| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,090,047 | A→G | 10.3% | L297P (CTG→CCG) | astA‑II ← | arginine N‑succinyltransferase subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,090,047 | 0 | A | G | 10.3% | 177.9 / 10.8 | 68 | L297P (CTG→CCG) | astA‑II | arginine N‑succinyltransferase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/29); new base G (3/4); total (35/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.00e-01 | |||||||||||
GTCTGTTGCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTAGTGCTC > NC_002947/5089902‑5090195 | gTCTGTTGCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGc < 2:357560/149‑1 (MQ=255) ttGCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTg > 2:92017/1‑149 (MQ=255) ttGCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGACTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGtt < 1:67274/148‑1 (MQ=255) ccAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACGGCCTGTTGca < 5:138373/148‑1 (MQ=255) ccAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACGGCCTGTTGca < 3:104028/148‑1 (MQ=255) aGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACGGCCTGTTGcagga < 5:205083/149‑4 (MQ=255) cTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAgg > 8:316794/1‑149 (MQ=255) aaaCCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAgg > 6:181794/1‑131 (MQ=255) aaaCCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAgg < 5:181794/131‑1 (MQ=255) aCCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACgg < 5:94616/149‑1 (MQ=255) aCCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACgg < 7:56614/149‑1 (MQ=255) cgcgACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACGGCCTGTTGcag > 8:307515/1‑135 (MQ=255) cgcgACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACGGCCTGTTGcag < 7:307515/136‑2 (MQ=255) gcgACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACCCCAGGTACGGgcg > 3:229032/1‑149 (MQ=255) gcgACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGgcg > 6:7453/1‑149 (MQ=255) gcgcACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACAGCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCtt > 1:333289/1‑149 (MQ=255) gcgcACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAg < 5:297832/132‑1 (MQ=255) gcgcACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAg > 6:297832/1‑132 (MQ=255) gcACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACgg > 5:329740/1‑136 (MQ=255) gcACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACgg < 6:329740/136‑1 (MQ=255) gCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCg > 1:94142/1‑149 (MQ=255) tGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCggg < 2:94142/149‑1 (MQ=255) gcgcCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCggg < 6:42030/147‑1 (MQ=255) cTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCtt < 8:223864/149‑1 (MQ=255) aCCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGTCTGACCGGATTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGa > 2:369113/1‑149 (MQ=255) ccACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATc > 6:130036/1‑149 (MQ=255) ccACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATc < 6:267522/149‑1 (MQ=255) ccACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATc > 5:166974/1‑149 (MQ=255) cGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTc < 3:98433/149‑1 (MQ=255) cccAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCggg > 6:360636/1‑132 (MQ=255) cccAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCggg < 5:360636/132‑1 (MQ=255) ccAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCAcc > 5:197533/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCAcc < 5:221557/149‑1 (MQ=255) gTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGcacca > 8:74367/1‑149 (MQ=255) tgctgcCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATc < 1:393600/130‑1 (MQ=255) tgctgcCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATc > 2:393600/1‑130 (MQ=255) ccACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTgg < 1:92017/149‑1 (MQ=255) ccACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTgg > 7:13124/1‑149 (MQ=255) cACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTggg < 6:197533/149‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTggg > 4:7132/1‑148 (MQ=255) aCGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTggg < 3:7132/148‑1 (MQ=255) tCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTCCAACAGGCCGTTGCACACAAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGCCTCTCGGCGATc > 2:334225/1‑149 (MQ=255) ggCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAg < 5:224418/149‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCgg > 4:280219/1‑102 (MQ=255) gCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCgg < 3:280219/102‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGc > 3:26132/1‑149 (MQ=255) tGACCGGCTTGCCGGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCg > 7:384381/1‑148 (MQ=255) ccGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATg > 6:406205/1‑149 (MQ=255) aGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTgc > 8:385139/1‑149 (MQ=255) gCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTgcgc > 1:105434/1‑149 (MQ=255) aCCCAGTCCAGGTCCAGCAACCCCGCGCGGTAGTCATCCAACAGCCCGTTCCACACCAGTTACGGGCGCCCGCCTTTGCCCGGGGCATCTACGATCTTCACCGGCCCCCCCCGCCAATGGGCGATCAAGCGGATGCCACAGGTgcgcg > 6:38547/1‑148 (MQ=255) ccAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCAt < 2:105434/149‑1 (MQ=255) gtccaggtccagCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTg > 8:89566/1‑46 (MQ=255) gtccaggtccagCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTg < 7:89566/46‑1 (MQ=255) aggtccagCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGt < 7:316794/149‑1 (MQ=255) cagCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCggg < 6:166974/148‑1 (MQ=255) agCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGgcc < 7:74367/149‑1 (MQ=255) gCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGgccg > 8:225759/1‑149 (MQ=255) gcgcgGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGaa < 4:26132/149‑1 (MQ=255) ggTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCTGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGCTGCGCGCATCCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATg > 5:78551/1‑149 (MQ=255) tggtgtGCAACGGCCTGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGCTGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTc > 8:298711/6‑148 (MQ=255) gTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGa < 5:7453/149‑1 (MQ=255) gtGCAACGGCCTGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGt > 3:53973/2‑149 (MQ=255) cTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGACCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATg > 3:242612/1‑148 (MQ=255) cAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCATAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTAg < 1:369113/148‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGa < 2:69906/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGa > 1:69906/1‑136 (MQ=255) aaCAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTAGTg > 2:20403/1‑149 (MQ=255) aGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTAGTGCTc > 6:218690/1‑149 (MQ=255) | GTCTGTTGCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTAGTGCTC > NC_002947/5089902‑5090195 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |