| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 87921 = | 65 (1.000) | 4 (0.060) | 4/258 | NT | 5.6% | coding (1397/1518 nt) | betC | choline‑sulfatase |
| ? | NC_002947 | 88027 = | 71 (1.120) | coding (1291/1518 nt) | betC | choline‑sulfatase | |||||
GCTGGCGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTCAGGTCATAGAGTAGGCATGGGTCGTCTTCGCTGTACACGAACTTGTAGGGCCCGCGGCGAATCATCATCAGCGGGCCGA > NC_002947/87881‑88173 | ctcaccggcagcccggaccaccaggtgctgctgcaggcatTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCAGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATg > 5:193445‑M1/41‑149 (MQ=255) tggcGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGcc > 7:146626/1‑149 (MQ=255) gcGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCTGCGGCGGCGCTGGCTGTCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCt < 7:265175/148‑1 (MQ=255) cGTCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTGATCGACAAATGCCTgc < 6:176916/149‑1 (MQ=255) ggcagcccggaccaccaggtgctgctgcaggcatTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTgca > 1:372625‑M1/35‑149 (MQ=255) tCCACCAGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTgcag < 3:369365/149‑1 (MQ=255) ccaGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTgcagcag > 1:337005/1‑148 (MQ=255) caGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTgcag < 4:347792/144‑1 (MQ=255) caGTGGTTGGTGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTgcag > 3:347792/1‑144 (MQ=255) gttggtGGTCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCtgg < 5:323694/149‑1 (MQ=255) ggtggtCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCtggtg < 2:337005/148‑1 (MQ=255) gtggtCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTggtggt > 8:325300/1‑149 (MQ=255) tCCCAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCgg < 3:370391/149‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTgca > 8:86702/1‑128 (MQ=255) ccAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTgca < 7:86702/128‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCggg < 3:156711/148‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGc > 3:74790/1‑149 (MQ=255) ccAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGc > 3:61790/1‑149 (MQ=255) ccAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGc > 8:261424/1‑149 (MQ=255) ccAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGATGGTCCGGGc > 7:64314/1‑149 (MQ=255) cAGCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCt > 1:391050/1‑149 (MQ=255) gCTTTTCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGc < 5:244170/149‑1 (MQ=255) tgcaggcatttgtcgatgaagcgcaacagcgctgggacatcaccagcctgcgccagcaggtactggccagccagcgccgccgccggctggtggccgaagcgctggccatcggcaaATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGcc > 1:372625‑M2/116‑149 (MQ=255) ttttCAGCTTGCCGATGGCCAGCGCTTCGGCCACCAGCCGGCGGCGGCGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCg > 8:17995/1‑149 (MQ=255) catttgtcgatgaagcgcaacagcgctgggacatcaccagcctgcgccagcaggtactggccagccagcgccgctgccggctggtggccgaagcgctggccatcggcaaATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAg > 5:193445‑M2/110‑149 (MQ=255) 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ggcggcggcGCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTCAGGTCa < 3:20365/149‑1 (MQ=255) gcggcgCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTCAGGTCATaga < 7:261424/149‑1 (MQ=255) ggcgCTGGCTGGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTCAGGTCATagag > 7:105863/1‑148 (MQ=255) cctgcgccagcaggtactggccagccagcgccgccgccggctggtggccgaagcgctggccatcggcaaATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGCTCGTGCGGGTCGCGGCTCAGGTCATAGAGt < 2:372625‑M2/80‑1 (MQ=255) gctggctgGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGc > 5:91033/1‑116 (MQ=255) gctggctgGCCAGTACCTGCTGGCGCAGGCTGGTGATGTCCCAGCGCTGTTGCGCTTCATCGACAAATGCCTGCAGCAGCACCTGGTGGTCCGGGCTGCCGGTGAGGTTCTCCCGc < 6:91033/116‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |