New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4094105 = | 55 (0.850) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 5.3% | coding (1102/1581 nt) | PP_3602 | 2,5‑dioxovalerate dehydrogenase |
? | NC_002947 | 4094144 = | 55 (0.890) | coding (1141/1581 nt) | PP_3602 | 2,5‑dioxovalerate dehydrogenase |
GCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGACCGCGACGCTGATCGGCGAAGCGGAG > NC_002947/4093996‑4094287 | gCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCctgc > 8:73955/1‑149 (MQ=255) aCCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGt > 1:132325/1‑149 (MQ=255) cTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTc < 4:286128/149‑1 (MQ=255) cTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTc < 7:315905/149‑1 (MQ=255) tCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTcc > 2:369585/1‑149 (MQ=255) tCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTc > 3:164949/1‑148 (MQ=255) aaTGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTc < 4:164949/146‑1 (MQ=255) cTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCg > 4:94972/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGc > 3:145330/1‑149 (MQ=255) ggcTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGtt > 4:86064/1‑149 (MQ=255) cTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGGCGAGTCCGACCCGCTGTTGc < 7:157737/149‑1 (MQ=255) ttGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGCCCCGCTGTTg > 2:315565/1‑147 (MQ=255) gCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCa < 5:394846/147‑1 (MQ=255) acaGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGgaa < 1:404480/149‑1 (MQ=255) cTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTg < 8:34774/139‑1 (MQ=255) cTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTg > 7:34774/1‑139 (MQ=255) cGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAgtg < 7:73955/148‑1 (MQ=255) tCGGGGGGCTTGCACAATTGCAAGCCCAAGCCGGGATCGACCAAGTGGCCGGCCACGGGGACGTAGGGAACCATGCCTCAGCGCGCGCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGGCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAgt < 1:330382/149‑1 (MQ=255) ggcggcCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTTCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTgg < 3:94972/149‑1 (MQ=255) ggcggcCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTgg < 8:127345/149‑1 (MQ=255) gcggcCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCNCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTggg > 1:129589/1‑149 (MQ=255) gcggcCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTggg < 8:349215/149‑1 (MQ=255) ccTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCcca < 5:175/149‑1 (MQ=255) cTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTgg < 4:145330/149‑1 (MQ=255) ttGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGc > 8:147411/1‑149 (MQ=255) catgccGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGt < 1:369585/149‑1 (MQ=255) gccGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTg > 6:90923/1‑147 (MQ=255) ccGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCa < 2:132325/148‑1 (MQ=255) ccGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAg < 6:151328/149‑1 (MQ=255) cGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAg > 8:189598/1‑148 (MQ=255) cggccAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTgcgc > 1:357039/1‑148 (MQ=255) cggccAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTgcgc > 5:346568/1‑148 (MQ=255) gccAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGCGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGAc > 6:17506/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGAcg > 3:243044/1‑149 (MQ=255) tGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCgctg < 6:346568/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCgctgct < 4:345033/149‑1 (MQ=255) aGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTgg > 5:60942/1‑105 (MQ=255) aGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTgg < 6:60942/105‑1 (MQ=255) aGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTc < 7:147411/149‑1 (MQ=255) aGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTc > 1:163454/1‑149 (MQ=255) aGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGGTTGGGCCCACCACCGTGGCCGGAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTc > 1:158526/1‑149 (MQ=255) gAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAgtgt > 6:184596/1‑85 (MQ=255) gAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGc < 8:7090/115‑1 (MQ=255) gAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGc > 7:7090/1‑115 (MQ=255) gAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCgg > 7:115330/1‑149 (MQ=255) gAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCgg > 1:372024/1‑149 (MQ=255) ggCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGCGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCt < 3:86064/149‑1 (MQ=255) caggcgtgcatcggctttgaacagctgagcgcgcgcctgCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCgg > 7:6233‑M2/40‑149 (MQ=255) ggcgtgcatcggccttgaacagctgagcgcgcgcctgCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGc > 1:395168‑M2/38‑148 (MQ=255) gcgtgcatcggccttgaacagctgagcgcgcgcctgCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACAAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGc > 6:40949‑M2/37‑147 (MQ=255) cgcgcTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCt < 2:129589/149‑1 (MQ=255) gcgcTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCt > 3:357171/1‑148 (MQ=255) gcTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGAc < 7:189598/149‑1 (MQ=255) aGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGACcg > 1:159528/1‑147 (MQ=255) ttCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGACCGCGACGc < 5:90923/148‑1 (MQ=255) aaGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGACCGCGACGCTGAt > 8:219377/1‑149 (MQ=255) gCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGACCGCGACGCTGATCgg > 2:334376/1‑149 (MQ=255) gCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGACCGCGACGCTGATCgg > 6:317733/1‑149 (MQ=255) cGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGACAGCGACGCTGATCGGc > 1:328482/1‑148 (MQ=255) gATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGACCGCGACGCTGATCGGCg > 8:335292/1‑148 (MQ=255) tGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGACCGCGACGCTGATCGGCGAAg > 7:107861/1‑149 (MQ=255) tGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGACCGCGACGCTGATCGGCGAAg > 2:86460/1‑149 (MQ=255) gCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGACCGCGACGCTGATCGGCGAAgg > 7:180753/1‑148 (MQ=255) cACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGACCGCGACGCTGATCGGCGAAGCg > 5:279561/1‑149 (MQ=255) gcctgCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGACCGCGACGCTGATCGGCGAAGCggag > 3:66363‑M2/6‑149 (MQ=255) gcctgCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGACCGCGACGCTGATCGGCGAAGCggag < 8:6233‑M2/144‑1 (MQ=255) | GCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGC‑‑‑‑GCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGCCTGCTGGTCGAGTCCGACCCGCTGTTGCAGGAAGAAGTGTTTGGGCCCACCACCGTGGCCGTAGAGGTGCAGGACAACGACCAACTGCGCGACGCGCTGCTCGGCCTGCGCGGCCAGCTGACCGCGACGCTGATCGGCGAAGCGGAG > NC_002947/4093996‑4094287 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |