New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 568378 | 77 (1.180) | 4 (0.060) | 4/258 | NT | 5.2% | coding (1118/2835 nt) | uvrA | uvrABC excinuclease protein A |
? | NC_002947 | = 568410 | 71 (1.120) | coding (1086/2835 nt) | uvrA | uvrABC excinuclease protein A |
TACCCCGGCAATCCGGGCACGGTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGCTGACAGCTCGCCGAAAGGCTCCTCCAGGCTGAAGCCGTAGTGCGCAGCCAACGAACCGAGCATCTGGAAGTAGTACACGT > NC_002947/568265‑568558 | tACCCCGGCAATCCGGGCACGGTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGtcg > 4:374518‑M2/1‑146 (MQ=255) aCCCCGGCAATCCGGGCACGGTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGt > 1:207408/1‑149 (MQ=255) ccccGGCAATCCGGGCACGGTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGtt < 1:118017/149‑1 (MQ=255) ccccGGCAATCCGGGCACGGTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGtt < 6:218306/149‑1 (MQ=255) cccGGCAATCCGGGCACGGTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTg > 5:343023/1‑149 (MQ=255) cccGGCAATCCGGGCACGGTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTg < 5:287325/149‑1 (MQ=255) ggCAATCCGGGCACGGTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAgg < 7:83499/149‑1 (MQ=255) ggCAATCCGGGCACGGTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTGTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAgg < 1:371580/149‑1 (MQ=255) tCCGGGCACGGTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTTGTTGAGGTACtt < 7:316706/149‑1 (MQ=255) tCCGGGCACGGTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACtt < 4:161298/149‑1 (MQ=255) ggCACGGTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCATGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGaaa < 3:323798/149‑1 (MQ=255) cGGTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGa < 1:236785/149‑1 (MQ=255) cGGTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGa < 3:73224/149‑1 (MQ=255) ggTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAgg < 4:230509/135‑1 (MQ=255) ggTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAgg > 3:230509/1‑135 (MQ=255) gCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAGCGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACActc > 1:153550/1‑149 (MQ=255) gTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTg > 3:401754/1‑149 (MQ=255) ccAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGGCTTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCt > 1:121156/1‑149 (MQ=255) ccAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCtt < 7:268583/149‑1 (MQ=255) aTTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCNGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTg > 1:231901/1‑149 (MQ=255) ggCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCt > 4:50509/1‑149 (MQ=255) gCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCt < 2:207408/148‑1 (MQ=255) gCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTg > 6:258091/1‑149 (MQ=255) gCCAGTTCTTCACGCAAGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGCCGCTAAACG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGAGGATCTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGATTGACGCTGCCCTg > 2:49677/1‑149 (MQ=255) cAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTg > 4:326221/1‑147 (MQ=255) ttcACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGTACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGtt > 2:197614/1‑102 (MQ=255) ttcACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGTACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGtt < 1:197614/102‑1 (MQ=255) cacgcacgGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACt > 1:240748/1‑149 (MQ=255) acgcacgGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATc > 1:211865/1‑145 (MQ=255) acgcacgGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATc < 2:211865/145‑1 (MQ=255) gcacgGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTc > 1:81678/1‑149 (MQ=255) cacgGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGGCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCt < 3:326221/149‑1 (MQ=255) cgGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTgg < 7:245752/149‑1 (MQ=255) ggTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAGCGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGgt < 2:153550/149‑1 (MQ=255) ggTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGgt < 4:401754/149‑1 (MQ=255) ggCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGtt > 4:176889/1‑149 (MQ=255) gCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTc < 6:343023/149‑1 (MQ=255) ccGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCAGAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGACTCGGTCGTTGAGGTAGTTGATATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTTGTGTTCg < 1:49677/149‑1 (MQ=255) cGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGTACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCgg > 2:222841/1‑149 (MQ=255) gATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGc > 1:345590/1‑149 (MQ=255) ttCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGCt > 8:205367/1‑148 (MQ=255) ttCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGCt > 4:200183/1‑148 (MQ=255) ttCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGCt < 2:231901/148‑1 (MQ=255) cGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGCTGa < 5:262721/148‑1 (MQ=255) 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gg‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGCTGACAGCTCGCCGAAAGGCTCCTCCAgg < 2:81678/149‑1 (MQ=255) cattGCCTTCGTACGGGTGCGAGCGCTTGAGGATGTCGCCTCGGTCGTTGACGTACTTGAAATCCAGTCTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGCATCACTTTCTGGTTGTCGGCTGACAGCTCGCCGAAAGGCTGCTCCATGCTGTCGCCg < 6:169186/146‑1 (MQ=255) caATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGCTGACAGCTCGCCGAAAGGCTCCTCCAGGCTGAAGCCg < 6:276700/149‑1 (MQ=255) caATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGCTGACAGCTCGCCGAAAGGCTCCTCCAGGCTGAAGCCg > 2:65138/1‑149 (MQ=255) caATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGCTGACAGCTCGCCGAAAGGCTCCTCCAGGCTGAAGCCg < 8:98237/149‑1 (MQ=255) 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< 2:121156/149‑1 (MQ=255) gCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGCTGACAGCTCGCCGAAAGGCTCCTCCAGGCTGAAGCCGTAGTGCGAAGCCAACGAACCGAg > 6:364028/1‑148 (MQ=255) aCGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACCCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGCTGACAGCTCGCCGAAAGGCTCCTCCAGGCTGAAGCCGTAGTGCGCAGCCAACGAACCGAGCATCTg > 5:71064/1‑149 (MQ=255) gATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGCTGACAGCTCGCCGAAAGGCTCCTCCAGGCTGAAGCCGTAGTGCGCAGCCAACGAACCGAGCATCTgg > 2:80488/1‑148 (MQ=255) tGTCGCCTCGGtcgaaggcattgtgccgaaccttgagcgccgctaccgcgaaaccgaatcggccaccgtgcgtgaagaactggccaaattccttggcacgcaaccgtgcccggattgccggggtacgcgcctgcgccgcgaggcgcgcc > 5:373917‑M2/1‑11 (MQ=255) tGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGCTGACAGCTCGCCGAAAGGCTCCTCCAGGCTGAAGCCGTAGTGCGCAGCCAACGAACCGAGCATCTGGAag > 6:284715/1‑149 (MQ=255) gTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGCTGACAGCTCGCCGAAAGGCTCCTCCAGGCTGAAGCCGTAGTGCGCAGCCAACGAACCGAGCATCTGGAAGTAGTACACGt > 8:74596/1‑149 (MQ=255) | TACCCCGGCAATCCGGGCACGGTTGCGTGCCAAGGAATTTGGCCAGTTCTTCACGCACGGTGGCCGATTCGGTTTCGCGGTAGCGGCGCTCAAGG‑TTCGGCACAATGCCTTCGAACGGGTGCGATCGCTTGACGATGTCGCCTCGGTCGTTGAGGTACTTGAAATCGACACTCTGCTTGCCGCTGCCCTGCAGGATCACTTTCTGGTGTTCGGCTGACAGCTCGCCGAAAGGCTCCTCCAGGCTGAAGCCGTAGTGCGCAGCCAACGAACCGAGCATCTGGAAGTAGTACACGT > NC_002947/568265‑568558 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |