Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,083,051 | G→C | 6.2% | G17A (GGT→GCT) | PP_3593 → | amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,083,051 | 0 | G | C | 6.2% | 203.7 / 3.7 | 64 | G17A (GGT→GCT) | PP_3593 | amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/29); new base C (2/2); total (33/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.35e-01 |
ACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATGCACGC > NC_002947/4082904‑4083194 | aCGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGt < 8:55821/149‑1 (MQ=255) ttGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTgccg > 6:325054/1‑149 (MQ=255) aaCTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCt > 5:373029/1‑149 (MQ=255) cTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGTGCAAACAACAATAGCAAGAGTTCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGC‑GCAGGCGGCACCCGCCAgcagcagg < 7:254233/149‑7 (MQ=255) ccGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAgcgtcgggtg > 6:167715/1‑142 (MQ=255) ccGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCCTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGATGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGTGTGCGTGCGCCCTGCTGCCGGCGGCACCCGCCAgcagcagg < 7:59692/147‑7 (MQ=255) ctctACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCGATGGCCTTGATTGGTGCGTGCGCGCTGCTGCTGGCGGGTGCCGGCAGCGCGGAACCCCt > 8:387297/1‑149 (MQ=255) ctctACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCt > 8:195059/1‑149 (MQ=255) cATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGt > 4:227261/1‑149 (MQ=255) cATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGGGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCg < 6:24675/147‑1 (MQ=255) aTAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGtt > 4:45736/1‑149 (MQ=255) aTAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTCCAATGAGGTGCGAGATGAAAAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCGGAAACCCTGCGGtt > 5:343381/1‑149 (MQ=255) gAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCa > 1:124558/1‑149 (MQ=255) aTTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCAcc > 5:361048/1‑149 (MQ=255) cgtcgGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAg > 4:92325/1‑149 (MQ=255) gtcgGCTACACCTCGTGGTCGACGTGCAAACAACAATAGCAAGATTGCAATTAGGTGCGATATGAACAAGTCAATGGCCTTGCTTGGTGCGTGCGCCCTGGTGCTGGCGGGTGCCGGCAGCGCTGAAACCCTTCGTTTCGCCACCGatg < 6:343381/149‑3 (MQ=255) gtcgGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAg < 3:227261/148‑1 (MQ=255) ggCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTgcc > 1:44505/1‑112 (MQ=255) ggCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTgcc < 2:44505/112‑1 (MQ=255) ggCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAg < 6:206837/117‑1 (MQ=255) ggCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAg > 5:206837/1‑117 (MQ=255) cTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCg > 4:389129/1‑149 (MQ=255) tGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCt < 5:227460/149‑1 (MQ=255) gACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGGGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAAc > 1:236920/1‑149 (MQ=255) gACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAAc < 7:195059/149‑1 (MQ=255) gACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAAc > 5:309132/1‑149 (MQ=255) ggCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATg < 3:389129/149‑1 (MQ=255) aaaCAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATg > 2:324589/1‑146 (MQ=255) aacaaTAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGc > 2:215153/1‑149 (MQ=255) caaTAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCg < 1:215153/149‑1 (MQ=255) cAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCATCTATGTAGACGCTGATAAc > 2:382592/1‑148 (MQ=255) agagTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCATCTATGTAGACGCTGATAACAAg < 1:382592/149‑1 (MQ=255) cAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCAc < 3:45736/149‑1 (MQ=255) aaTGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACg > 2:59951/1‑149 (MQ=255) ggTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCttt < 2:236920/149‑1 (MQ=255) gagaTGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATg > 4:240304/1‑148 (MQ=255) gagaTGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGt > 7:25033/1‑149 (MQ=255) agaTGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCGTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTc < 2:130724/149‑1 (MQ=255) agaTGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTc < 1:31914/149‑1 (MQ=255) agaTGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATATc < 2:124558/149‑1 (MQ=255) aTGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACa > 2:388784/1‑127 (MQ=255) aTGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACa < 1:388784/127‑1 (MQ=255) ccagcAAGGCCATGGACTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGa > 6:351273/5‑148 (MQ=255) gAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACa > 3:65851/1‑149 (MQ=255) agcAAGGCCATGGACTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACAt > 7:356105/3‑149 (MQ=255) gTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCa < 4:93559/146‑1 (MQ=255) gTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCa > 3:93559/1‑146 (MQ=255) cATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATg > 5:215366/1‑149 (MQ=255) ccTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCtg > 4:211932/1‑149 (MQ=255) cTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCTGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACGCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCtgt < 5:325054/149‑1 (MQ=255) cTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCtgt < 3:92325/149‑1 (MQ=255) ttGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCtgtg > 7:356280/1‑149 (MQ=255) gggTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAAc < 6:373029/149‑1 (MQ=255) ggTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAAc < 3:240304/148‑1 (MQ=255) ggTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTCAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGaa < 5:351273/147‑1 (MQ=255) gcgtgcgCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGAt < 2:325322/149‑1 (MQ=255) cgtgcgCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATg < 6:215366/149‑1 (MQ=255) cccTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTc < 3:211932/149‑1 (MQ=255) gcgctgGCGGCACCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATg > 2:149325/3‑149 (MQ=255) gcgctgGCGGCACCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATg > 5:42910/3‑149 (MQ=255) ctgctgGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAAt < 8:25033/148‑1 (MQ=255) ctgGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGc < 7:311491/119‑1 (MQ=255) ctgGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGc > 8:311491/1‑119 (MQ=255) gCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATGCACGc < 8:356280/148‑1 (MQ=255) gggTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGAc < 5:308721/103‑1 (MQ=255) gggTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGAc > 6:308721/1‑103 (MQ=255) | ACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATGCACGC > NC_002947/4082904‑4083194 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |