New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4689025 | 71 (1.090) | 4 (0.060) | 4/256 | NT | 5.6% | coding (926/1020 nt) | PP_4149 | ABC transporter permease |
? | NC_002947 | = 4689062 | 65 (1.030) | coding (963/1020 nt) | PP_4149 | ABC transporter permease |
CATCGGCACCCTCACCGCCCTGGACTTCCTCGGCTTCGGCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCGGGGACCAGGTCAACCGGGTGGTGGACGGCGTC > NC_002947/4688915‑4689207 | cATCGGCACCCTCACCGCCCTGGACTTCCTCGGCTTCGGCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑Ga > 8:181271‑M2/1‑148 (MQ=255) tCGGCACCCTCACCGCCCTGGACTTCCTCGGCTTCGGCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑Gagc > 1:81844‑M2/1‑146 (MQ=255) ggCACCCTCACCGCCCTGGACTTCCTCGGCTTCGGCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGTTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCct > 6:260078/1‑149 (MQ=255) cccTCACCGCCCTGGACTTCCTCGGCTTCGGCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCctgctg > 6:236205/1‑149 (MQ=255) ccTCACCGCCCTGGACTTCCTCGGCTTCGGCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTgg < 5:314318/149‑1 (MQ=255) ccTCACCGCCCTGGACTTCCTCGGCTTCGGCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTgg > 7:261027/1‑149 (MQ=255) ccTCACCGCCCTAGACTTCCTCGGCTTCGGCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTgg > 8:266702/1‑149 (MQ=255) tCACCGCCCTGGACTTCCTCGGCTTCGGCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGgtg > 2:111611/1‑149 (MQ=255) cccTGGACTTCCTCGGCTTCGGCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTGGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCATCGCCTTTGACCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCAt < 1:277221/149‑1 (MQ=255) cTGGACTTCCTCGGCTTCGGCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCgg < 3:279662/149‑1 (MQ=255) gACTTCCTCGGCTTCGGCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCCAGCGCCATGGCTGGGAATCAGCGCATTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGa < 2:289695/149‑1 (MQ=255) gACTTCCTCGGCTTCGGCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGc < 6:110928/147‑1 (MQ=255) cTTCGGCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATccgcccgc > 4:50719/1‑148 (MQ=255) gCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGcc < 3:120636/149‑1 (MQ=255) tGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTc > 3:40340/1‑149 (MQ=255) cccGCCGGTTCGCCCTCGCTGCGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTc < 4:365264/147‑1 (MQ=255) cgGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGa < 7:266702/149‑1 (MQ=255) cgGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGa < 5:260078/149‑1 (MQ=255) cgGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGa < 5:29064/149‑1 (MQ=255) ggTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAg < 1:111611/149‑1 (MQ=255) gCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGt < 5:236205/149‑1 (MQ=255) ccTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGa < 3:50719/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACAt < 5:207310/148‑1 (MQ=255) gCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACAt < 7:190005/148‑1 (MQ=255) cGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTGCAACGGTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTTTTAATAGGCGAATACGCCCGCGACGCCTTAGACCCGAGGAAGTGACATGAGt > 1:330747/1‑148 (MQ=255) gAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAAc < 3:89957/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGa > 5:346434/1‑127 (MQ=255) cTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGa < 6:346434/127‑1 (MQ=255) gcAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATc > 2:168725/1‑149 (MQ=255) gcAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATc > 6:360731/1‑149 (MQ=255) gcAGGGCAAGACCAACCTGCAAGAGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCATTT‑ACGTGCAG‑‑GCGCTGATGCT‑CAGCCTGCTGCTGTTCATCGGCGAAACCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATc > 1:168485/1‑149 (MQ=255) aGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCctgc > 4:219395/1‑75 (MQ=255) aGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGa > 8:349697/1‑117 (MQ=255) aGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGa < 7:349697/117‑1 (MQ=255) gggTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTg < 1:80211/146‑1 (MQ=255) aaGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGATG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGc > 1:300034/1‑149 (MQ=255) aGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCg < 2:296934/149‑1 (MQ=255) gTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCTGGAGCCTTCTGGTGTTAATAGGCGAATCCGCCCCCGACCCCATAGACCCGAGGAAGTGAAATGAGTTAAAAGAACCAGATAGAAGTGCg > 1:116186/1‑149 (MQ=255) gTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCgg < 5:360731/149‑1 (MQ=255) tCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGAccc > 6:311683/1‑107 (MQ=255) tCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGAccc > 6:306178/1‑107 (MQ=255) tCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGAccc < 5:311683/107‑1 (MQ=255) tCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCgg > 1:371215/1‑148 (MQ=255) tCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGACTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGAccc < 5:306178/107‑1 (MQ=255) aaCCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGt < 1:381269/121‑1 (MQ=255) aaCCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGt > 2:381269/1‑121 (MQ=255) cTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTgg < 7:8584/149‑1 (MQ=255) cTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTgg < 7:2741/149‑1 (MQ=255) gCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGa > 7:360302/1‑101 (MQ=255) gCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGa < 8:360302/101‑1 (MQ=255) cAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCg > 7:85026/1‑149 (MQ=255) cAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCg < 2:330747/149‑1 (MQ=255) cAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GAGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGcc < 5:412468/148‑1 (MQ=255) aGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTg < 3:149654/149‑1 (MQ=255) cgcCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTGATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGTACAGAAGCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGa < 2:168485/149‑1 (MQ=255) gcCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑Gagccatggcgcttgcaggttggacttgccctgcgccaccagttcgcccagcgagggcgaaccggcgggcaggccgaag > 2:132709‑M2/1‑46 (MQ=255) gcCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑Gagccatggcgcttgcaggttggacttgccctgcgccaccagttcgcccagcgagggcgaaccggcgggcaggccgaag < 1:132709‑M2/124‑79 (MQ=255) ccATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGt > 8:5877/1‑149 (MQ=255) ccATGGCTGGGCAACAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑Gagccatggcgcttgcaggttggacttgccctccgccaccagttcgcccagcgagggcgaaccggcgggcagcccgaagccgaggaattccagggcgctgagggt < 7:155059‑M2/149‑105 (MQ=255) cATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCggg > 1:403065/1‑149 (MQ=255) cATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCggg < 4:40340/149‑1 (MQ=255) tCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGCCGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCGGGGa > 7:67249/1‑149 (MQ=255) tCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCC‑Cagccatggcgcttgcaggttggacttgccctgcgccaccagttagcccagcgagggcgaaccggcgggcaggccgaagccgaggaagtccagggcggtgagggtgccgatggcgccg < 7:343093‑M2/149‑118 (MQ=255) gcCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCGGGGACCAgg < 5:199424/149‑1 (MQ=255) cGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCGGGGACCAGGTCAACCgg < 2:403065/149‑1 (MQ=255) tGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCGGGTGTTCATCTGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCGGGGACCAGGTCAACCGggt < 8:361136/149‑1 (MQ=255) g‑‑gCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGaa < 3:399176/95‑1 (MQ=255) g‑‑gCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGaa > 4:399176/1‑95 (MQ=255) gcgcTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCGGGGACCAGGTc > 2:248127/1‑136 (MQ=255) gcgcTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCGGGGACCAGGTc < 1:248127/136‑1 (MQ=255) gcgcTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCCCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCGGGGACCAGGTCAACCGGgtggtg > 3:157929/1‑148 (MQ=255) gcTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCGGGGACCAGGTCAACCGGGTGGTGGAc > 1:216414/1‑149 (MQ=255) aTGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCGGGGACCAGGTCAACCgg < 8:238726/136‑1 (MQ=255) aTGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCGGGGACCAGGTCAACCgg > 7:238726/1‑136 (MQ=255) gCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCGGGGACCAGGTCAACCGGGTGGTGGACGGCGt > 2:198381/1‑148 (MQ=255) cT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCGGGGACCAGGTCAACCGGGTGGTGGACGGCGTc < 2:300034/148‑1 (MQ=255) | CATCGGCACCCTCACCGCCCTGGACTTCCTCGGCTTCGGCCTGCCCGCCGGTTCGCCCTCGCTGGGCGAACTGGTGGCGCAGGGCAAGTCCAACCTGCAAGCGCCATGGCTGGGCATCAGCGCCTTTG‑CCGTGCTG‑‑GCGCTGATGCT‑GAGCCTGCTGGTGTTCATCGGCGAATCCGCCCGCGACGCCTTCGACCCGAGGAAGTGACATGAGTGAACAGAACCTGATCGAAGTGCGGGACCTGGCCGTGGAGTTCGTGACCGGGGACCAGGTCAACCGGGTGGTGGACGGCGTC > NC_002947/4688915‑4689207 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |