| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,137,445 | A→G | 5.6% | C53R (TGC→CGC) | PP_4522 ← | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,137,445 | 0 | A | G | 5.6% | 205.8 / 2.1 | 71 | C53R (TGC→CGC) | PP_4522 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/34); new base G (2/2); total (35/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.45e-01 | |||||||||||
CAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTC > NC_002947/5137301‑5137593 | cAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGGGGCGGCATACTGCTCGAAACGGTCCAGCTCTTCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCacaac < 6:221450/149‑1 (MQ=255) ggTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAacac > 1:87481/1‑148 (MQ=255) ggTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACg < 4:187548/149‑1 (MQ=255) cACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATa > 8:101656/1‑140 (MQ=255) cACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATa < 7:101656/140‑1 (MQ=255) cgccGCCCTGAAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTc > 1:26594/4‑148 (MQ=255) ccGCCCTGAAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAg > 2:1189/2‑149 (MQ=255) gCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCt > 8:170041/1‑149 (MQ=255) ccTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTgg < 2:229382/149‑1 (MQ=255) ccTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTgg > 3:71622/1‑149 (MQ=255) ccTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTgg > 3:93031/1‑149 (MQ=255) ccTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTgg < 4:210404/149‑1 (MQ=255) ccTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTgg < 5:163562/149‑1 (MQ=255) ccTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTgg < 2:87481/149‑1 (MQ=255) ccTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTgg > 6:73390/1‑149 (MQ=255) ccTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTgg < 8:25020/149‑1 (MQ=255) ccTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTgg > 1:96497/1‑149 (MQ=255) cTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGc < 7:281133/149‑1 (MQ=255) gcATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACt > 1:405075/1‑149 (MQ=255) tACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGAt < 7:41493/149‑1 (MQ=255) gCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGCCCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGcc > 2:112062/1‑149 (MQ=255) cctCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGAc < 8:366880/147‑1 (MQ=255) gTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGa > 2:288206/1‑147 (MQ=255) gTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACa < 4:93031/149‑1 (MQ=255) gTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACa < 7:156532/149‑1 (MQ=255) ccAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCt < 8:163435/108‑1 (MQ=255) ccAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCt > 7:163435/1‑108 (MQ=255) aGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGtt < 5:73390/149‑1 (MQ=255) cGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGtt > 2:407142/1‑145 (MQ=255) cGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGtt < 1:407142/145‑1 (MQ=255) ggCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAg < 2:405075/147‑1 (MQ=255) ggCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGc < 5:22173/148‑1 (MQ=255) ggCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGc < 2:273233/148‑1 (MQ=255) cagcagGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTcgc < 1:1189/149‑1 (MQ=255) agcagGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTcgcg > 4:342403/1‑149 (MQ=255) tgggttCCTGATGGAACATCTCGCCCTTGCCGGTGATGCCTAAGGCCCCCCGACCCCGGTGGCAAAACCCGATACCCAAGGCCCCCTCCATCTGGCTCATGTTCCGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGtt < 1:288206/145‑1 (MQ=255) gctttCCTGATGGAACACCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACACCACGAGACCCAAGGCCACCTCCAGCTGGAGCATG‑TAGGTACTGAGGGCCGAGCTCGCCAGGTACAGCTCGCGCGGGGCGTTgc > 4:254571/3‑148 (MQ=255) tttCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCGCAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGc > 1:180938/1‑148 (MQ=255) tttCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGc > 4:119060/1‑148 (MQ=255) tttCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGc > 5:187855/1‑148 (MQ=255) tCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCAGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTGCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGAGGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCa > 6:78148/1‑147 (MQ=255) ccTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCaaa < 2:96497/148‑1 (MQ=255) cTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGc > 4:116610/1‑149 (MQ=255) aTGGAACAGCTCGCCCTTTCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGcc < 6:187855/147‑1 (MQ=255) tGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCTTTGCCAACGccca < 4:71622/148‑2 (MQ=255) gAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGACGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCtggt < 1:293152/149‑1 (MQ=255) aaCAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCtggtg > 6:39837/1‑149 (MQ=255) aGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGAc > 4:361939/1‑108 (MQ=255) aGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGAc < 3:361939/108‑1 (MQ=255) gCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGcacca > 1:42483/1‑149 (MQ=255) cTGGTCAGGCTGAAGCCCGCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCtga < 2:26594/148‑1 (MQ=255) ggTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTg > 3:151555/1‑118 (MQ=255) tCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCTAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑t > 4:295291/1‑69 (MQ=255) tCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCTAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑t < 3:295291/69‑1 (MQ=255) tCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCtgatg > 4:91752/1‑146 (MQ=255) cAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCtgatg > 3:142360/1‑145 (MQ=255) aGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGa < 2:42483/148‑1 (MQ=255) aGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGAt < 3:91752/149‑1 (MQ=255) gCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCgcgc > 6:86886/1‑103 (MQ=255) gCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCgcgc < 5:86886/103‑1 (MQ=255) tGAAGCCCCCCCAACCCCGGTGGCGCAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCtgat < 7:357467/139‑1 (MQ=255) tGAAGCCCCCCCAACCCCGGTGGCGCAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCtgat > 8:357467/1‑139 (MQ=255) gCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCgcag > 2:119229/1‑147 (MQ=255) cccccccGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCTTG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCAGGCTGATGAAGCTGCGcagcag > 3:210365/1‑149 (MQ=255) ccccGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGtt > 3:241097/1‑148 (MQ=255) cccGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGttt > 6:27980/1‑148 (MQ=255) cccGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGttt > 5:282419/1‑148 (MQ=255) ccccGGTGGCGCAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTc < 2:180938/149‑1 (MQ=255) gcGGTGGCACACCACGATACCCCAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGGCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCACAGCCCTGGTGGCGCACGACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCgg < 3:254571/148‑1 (MQ=255) cGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCggg < 1:112062/149‑1 (MQ=255) ggTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGc < 6:258523/149‑1 (MQ=255) ggCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAg < 4:142360/149‑1 (MQ=255) acaacaCGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCgcagca > 2:362301/1‑129 (MQ=255) acaacaCGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCgcagca < 1:362301/129‑1 (MQ=255) acaacaCGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTGAGGTCGGGCAAGGTc > 1:401689/1‑149 (MQ=255) | CAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATG‑TAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTC > NC_002947/5137301‑5137593 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |