaccatcagccctggcatcgactacccgtacggcgagcaatcgttcgtgctcgacgAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCtc > 7:55828‑M1/94‑149 (MQ=255) gTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCtcgt > 2:404461/1‑149 (MQ=255) gCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAg > 3:253250/1‑148 (MQ=255) cTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACGACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAg < 1:331292/147‑1 (MQ=255) cTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGa < 3:165390/146‑1 (MQ=255) gACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGAtt > 7:214680/1‑149 (MQ=255) ccTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGc > 5:209594/1‑149 (MQ=255) ctctT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGTTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCt > 3:194561/1‑149 (MQ=255) 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tcatGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTAc > 7:188342/1‑146 (MQ=255) tcatGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACgg < 6:378530/148‑1 (MQ=255) tcatGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACgg > 5:378530/1‑148 (MQ=255) atGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCAGCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACggg > 1:231354/1‑147 (MQ=255) tGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGAc < 7:85177/91‑1 (MQ=255) gTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACg > 8:260603/1‑91 (MQ=255) gTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACg < 7:260603/91‑1 (MQ=255) ttttCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTc > 6:57025/1‑149 (MQ=255) tttCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAACACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGAACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGATCGCCGTACGGGTAGTc > 7:192260/1‑148 (MQ=255) ttCCGGGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCg < 5:25629/148‑1 (MQ=255) tCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGAt > 6:275449/1‑149 (MQ=255) cGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGc < 7:171303/149‑1 (MQ=255) cGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAg < 2:229805/148‑1 (MQ=255) tCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCt > 5:396919/1‑148 (MQ=255) tCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCt > 2:78869/1‑148 (MQ=255) aGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGTTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGAt < 4:194561/149‑1 (MQ=255) aGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGAt > 6:21636/1‑149 (MQ=255) 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cAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCttgtt < 1:78869/147‑1 (MQ=255) aGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTg > 7:338286/1‑101 (MQ=255) aGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTg < 8:338286/101‑1 (MQ=255) tGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCgg < 3:187171/149‑1 (MQ=255) gAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCacgaa > 7:143710/1‑91 (MQ=255) gAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCacgaa < 8:143710/91‑1 (MQ=255) tccGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCGGGTAgg < 7:228908/148‑1 (MQ=255) aCCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCGGGTAgg > 7:289865/1‑149 (MQ=255) gTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCCTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCGGGTAGGTGAt > 4:16594/1‑149 (MQ=255) tAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCGGGTAGGTGATc < 1:404461/149‑1 (MQ=255) gagCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCGGGTAGGTGATCtt < 6:396919/149‑1 (MQ=255) gagCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCGGGTAGGTGATCtt > 5:198004/1‑149 (MQ=255) gCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCGGGTAGGTGATCTTGt < 5:18294/149‑1 (MQ=255) ccGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGtt > 7:372988/1‑120 (MQ=255) ccGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGtt < 8:372988/120‑1 (MQ=255) cGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGATGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCGGGTAGGTGATCTTGTAg < 6:333401/149‑1 (MQ=255) ggCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGGACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCGGGTAGGTGATCTGGTAgg > 8:178372/1‑149 (MQ=255) gCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCttgt > 1:363370/1‑124 (MQ=255) gCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCttgt < 2:363370/124‑1 (MQ=255) gCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCGGGTAGGTGATCTTGTAGgt < 1:108463/149‑1 (MQ=255) gCAAGCAGCAGGGTGGCGCCATTGACGTCGACGCTGACGTGGTCCAGCGCTCGCCCCTGCTGGTCGAGCACGAAGGCTTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCGGGTCGGTGATCTTGTTGgt < 8:192260/149‑1 (MQ=255) gCAAGCAGCAGGGGGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCGGGTAGGTGATCTTGTAGgt < 1:407350/149‑1 (MQ=255) cagcagGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCGGGTAGGTGATCTTGTAGGTGTGCt < 7:241629/149‑1 (MQ=255) | TGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTT‑CGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACCTGCAGATGAGCACCGGTAGAGCCGGCAAGCAGCAGGGTGTCGCCATTGACGTTGACGCTGACGTGGTCCAGCGCACGCCCCTGCTCGTCGAGCACGAACGATTGCTCGCCGTACGGGTAGTCGATGCCAGGGCTGATGGTTTTCTTGTTGTCCGGGTAGGTGATCTTGTAGGTGTGCT > NC_002947/6075782‑6076074 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |