Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,027,829 | C→A | 9.7% | A201S (GCC→TCC) | PP_3552 ← | two‑component system sensor histidine kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,027,829 | 0 | C | A | 9.7% | 217.9 / 4.9 | 74 | A201S (GCC→TCC) | PP_3552 | two‑component system sensor histidine kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/35); new base A (6/2); total (37/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.61e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTCGCGCGGATGCAGCAGGGTATGTACAGGCATG > NC_002947/4027685‑4027971 | tGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGAtt > 3:377300/1‑149 (MQ=255) cccGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGAttt < 6:263067/148‑1 (MQ=255) cccGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGAttt < 8:308328/148‑1 (MQ=255) ccGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCg < 8:230652/149‑1 (MQ=255) gAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGaa < 3:356033/149‑1 (MQ=255) gAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGaa < 5:40160/149‑1 (MQ=255) gAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGaa > 2:244388/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCaa > 6:104044/1‑149 (MQ=255) aGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGATCTAAATTTAGAACCAACg > 2:69795/1‑149 (MQ=255) tCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACgg > 5:4471/1‑147 (MQ=255) gCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCg > 2:144157/1‑136 (MQ=255) gCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCg < 1:144157/136‑1 (MQ=255) gggCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCg > 8:365877/1‑148 (MQ=255) ggCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTa > 6:342549/1‑149 (MQ=255) cACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGCCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTAcc > 4:35836/1‑149 (MQ=255) cgcCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCCTACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCa < 1:325475/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGTGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGt > 3:398197/1‑148 (MQ=255) cAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGTACACGCTGACCACCTCAACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCa > 1:400278/1‑149 (MQ=255) ggCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATc < 5:255031/149‑1 (MQ=255) gCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCg > 1:378814/1‑149 (MQ=255) gCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGATCTC‑‑ACTGATCGCCCTAAAATAAAAAACAAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCg > 6:364674/1‑149 (MQ=255) tCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCgtg < 1:244388/147‑1 (MQ=255) tCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGACAGGTCATCgtgt < 6:217258/148‑1 (MQ=255) ccTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGtgtg < 7:361895/148‑1 (MQ=255) cTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTgg < 7:365877/148‑1 (MQ=255) ttCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGcctc < 4:238811/107‑1 (MQ=255) ttCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGcctc > 3:238811/1‑107 (MQ=255) ttCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGt > 5:67602/1‑149 (MQ=255) cGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAAGGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTcc > 1:331580/1‑149 (MQ=255) gATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTcc < 8:162005/148‑1 (MQ=255) gATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTcc < 7:134071/148‑1 (MQ=255) aTGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGt < 1:277399/128‑1 (MQ=255) aTGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGt > 2:277399/1‑128 (MQ=255) aTGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTg < 2:378814/149‑1 (MQ=255) cgcAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTc < 6:132279/149‑1 (MQ=255) cAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCa < 6:67602/149‑1 (MQ=255) ggTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCTCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATc > 7:291538/1‑124 (MQ=255) ggTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCTCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATc < 8:291538/124‑1 (MQ=255) gATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGcctc > 3:137190/1‑92 (MQ=255) gATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGcctc < 4:137190/92‑1 (MQ=255) gTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAACCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAg > 7:319665/1‑149 (MQ=255) gcgGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCgg > 8:95654/1‑149 (MQ=255) gcgGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGATCTC‑‑AATGATCGCCCAAAAATAAAAAAAAAAAAAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCCTACACCGCAGGTCATCGTGAGGTCTCCGTCCTGGTCCCGCTCGGAAGCgg > 4:273349/1‑149 (MQ=255) cgGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGc < 5:364674/149‑1 (MQ=255) acGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGgcg < 3:35836/149‑1 (MQ=255) gCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCa < 5:342549/149‑1 (MQ=255) gCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGATCTC‑‑ACTGATCGCCCTAAAATAAAAAAAAAAAAAACGGTAGACTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGgcg > 6:363123/1‑147 (MQ=255) gACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTa < 3:140908/149‑1 (MQ=255) taccTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGAGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCt > 4:112573/2‑149 (MQ=255) accTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCt > 3:285951/1‑148 (MQ=255) cTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGAc > 2:269866/1‑149 (MQ=255) ccaccaCCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCgg < 4:54583/129‑1 (MQ=255) ccaccaCCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCgg > 3:54583/1‑129 (MQ=255) ccaccaCCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGAcgc > 7:201626/1‑149 (MQ=255) ccaccGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGAcgccgc < 2:331580/149‑1 (MQ=255) accgcaccgGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTc < 4:377300/149‑1 (MQ=255) ccgcaccgGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTcg > 3:176539/1‑149 (MQ=255) gcaccgGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTcgcg < 1:238700/149‑1 (MQ=255) gcgGTGTAGGTCTC‑‑ACTGATCGCCCGGCTGGAGATTTCGAACGAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTCGCGTTCCCGGCAGTTCATCGTGGTGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTCGCGCgg < 2:400278/148‑1 (MQ=255) cgGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCTAATATATATAAAAAAAAAACGTTAGCATCCTCTCGCCTGGCGTACCCGGCAGCTCATCGTGAGGAATCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTCGCGCGGa > 6:19742/1‑149 (MQ=255) cgGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTCGCGCGGa < 1:269866/149‑1 (MQ=255) ggTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTCGCGCGGAt < 8:201626/149‑1 (MQ=255) gtgtAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTCGCGCGGATg > 5:204871/1‑149 (MQ=255) tctc‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTCGCGCGGATGCAGCAgg > 7:170142/1‑149 (MQ=255) c‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGgcgc > 7:164144/1‑113 (MQ=255) c‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGgcgc < 8:164144/113‑1 (MQ=255) aCGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTCGCGCGGATGCAGCAgg > 1:190628/1‑145 (MQ=255) aCGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTCGCGCGGATGCAGCAgg < 2:190628/145‑1 (MQ=255) ggATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTCGCGCGGATGCAGCAGGGTATGt < 8:170142/149‑1 (MQ=255) aaaTCGCCAGCCGGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGCCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTCGCGCGGATGCAGCAGGGTATg > 3:171466/3‑148 (MQ=255) gCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCTTCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGTGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTCGCGCGGATGCAGCAGGGTATGTACAg < 7:232188/148‑1 (MQ=255) cccGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTCGCGCGGATGCAGCAGGGTATGTACAgg > 8:387241/1‑148 (MQ=255) ccGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTCGCGCGGATGCAGCAGGGTATGTACAGGCa > 7:185989/1‑149 (MQ=255) ttcTGGAGATTTCTAAGCAACGGTAGCCTCCTGTGGCCTGGGGTACCCGGCAGGTGATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGGCTGGCGGAGTACATGTCGACGCTCGCGCGGATGCAGGAGGGTATGTACAGGCATg < 4:398197/147‑1 (MQ=255) | TGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTC‑‑ACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCCTGGTCCAGCGCGGCAGCGGCCTGGCGCAGTACCTGACGCCGCTCGCGCGGATGCAGCAGGGTATGTACAGGCATG > NC_002947/4027685‑4027971 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |