New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2048794 = | 55 (0.850) | 4 (0.070) | 4/230 | NT | 8.7% | intergenic (+33/+106) | PP_1821/PP_1822 | glutathione S‑transferase family protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2048885 = | 36 (0.640) | intergenic (+124/+15) | PP_1821/PP_1822 | glutathione S‑transferase family protein/hypothetical protein |
GCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGG > NC_002947/2048737‑2049032 | gcgGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAggg < 8:375425/149‑1 (MQ=255) tgCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCa < 3:139837/148‑1 (MQ=255) gtggGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCgtcagtc < 6:254552/149‑1 (MQ=255) ggCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCgtcagt > 2:117168/1‑145 (MQ=255) ggCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGa < 1:321598/149‑1 (MQ=255) aCCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATggcggc > 4:48762/1‑148 (MQ=255) aCCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAc‑c > 6:245653/1‑149 (MQ=255) gTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCTATACCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAAGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATTGCGGCAAAC‑CGCt > 1:120477/1‑149 (MQ=38) ttttCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCt > 3:366650/1‑147 (MQ=255) tCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATc < 8:218217/148‑1 (MQ=255) cAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAg > 3:258225/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCCCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAg < 5:245653/149‑1 (MQ=255) cAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCAACGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAACGGATCTGCAGCGTCCGTAAGATGGCGGCAAAA‑CGCGCATCCAGCTAAGAgatgat > 8:346762/1‑149 (MQ=25) aaTCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGAtt < 3:48762/149‑1 (MQ=255) CTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCt < 1:261444‑M1/149‑1 (MQ=255) TTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCgatg > 7:300205‑M1/1‑141 (MQ=255) TTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCgatg < 8:300205‑M1/141‑1 (MQ=255) TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATggcgg > 3:319222‑M1/1‑112 (MQ=255) TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATggcgg < 4:319222‑M1/112‑1 (MQ=255) TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGa > 4:366650‑M1/1‑149 (MQ=255) gagcgggcgagcccgcgaagcaggcaccgcggtggttggcacgggctgcgcccgtgttcgcgggcacgcccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGGAAGCGATGATTGCCTTGGACt > 1:397023‑M2/84‑148 (MQ=255) GCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACAt < 7:94147‑M1/149‑1 (MQ=255) gcgagcccgcgaagcaggcaccgcggtggttggcacgggctgcgcccgtgttcgcgggcacgcccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACAt > 5:392246‑M2/78‑149 (MQ=255) gCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAg > 6:335413/1‑149 (MQ=255) ccGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGt > 1:28870/1‑149 (MQ=255) acGGGCGCAGCCC‑GTTCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGc < 2:120477/149‑1 (MQ=255) acGGGCGCAGCCC‑GTGCCTAGCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGc < 7:346762/149‑1 (MQ=255) acGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGc > 1:45321/1‑149 (MQ=255) acGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGc > 5:345638/1‑149 (MQ=255) acGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCACGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGc > 8:33834/1‑149 (MQ=255) ggCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGAGGGCACGCCCGCTCCCACAACGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCACGAAAGCCATGATAGCCTTGGACAAAAACATCCAGCTCACCTAGCCg > 7:99640/1‑148 (MQ=255) accgcggtggttggcacgggctgcgcccgtgttcgcgggcacgcccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCgatgat < 4:404683‑M2/54‑1 (MQ=255) accgcggtggttggcacgggctgcgcccgtgttcgcgggcacgcccgctcccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCgatgat > 3:404683‑M2/59‑112 (MQ=255) ccc‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCAt > 7:333158/1‑121 (MQ=255) ccc‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCAt < 8:333158/121‑1 (MQ=255) c‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGcttctt < 2:404779/146‑1 (MQ=255) c‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCGCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGcttctt > 1:404779/1‑146 (MQ=255) gTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAg < 1:108819/126‑1 (MQ=255) gTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAg > 2:108819/1‑126 (MQ=255) aaCCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATgcg > 6:125824/1‑147 (MQ=255) cgcgGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGt > 6:292952/1‑117 (MQ=255) cgcgGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGt < 5:292952/117‑1 (MQ=255) tGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACt > 8:182902/1‑149 (MQ=255) tGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCAt < 7:144550/139‑1 (MQ=255) tGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCAt > 8:144550/1‑139 (MQ=255) cTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCAc < 2:261444/148‑1 (MQ=255) cgcgGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCg < 6:345638/148‑1 (MQ=255) gcgGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCgg < 1:117168/148‑1 (MQ=255) cTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCa < 7:33834/149‑1 (MQ=255) tCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAACGCGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCa > 1:299512/1‑149 (MQ=255) ccacaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAg > 7:125831‑M2/9‑149 (MQ=255) acaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGc < 8:156343‑M2/107‑1 (MQ=255) acaaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGc > 7:156343‑M2/7‑113 (MQ=255) aaggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGcc > 2:57281‑M2/5‑149 (MQ=255) ggGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTg > 3:376541‑M2/3‑149 (MQ=255) gGATCTGCAGCGTGAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTgg < 8:99640‑M2/148‑1 (MQ=255) gGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTgg > 5:56057‑M2/2‑149 (MQ=255) | GCGGCATGTGCCGATGGTGGGCTGAAAACCGACCTGTTTTCCAGGCGCTTGCGCAATCCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCC‑GTGCCAACCACCGCGGTGCCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAAGGGATCTGCAGCGTCAGTCAGATGGCGGCAAAC‑CGCTCATCCAGGTAAGCGATGATTGCCTTGGACTCATACATCCAGGTCACCTTGCCGGCTTCTTCAATGCGCAGGCATGGCACTTTCACCCGGCCGCCACCTTCCTGCAGGGCCTGG > NC_002947/2048737‑2049032 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |