| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,972,881 | A→T | 5.0% | F223I (TTT→ATT) | flgL ← | flagellar hook‑associated protein FlgL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,972,881 | 0 | A | T | 5.0% | 247.2 / 2.0 | 79 | F223I (TTT→ATT) | flgL | flagellar hook‑associated protein FlgL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/40); new base T (2/2); total (37/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 | |||||||||||
GCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCTGTAGCCGGTGTCGTTGGTCGC > NC_002947/4972737‑4973028 | gCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGa < 3:117086/149‑1 (MQ=255) gaTCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGc < 6:320680/149‑1 (MQ=255) atcatcTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGcc > 8:192321/1‑149 (MQ=255) atcatcTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGAACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGcc < 4:341849/149‑1 (MQ=255) atcTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAATCAGTTTGCCgct < 8:15862/149‑3 (MQ=255) atcTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCg > 7:277077/1‑147 (MQ=255) cTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGc < 6:251263/143‑1 (MQ=255) cTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGc > 5:251263/1‑143 (MQ=255) cTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAgg > 4:320921/1‑149 (MQ=255) ttGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTAGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAggt > 3:314076/1‑149 (MQ=255) gccgccTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAggtg < 3:340963/148‑1 (MQ=255) gccgccTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAg < 7:192321/145‑1 (MQ=255) ccgacTTCGGTATTCACGTCGAACTTGCCCTTTCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGAACTGCTGAAGCTGACAGAATACTGCTGACCACCCGCAAAATCATTGCCGAAggtggt > 4:206855/1‑149 (MQ=255) cgccTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGGTGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGgtggtg > 4:101970/1‑149 (MQ=255) gccTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGt < 8:123048/140‑1 (MQ=255) gccTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGt > 7:123048/1‑140 (MQ=255) cTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGcc > 3:133263/1‑149 (MQ=255) cGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCg < 1:104058/147‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cccttgccGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAg < 3:206855/149‑1 (MQ=255) gcggTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCtt < 7:314119/149‑1 (MQ=255) cggTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTg < 5:345469/149‑1 (MQ=255) gTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAg < 8:357287/137‑1 (MQ=255) gTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAg > 7:357287/1‑137 (MQ=255) gTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGcc < 8:277077/149‑1 (MQ=255) gTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGcc < 7:352573/149‑1 (MQ=255) cATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTc < 2:266332/148‑1 (MQ=255) aTTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGACGTCAt > 3:248228/1‑149 (MQ=255) tGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGc < 4:3439/149‑1 (MQ=255) tGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACATTGCCGTAATCCGGc > 4:251821/1‑149 (MQ=255) gATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGc > 6:293126/1‑148 (MQ=255) tCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACgg < 3:107483/149‑1 (MQ=255) tCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACgg > 7:220361/1‑149 (MQ=255) cATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGt > 5:288387/1‑149 (MQ=255) aTTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTg > 5:140753/1‑149 (MQ=255) ccGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTAc < 3:320921/149‑1 (MQ=255) cATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑TGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTc < 4:389274/149‑1 (MQ=255) aTCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACgg > 2:207124/1‑135 (MQ=255) aTCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACgg < 1:207124/135‑1 (MQ=255) ccTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACt > 7:122859/1‑149 (MQ=255) ccTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACt > 1:147319/1‑149 (MQ=255) ccTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTAACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAACCTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACt > 1:378302/1‑149 (MQ=255) tCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACt < 1:123291/147‑1 (MQ=255) tCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACt > 2:123291/1‑147 (MQ=255) aCGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGt < 1:83644/149‑1 (MQ=255) aCGCTGTACTCGGTGGCACTGGGGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTggg < 6:140753/148‑1 (MQ=255) tCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCtgtt > 3:34273/1‑149 (MQ=255) gCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTtggt < 8:220361/149‑1 (MQ=255) aCTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCAt < 5:138978/101‑1 (MQ=255) aCTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCAt > 6:138978/1‑101 (MQ=255) aCTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTtggtgg > 6:344593/1‑149 (MQ=255) gTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGcc < 2:147319/147‑1 (MQ=255) gTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTg > 5:256876/1‑149 (MQ=255) gTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGa > 2:283256/1‑148 (MQ=255) aCAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGaaaa < 1:283256/148‑1 (MQ=255) cAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATg < 6:256876/149‑1 (MQ=255) aGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCgg < 5:68223/121‑1 (MQ=255) aGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCgg > 6:68223/1‑121 (MQ=255) gAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATg < 3:219039/147‑1 (MQ=255) gAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATg > 4:219039/1‑147 (MQ=255) gAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCt < 6:288387/149‑1 (MQ=255) gAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCt < 5:344593/149‑1 (MQ=255) aaTACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCTg > 2:39725/1‑149 (MQ=255) gCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCTGTAGCCg < 8:277856/149‑1 (MQ=255) ccacctacGGCAATCAGTTTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCTGTAGCCgg > 1:89526/8‑149 (MQ=255) ccAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGAc < 2:353690/81‑1 (MQ=255) ccAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGAc > 1:353690/1‑81 (MQ=255) ctacGGCAATCAGTTTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCt < 4:338605/83‑1 (MQ=255) ctacGGCAATCAGTTTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCt > 3:338605/4‑86 (MQ=255) aaCTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCTGTAGCCGGTGTCGTTGGTCGc > 8:377397/1‑149 (MQ=255) | GCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACA‑GGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCTGTAGCCGGTGTCGTTGGTCGC > NC_002947/4972737‑4973028 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |