| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,781,474 | A→T | 6.6% | L1947Q (CTG→CAG) | pvdJ ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,781,474 | 0 | A | T | 6.6% | 231.2 / 4.8 | 76 | L1947Q (CTG→CAG) | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/34); new base T (3/2); total (40/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.31e-01 | |||||||||||
TCCGGGGCACTGCCAGGAAGGGCGGCGGCCACAGCATGGAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTC > NC_002947/4781327‑4781619 | tCCGGGGCACTGCCAGGAAGGGCGGCGGCCACAGCATGGAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAg > 5:337526/1‑149 (MQ=255) cACTGCCAGGAAGGGCGGCGGCCACAGCATGGAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGc < 6:81681/149‑1 (MQ=255) ccAGGAAGGGCGGCGGCCACAGCATGGAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCt > 1:206580/1‑148 (MQ=255) ccAGGAAGGGCGGCGGCCACAGCATGGAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCt > 2:224166/1‑148 (MQ=255) ccAGGAAGGGCGGCGGCCACAGCATGGAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTc < 8:25559/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGGGCGGCGGCCACAGCATGGAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCTGGGCCTGCACCtgt < 2:373011/149‑3 (MQ=255) gAAGGGCGGCGGCCACAGCATGGAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCa < 8:251258/141‑1 (MQ=255) gAAGGGCGGCGGCCACAGCATGGAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCa > 7:251258/1‑141 (MQ=255) gcggcggcCACAGCATGGAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTa < 6:337526/149‑1 (MQ=255) gcggcggcCACAGCATGGAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTa < 7:160592/149‑1 (MQ=255) caGCATGGAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAgg < 7:207281/119‑1 (MQ=255) caGCATGGAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAgg > 8:207281/1‑119 (MQ=255) gCATGGAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGt > 3:348382/1‑149 (MQ=255) ggAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGc > 7:552/1‑149 (MQ=255) gTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCggg > 2:273984/1‑148 (MQ=255) tCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTa < 4:348382/149‑1 (MQ=255) cgcgTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCTGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGt > 6:54023/1‑149 (MQ=255) cgcgTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGt > 2:285436/1‑149 (MQ=255) cgTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTg < 2:2361/149‑1 (MQ=255) tCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCCGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGgt < 6:191834/149‑1 (MQ=255) tCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAACCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCGGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGgt < 3:25315/149‑1 (MQ=255) cAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGgtgt < 6:377935/149‑1 (MQ=255) aGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGtgtg > 5:354752/1‑149 (MQ=255) aGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGACGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGtgtg > 7:187219/1‑149 (MQ=255) gctgctCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGACGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTgtgc < 8:187219/149‑1 (MQ=255) gctcAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCgg > 4:18298/1‑108 (MQ=255) gctcAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCgg < 3:18298/108‑1 (MQ=255) ggCCAGCAACAAAACCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTcc > 4:235780/1‑149 (MQ=255) ccAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCa < 4:17105/149‑1 (MQ=255) cAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAg > 1:251781/1‑149 (MQ=255) cAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCACCACCACACGCGGGTACCCCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAg > 1:333925/1‑149 (MQ=255) aaaGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGAc > 6:192516/1‑149 (MQ=255) ccGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCa > 5:356584/1‑149 (MQ=255) ggAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGTGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATg > 1:33517/1‑149 (MQ=255) ggAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATg < 6:354752/149‑1 (MQ=255) aaGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGt > 8:91357/1‑149 (MQ=255) aGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTc < 3:175901/149‑1 (MQ=255) agccagcAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGaa < 4:6331/148‑1 (MQ=255) gccagcAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGc < 5:192516/149‑1 (MQ=255) agcaCGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGgc < 6:356584/149‑1 (MQ=255) agcaCGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGgc < 2:251781/149‑1 (MQ=255) agcaCGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGgc < 1:273984/149‑1 (MQ=255) gCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGACGAAGCCTGGGCGCCaa > 8:263632/1‑149 (MQ=255) tGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACg > 5:357188/1‑149 (MQ=255) aTGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGcc > 4:297626/1‑114 (MQ=255) aTGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGcc < 3:297626/114‑1 (MQ=255) tGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTg < 7:29415/149‑1 (MQ=255) gTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGa > 6:15947/1‑149 (MQ=255) gcTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCTGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCa < 5:54023/149‑1 (MQ=255) gcTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCa > 1:386232/1‑149 (MQ=255) cTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCAc < 2:386232/149‑1 (MQ=255) tGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACg > 5:159953/1‑149 (MQ=255) tGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGCTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACg > 1:229184/1‑149 (MQ=255) tCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACggg < 2:206580/149‑1 (MQ=255) gAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGgcg > 3:265193/1‑149 (MQ=255) aCAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGGGAGCGGGGAGTTGGTGTGGGTGCGCGAACTCCCCGCCTTGACCTTCAAGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCGGGCCGCCACGGGcgcg > 6:63484/1‑149 (MQ=255) aGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGTGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGtt > 6:44504/1‑149 (MQ=255) aGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTg < 1:316718/132‑1 (MQ=255) aGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTg > 2:316718/1‑132 (MQ=255) ggCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACACGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTtc < 6:6339/149‑1 (MQ=255) gCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTg > 5:61438/1‑130 (MQ=255) gCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTg < 6:61438/130‑1 (MQ=255) gCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTtct > 8:252894/1‑149 (MQ=255) ggTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTcgaa < 5:15947/148‑1 (MQ=255) ggTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTcgaa < 8:552/148‑1 (MQ=255) gTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTcgaaca > 1:121742/1‑149 (MQ=255) gTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTcgaaca < 7:91357/149‑1 (MQ=255) tCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTcgaacac < 1:224166/149‑1 (MQ=255) aTACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCTTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTcgaacacga < 3:235780/149‑1 (MQ=255) aCGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTcgaacacgaa > 2:219524/1‑148 (MQ=255) aCGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTcgaacacgaa > 4:108770/1‑148 (MQ=255) gaGGTGCTGGGCCTGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGc > 1:113957/2‑149 (MQ=255) gTGCTGGGCCTGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCTCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGt > 6:32924/1‑149 (MQ=255) gTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGt > 6:358096/1‑149 (MQ=255) gTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGt > 2:12117/1‑149 (MQ=255) tGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTc < 3:108770/149‑1 (MQ=255) | TCCGGGGCACTGCCAGGAAGGGCGGCGGCCACAGCATGGAAGTCCGCGTCCAGCTGCTCGCTCAAGGCCAGCAACAAAGCCCGGAAGTCAGCCAGCAGCACGCTGATGGTCGCGCTGTCGAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTC > NC_002947/4781327‑4781619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |