| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,975,249 | T→A | 6.9% | T119S (ACT→TCT) | flgK ← | flagellar hook‑associated protein FlgK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,975,249 | 0 | T | A | 6.9% | 193.3 / 3.0 | 67 | T119S (ACT→TCT) | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/34); new base A (3/2); total (31/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGGCCGGCCATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTGGCCGTCTGCAGCTGGTTGTCCAG > NC_002947/4975101‑4975393 | tGGCCGGCCATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGt > 2:248063/1‑149 (MQ=255) gccggccATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGTGTCAGCTGGGTGCTCACCTCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTc < 4:17033/148‑1 (MQ=255) ggccATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGATAGTGAACGGTTGCTCAGGGTTTGCCCATGGTACAGCAGCACATGGCGCGAGCCAACGACACCCGCATACGCCGCCGCAGACTg > 1:126086/1‑149 (MQ=255) tgtCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCgag < 2:53051/149‑1 (MQ=255) tCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AATCGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGagaa < 1:288985/149‑1 (MQ=255) gAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGagaaga < 5:117231/149‑1 (MQ=255) gAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGagaag > 4:100355/1‑148 (MQ=255) aGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAgaagaa < 3:100355/149‑1 (MQ=255) ggAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCg < 1:248063/148‑1 (MQ=255) aGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGt > 6:310842/1‑148 (MQ=255) gTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTaa < 6:22323/149‑1 (MQ=255) aTCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑c < 8:247567/149‑1 (MQ=255) gTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑cc > 1:354040/1‑147 (MQ=255) gTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACACGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑cc > 6:195925/1‑147 (MQ=255) tGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCgg > 6:76335/1‑138 (MQ=255) tGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCgg < 5:76335/138‑1 (MQ=255) cGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTg < 7:357058/149‑1 (MQ=255) gctgGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCg > 2:70538/1‑149 (MQ=255) ggTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGgtgt > 1:189953/1‑149 (MQ=255) ggTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGgt < 3:339748/147‑1 (MQ=255) ggTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCg < 1:3897/149‑1 (MQ=255) gTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGc > 8:376006/1‑149 (MQ=255) gTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGc < 5:301525/149‑1 (MQ=255) gCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCTCCGCCGCAGTCTGCAg < 8:29914/96‑1 (MQ=255) gCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAg > 7:29914/1‑96 (MQ=255) cTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGTcag < 2:16859/149‑1 (MQ=255) ccGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCTCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGt < 2:189953/149‑1 (MQ=255) cggg‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCTCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGtt < 5:314155/146‑1 (MQ=255) cgcg‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGtt > 4:285491/1‑149 (MQ=255) g‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGt < 1:70538/149‑1 (MQ=255) aaaCGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGAc > 2:175034/1‑149 (MQ=255) aaCGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACg > 8:260410/1‑149 (MQ=255) tCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGtgatc > 7:298681/1‑149 (MQ=255) aGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGtgatct > 6:96573/1‑148 (MQ=255) tttGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATcc > 8:44419/1‑149 (MQ=255) gcgcCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTg < 5:310842/148‑1 (MQ=255) cgcCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTgg > 1:355402/1‑148 (MQ=255) gcCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGaa < 2:355402/149‑1 (MQ=255) gcCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGaa < 4:186847/149‑1 (MQ=255) cTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTg > 5:11009/1‑130 (MQ=255) cTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTg < 6:11009/130‑1 (MQ=255) cTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACg > 5:116978/1‑149 (MQ=255) ggTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCa < 8:298681/149‑1 (MQ=255) tCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCAcc > 6:311256/1‑149 (MQ=255) gcagcagcTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGagaaga > 7:75482/1‑63 (MQ=255) gcagcagcTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGagaaga < 8:75482/63‑1 (MQ=255) gcagcagcTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAg > 7:100994/1‑149 (MQ=255) cagcagcTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGt < 7:376006/149‑1 (MQ=255) gcgcGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGtgatc > 7:116656/1‑118 (MQ=255) gcgcGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGtgatc < 8:116656/118‑1 (MQ=255) gcgAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAAc < 6:116978/149‑1 (MQ=255) gAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAAc > 4:160289/1‑147 (MQ=255) gCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGt < 1:175034/149‑1 (MQ=255) aaCGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTgg > 4:367611/1‑149 (MQ=255) cGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTGGcc < 5:311256/149‑1 (MQ=255) gTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTGGCCg > 4:122992/1‑149 (MQ=255) cGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTGGCCGTCTGCa < 5:96573/149‑1 (MQ=255) cTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTGGCCGTCTGCAGCt < 2:354040/149‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTGGCCGTCTGCAGCTg > 5:337885/1‑149 (MQ=255) ggcgctgcAGACTGCGGCGGCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTgg < 2:395867/131‑1 (MQ=255) ggcgctgcAGACTGCGGCGGCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTgg > 1:395867/3‑133 (MQ=255) gccgccgcATTCTGCAGGGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGATCTGATTCCGTTTTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGTAACGTCAACGAGTCTGCCTGCAACGAGGTGGCCGTCTGCAGCTGGtt < 7:255601/149‑1 (MQ=255) gccgccgcAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTGGCCGTCTGCAGCTGGtt > 5:132244/1‑149 (MQ=255) gcgctgcAGACTGCGGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTGGCCGTCTGCAGCTGGTTg > 6:332469/2‑149 (MQ=255) ccgccgcAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTGGCCGTCTGCAGCTGGTTg > 3:219495/1‑149 (MQ=255) cgccgcAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTGGCCGTCTGCAGCTGGTTGt < 3:367611/149‑1 (MQ=255) gcATTCTGCAGCGCCGAGTAGAAGGCGTTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTGGCCGTCTGCAGCTGGTTGTCCAg < 5:195925/149‑1 (MQ=255) cAGACTGCGGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTGGCCGTCTGCAGCTGGTTGTCCa < 5:332469/147‑1 (MQ=255) tCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTctgcct > 4:273646/1‑111 (MQ=255) tCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTctgcct < 3:273646/111‑1 (MQ=255) | TGGCCGGCCATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCG‑TTG‑AAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGA‑CCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCACCGAGTCTGCCTGCAACGAGGTGGCCGTCTGCAGCTGGTTGTCCAG > NC_002947/4975101‑4975393 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |