| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,137,665 | A→G | 6.6% | intergenic (‑64/‑149) | PP_4522 ← / → PP_4523 | LysR family transcriptional regulator/agmatinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,137,665 | 0 | A | G | 6.6% | 216.2 / 4.8 | 75 | intergenic (‑64/‑149) | PP_4522/PP_4523 | LysR family transcriptional regulator/agmatinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/39); new base G (2/3); total (33/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.77e-01 | |||||||||||
GCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATCGACC > NC_002947/5137518‑5137808 | gcgcTGGGCGTTGGCAAAGCCCTTGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGa < 1:119229/148‑1 (MQ=255)gcgcTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCTCGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGa < 5:319284/148‑1 (MQ=255)gcgcTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGa > 5:212622/1‑148 (MQ=255) cGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTg > 6:376278/1‑148 (MQ=255) cGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGa < 2:333187/149‑1 (MQ=255) gCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTaa < 1:269582/149‑1 (MQ=255) gCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTaa < 3:140232/149‑1 (MQ=255) gCAAAGCCATGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCTCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGTTTACACAAGGGTATGTGCGCGCTGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTaa < 1:326117/149‑1 (MQ=255) aaaGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGG‑AATTTCTGAACTaaag < 4:65426/149‑3 (MQ=255) aaaGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑t < 5:376278/149‑1 (MQ=255) aGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTGAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TAt < 2:401689/149‑1 (MQ=255) aGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGG‑AATTTCTGAACTaaagg < 1:293511/149‑4 (MQ=255) aGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGG‑AATTTCTGAACTaaaggc < 7:275880/149‑5 (MQ=255) 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caagCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGGCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGAttc < 4:241097/146‑1 (MQ=255) cGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGAttctt < 2:40428/149‑1 (MQ=255) attaaGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTccc < 4:216150/144‑1 (MQ=255) atgaAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCg > 1:368665/1‑149 (MQ=255) gaAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGAttcttc < 4:21560/143‑1 (MQ=255) gaAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGAttcttc > 3:21560/1‑143 (MQ=255) gaAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGgc > 2:302353/1‑149 (MQ=255) aGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTTTGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑TATTCCTGAAGTATG‑TTTTTTTCGGTAGGGATTCTTCACCGgcgg > 3:327048/1‑148 (MQ=255) gcagTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAg < 3:92348/149‑1 (MQ=255) ggTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTgt > 8:90693/1‑148 (MQ=255) gTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTc > 8:300441/1‑108 (MQ=255) gTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTc < 7:300441/108‑1 (MQ=255) tagggCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAGTTATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGc < 1:94077/147‑1 (MQ=255) tCGGGCAATGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTTCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGACAATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGc < 1:324876/149‑1 (MQ=255) ggCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGa > 3:260044/1‑148 (MQ=255) cAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAAt < 2:368665/149‑1 (MQ=255) tCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTccc > 1:197742/1‑149 (MQ=255) tCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTccc > 4:55832/1‑149 (MQ=255) gCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGccc < 3:262273/149‑1 (MQ=255) cATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCccgc > 8:173236/1‑149 (MQ=255) aTGGGGCAACGGGTCCACAAGCGAATGTGCGCGCAGA‑CTAACAGCGCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGGCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCccgcc < 4:210365/149‑1 (MQ=255) gTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCgg < 6:282419/148‑1 (MQ=255) cAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCaaa > 5:54181/1‑149 (MQ=255) aCGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAAc > 6:350442/1‑148 (MQ=255) cagaaGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCTCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCGCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACAGGt < 6:45354/145‑1 (MQ=255) acaAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTgg > 5:180308/1‑113 (MQ=255) acaAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTgg < 6:180308/113‑1 (MQ=255) acaAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTg > 2:246221/1‑148 (MQ=255) aaGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAAt > 1:112755/1‑149 (MQ=255) aGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATg < 8:93145/149‑1 (MQ=255) aGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATg < 6:54181/149‑1 (MQ=255) gcAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGca < 1:246221/149‑1 (MQ=255) t‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCgcggcg > 2:22687/1‑142 (MQ=255) t‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCgcggcg < 1:22687/142‑1 (MQ=255) t‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGGACAgg < 6:212622/149‑1 (MQ=255) aCTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTc > 8:375978/1‑148 (MQ=255) tGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGaa > 6:229758/1‑149 (MQ=255) ctctACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGaa < 4:260044/147‑1 (MQ=255) ctACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGt < 1:218066/117‑1 (MQ=255) ctACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGt > 2:218066/1‑117 (MQ=255) tACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGaacaaa > 7:72294/1‑148 (MQ=255) cccGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGaacaaa < 2:197742/146‑1 (MQ=255) cccGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGCTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAacac < 5:350442/149‑1 (MQ=255) cGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGgc > 1:336025/1‑119 (MQ=255) cGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGgc < 2:336025/119‑1 (MQ=255) ttAGTTCAGG‑AATTTCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATc > 5:110577/1‑149 (MQ=255) ttAGTTCAGG‑AATTTCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATc > 1:25027/1‑149 (MQ=255) ttAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGTGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCg < 7:303836/133‑1 (MQ=255) ttAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGTGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCg > 8:303836/1‑133 (MQ=255) ttAGTTCACA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCACGGAGCACGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGAGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATc > 2:4887/1‑149 (MQ=255) gTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATcgac < 7:90693/149‑1 (MQ=255) gTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATcga < 5:229758/148‑1 (MQ=255) ttCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACACTcgacc > 6:50709/1‑149 (MQ=255) ttCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATcgacc > 3:58918/1‑149 (MQ=255) tCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCTCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATcgacc > 2:50134/1‑148 (MQ=255) | GCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGT‑CTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGA‑AATTCCTGAACTAAG‑TATTTGTCGGTAGCGATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATCGACC > NC_002947/5137518‑5137808 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |