New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3185491 | 47 (0.720) | 3 (0.050) | 3/256 | NT | 6.1% | coding (1128/1647 nt) | PP_2795 | AMP‑binding domain‑containing protein |
? | NC_002947 | = 3185532 | 47 (0.740) | coding (1169/1647 nt) | PP_2795 | AMP‑binding domain‑containing protein |
AGCCGGGTGTCGACGAGTTGCCGCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGCCGTGCTGCACCTGGACGGCTATGTGGAAATCAAGGACCGAGCCAAGGA > NC_002947/3185385‑3185679 | aGCCGGGTGTCGACGAGTTGCCGCTTGAGGCCCGGGCCAAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTg > 4:33210‑M2/1‑148 (MQ=255) gCCGGGTGTCGTCGAGTTGCCGCTGGAGGCCCGGGCCCAGGTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTGGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTgg > 7:266308‑M2/1‑147 (MQ=255) ccGGGTGTCGACGAGTTGCCGCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTggt > 8:122748‑M2/1‑146 (MQ=255) ccGGGTGTCGACGAGTTGCCGCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTggt > 4:182470‑M2/1‑146 (MQ=255) cGGGTGTCGACGAGTTGCCGCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTggtg > 2:156550‑M2/1‑145 (MQ=255) gtgtCGACGAGTTGCCGCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGgtggtg > 4:392899/1‑149 (MQ=255) cgacgaGTTGCCGCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCggg < 3:10860/149‑1 (MQ=255) gacgaGTTGCCGCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCTAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCgggg > 4:72408/1‑149 (MQ=255) gacgaGTTGCCGCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCgggg < 6:80178/149‑1 (MQ=255) gacgaGTTGCCGCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCgggg > 8:215329/1‑149 (MQ=255) gacgaGTTGCCGCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCgggg < 7:241093/149‑1 (MQ=255) aGTTGCCGCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAac < 3:392899/149‑1 (MQ=255) gCCGCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACt < 2:194901/148‑1 (MQ=255) ccGCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACtg < 4:24040/148‑1 (MQ=255) gCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCTAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGtga < 3:72408/149‑1 (MQ=255) gCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGtga < 7:215329/149‑1 (MQ=255) gCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGtga > 4:276602/1‑149 (MQ=255) gggCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTAc < 3:194245/149‑1 (MQ=255) ccAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTg > 1:48328/1‑148 (MQ=255) ccAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTg > 3:355342/1‑148 (MQ=255) gTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGcac > 4:138989/1‑148 (MQ=255) aTGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAAcc < 4:355342/148‑1 (MQ=255) tGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAAcc > 3:335708/1‑147 (MQ=255) gccgccAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCagag < 4:192225/149‑1 (MQ=255) ccgccAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGCCGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCATCACTGTGATGAAAGGCTACCTGCCCAACCCAGAgg > 7:364886/1‑149 (MQ=255) ccgccAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAgg < 3:276602/149‑1 (MQ=255) cgccAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCACGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGCCTACCTGCACAACCAAGAgg > 8:251034/1‑148 (MQ=255) gCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGt < 3:138989/149‑1 (MQ=255) tCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGcc < 1:6621/149‑1 (MQ=255) gCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCcgc > 6:111299/1‑149 (MQ=255) aggaggCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACggctgg < 5:111299/149‑1 (MQ=255) aCCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTggtgtcggtatccagcaccgtggcctcctcgagcagcgggtgggcgacgccctggcggctcatgaactgggcccgggcctccagcggc < 4:79699‑M2/138‑89 (MQ=255) aCCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCAAACCCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTGGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGc > 6:190316/1‑149 (MQ=255) cGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTTGCCAACGGCTGGCTGCACCCGGGCGACCTGGCCg > 8:312332/1‑149 (MQ=255) cGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTgg > 2:37872/1‑146 (MQ=255) cGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGCCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTgg < 1:37872/146‑1 (MQ=255) acCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACggctggc < 1:351474/124‑1 (MQ=255) acCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACggctggc > 2:351474/1‑124 (MQ=255) cGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTggtgtcggtatccagcaccgtggcctcctcgagcagcgggtgggcgacgccctggcggctcatgaactgggcccgggcctccagcggcaactcgtcgacacccggct < 3:324679‑M2/149‑108 (MQ=255) ggCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGCCGTGCTGCa > 5:271163/1‑149 (MQ=255) ccgccCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTggtgtcggtatccagcaccgtggcctcctcgagcagcgggtgggcgacgccctggcggctcatgaactgggcccgggcctccagcggcaactcgtcgacacccggctgcc < 5:59808‑M2/149‑111 (MQ=255) ccgccCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGCCGTGCTGCAcc < 1:51420/149‑1 (MQ=255) gccCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGCCGtgc < 4:189622/141‑1 (MQ=255) gccCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGCCGtgc > 3:189622/1‑141 (MQ=255) gccCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGCCGTGCTGCACCTg > 5:18440/1‑149 (MQ=255) gccCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGCCGTGCTGCACCTg > 2:55350/1‑149 (MQ=255) ggTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGcc < 7:208756/133‑1 (MQ=255) ggTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGcc > 8:208756/1‑133 (MQ=255) ccGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTAc > 8:146606/1‑83 (MQ=255) ccGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTAc < 7:146606/83‑1 (MQ=255) ccGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGCCGTGCTGCACCTGGACGGCt < 4:335708/148‑1 (MQ=255) gCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGCCGTGCTGCACCTGGACGGCTAtgt < 8:35856/149‑1 (MQ=255) cccTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGCCGTGCTGCACCTGGACGGCTATGTGGAAATCAAGGAc > 6:252035/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGCCGTGCTGCACCTGGACGGCTATGTGGAAATCAAGGAcc > 2:21696/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGAAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGATGGCCAACGGATGGCTGCACACGGGCGAACTGCCCGTGCTGCACCTGGACGGCTATGTGGAAATCaactacc > 1:136046/1‑144 (MQ=255) tCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGCCGTGCTGCACCTGGACGGCTATGTGGAAATCAAGGAcc > 7:252592/1‑147 (MQ=255) cTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGNTGGCTGCACACGGGCGACCTGGCCGTGCTGCACCTGGACGGCTATGTGGAAATCAAGGACCGAGCCAAGGa > 1:128651/1‑149 (MQ=255) | AGCCGGGTGTCGACGAGTTGCCGCTGGAGGCCCGGGCCCAGTTCATGAGCCGCCAGGGCGTCGCCCACCCGCTGCTCGAGGAGGCCACGGTGCTGGATACCGACACCGGCCGCCCGGTCCCGGCCGACGGCCTTACCCTCGGCGAGCTGGTGGTGCGGGGCAACACTGTGATGAAAGGCTACCTGCACAACCCAGAGGCTACCCGTGCCGCGTTGGCCAACGGCTGGCTGCACACGGGCGACCTGGCCGTGCTGCACCTGGACGGCTATGTGGAAATCAAGGACCGAGCCAAGGA > NC_002947/3185385‑3185679 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |