New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1288899 = | 63 (0.970) | 4 (0.060) | 4/250 | NT | 6.1% | coding (172/2349 nt) | PP_1126 | hydrolase |
? | NC_002947 | 1288937 = | 63 (1.020) | coding (210/2349 nt) | PP_1126 | hydrolase |
TGTCCATTACTCGTCTTGGGCCCATCAGGGTCCTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGCCCGCAGAGCGGGGTGTGGGAC > NC_002947/1288789‑1289084 | gctgctgggccgggttgaacaccacacgccgcaacacctcgccctcggccgtttgttccgcgttgtactgcggcatgctggcatccaccgtcgccacattgaccaccgaaGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCt < 7:191767‑M1/39‑1 (MQ=255) ctgctgggccgggttgaacaccacacgccgcaacacctcgccctcggccgtttgttccgcgttgtactgcggcatgctggcatccaccgtcgccacattgaccaccgaaGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCtt > 8:191767‑M1/110‑149 (MQ=255) ccATTACTCGTCTTGGGCCCATCAGGGTCCTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCg > 6:112807/1‑149 (MQ=255) aTTACTCGTCTTGGGCCCATCAGGGTCCTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCggt > 1:306487/1‑149 (MQ=255) ttACTCGTCTTGGGCCCATCAGGGTCCTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCggtg < 1:255480/149‑1 (MQ=255) cTCGTCTTGGGCCCATCAGGGTCCTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTc < 2:306487/149‑1 (MQ=255) tCGTCTTGGGCCCATCAGGGTCCTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTc > 4:62891/1‑148 (MQ=255) tCTTGGGCCCATCAGGGTCCTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑Atg > 2:73366/1‑149 (MQ=255) gttgaacaccacacgccgcaacacctcgccctcggccgtttgttccgcgttgtactgcggcatgctggcatccaccgtcgccacattgaccaccgaaGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑Atg > 7:142577‑M1/98‑149 (MQ=255) ttGGGCCCATCAGGGTCCTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑Atgtg > 5:249957/1‑149 (MQ=255) gCCCATCAGGGTCCTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGa > 6:160836/1‑149 (MQ=255) ccATCAGGGTCCTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACg > 1:366507/1‑149 (MQ=255) tCAGGGTCCTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTg < 5:161966/149‑1 (MQ=255) ggTCCTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATg > 8:61337/1‑149 (MQ=255) ggTCCTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATg > 4:27140/1‑149 (MQ=255) ggTCCTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTACGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATg > 1:340702/1‑149 (MQ=255) cTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCa < 4:175964/148‑1 (MQ=255) tGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACgg < 7:121074/138‑1 (MQ=255) tGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACgg > 8:121074/1‑138 (MQ=255) tGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAg > 1:239540/1‑148 (MQ=255) tGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCATCAGAACCATGCCCGCCGTATTCGCATTGATGTGCAGTTCGCCCTTTCTGGCCTAGCAGCAAACGATGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAg > 5:166598/1‑148 (MQ=255) aGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATg > 3:285311/1‑149 (MQ=255) gagaGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGcc > 7:378397/1‑149 (MQ=255) agCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCa < 3:27140/149‑1 (MQ=255) ccTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAg > 1:358315/1‑148 (MQ=255) ccTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCa < 2:145643/141‑1 (MQ=255) ccTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCa > 1:145643/1‑141 (MQ=255) ccTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAAcg > 2:325004/1‑149 (MQ=255) cTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAAcgc > 7:42378/1‑149 (MQ=255) aTGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATTTCAGCATGCCGCAGTACAAcgcg < 7:61337/147‑1 (MQ=255) aTGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAAcgcg < 6:249957/147‑1 (MQ=255) aTGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAAcgcg < 8:378397/147‑1 (MQ=255) tCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACa > 2:112341/1‑148 (MQ=255) ccgccgCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACaaa > 2:339084/1‑149 (MQ=255) cgccgcACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAAc < 2:239540/149‑1 (MQ=255) gcACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGcc > 4:316322/1‑149 (MQ=255) ccTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑Agg > 8:51377/1‑149 (MQ=255) ccTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTACGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑Agg < 2:340702/149‑1 (MQ=255) ccgccgTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAg < 4:285311/149‑1 (MQ=255) gccgTATTCGCCTTGTTGGGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGgt < 5:68666/149‑1 (MQ=255) cgTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCggtg > 4:365869/1‑79 (MQ=255) cgTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCggtg < 3:365869/79‑1 (MQ=255) gCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTgcggcg > 7:133311/1‑149 (MQ=255) ccTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCgt > 4:170925/1‑149 (MQ=255) 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cattgaccaccgaagccgggcgcacgaagctgaacagcgtttgctgcccggcTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAAc > 7:142577‑M2/53‑149 (MQ=255) ttCGCACTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAAcc > 7:364217/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCgg < 3:316322/149‑1 (MQ=255) gCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCgg > 6:181202/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCgg > 2:125966/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCg < 1:12045/148‑1 (MQ=255) cTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCcagca < 3:170925/149‑1 (MQ=255) tGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCcagcag > 6:413109/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCcagcag > 3:163592/1‑149 (MQ=255) aagccgggcgcacgaagctgaacagcgtttgctgcccggcTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCcagcag > 8:191767‑M2/41‑149 (MQ=255) agccgggcgcacgaagctgaacagcgtttgctgcccggcTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCagcagc < 7:191767‑M2/110‑1 (MQ=255) GCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCagcagc > 1:112341‑M1/1‑148 (MQ=255) CAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCca < 8:5115‑M1/137‑1 (MQ=255) CAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCca > 7:5115‑M1/1‑137 (MQ=255) agcaAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTgcggc > 2:383402/1‑114 (MQ=255) agcaAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTgcggc < 1:383402/114‑1 (MQ=255) gctgaacagcgtttgctgcccggcTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGa < 8:142577‑M2/125‑1 (MQ=255) ttCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGccc > 7:106001/1‑149 (MQ=255) tCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGCCCg > 3:244564/1‑149 (MQ=255) cAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCAGATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGCCCg > 1:30722/1‑149 (MQ=255) aGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGCCCg > 7:40315/1‑147 (MQ=255) aGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGCCCGCa < 8:42378/149‑1 (MQ=255) aGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGCCCGCa < 4:163592/149‑1 (MQ=255) aGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGACCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGCCCg > 8:143717/1‑147 (MQ=255) tCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGCCCGCAGAGc > 1:5955/1‑149 (MQ=255) cGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGCCCGCAGAGc < 8:40315/148‑1 (MQ=255) cGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGCCCGCAGAGc < 2:358315/148‑1 (MQ=255) tGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGCCCGCAGAGCggg < 5:181202/149‑1 (MQ=255) tGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGCCCGCAGAGCggg > 6:83959/1‑149 (MQ=255) cGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGGTACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCGTCTCTCAAACGGCCGCCTTCTGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGCCCGCAGAGCggg < 1:125966/149‑1 (MQ=255) cTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGCCCGCAGAGCGGGGTGTGGGAc < 8:364217‑M2/148‑1 (MQ=255) | TGTCCATTACTCGTCTTGGGCCCATCAGGGTCCTGAAGGAGAGCCTCAGCCTTATGATCCGCCGCACCCTGCCCGCCGTATTCGCCTTGTTGTGCAGTTCGCCCTTGCTGGCCGGGCAGCAAACGCTGTTCAGCTTCGTGCGCCCGGCTTCGGTGGTCA‑ATGTGGCGACGGTGGATGCCAGCATGCCGCAGTACAACGCG‑‑GAACAAACGGCCG‑‑‑‑AGGGCGAGGTGTTGCGGCGTGTGGTGTTCAACCCGGCCCAGCAGCCGACCCTGCGCCTGAGCCCGCAGAGCGGGGTGTGGGAC > NC_002947/1288789‑1289084 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |