Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 373,407 | C→G | 5.0% | L217V (CTG→GTG) | dgcB → | dimethylglycine dehydrogenase subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 373,407 | 0 | C | G | 5.0% | 262.0 / 2.6 | 79 | L217V (CTG→GTG) | dgcB | dimethylglycine dehydrogenase subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/41); new base G (2/2); total (36/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 |
GGCGTGCTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGCCGCTGGCCAGCCGTTGAAC > NC_002947/373263‑373553 | ggggTGCTGTGGTGGTTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCAGGAGCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCGTTGCACCGCCGTGCCGAACGGTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAATCCGCTgg < 6:247578/145‑1 (MQ=255) ggcGTGCTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTg < 6:46058/147‑1 (MQ=255) cGTGCTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCAGCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGAcc < 5:341952/149‑1 (MQ=255) gTGCTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCt < 8:305546/149‑1 (MQ=255) tGCTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTg < 2:102198/149‑1 (MQ=255) cTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTgg > 5:418567/1‑148 (MQ=255) tgtgGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGaa < 8:132874/149‑1 (MQ=255) gggTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGAcc < 5:87262/149‑1 (MQ=255) gggTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGAc < 8:85802/148‑1 (MQ=255) ggTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGAccc < 4:314720/149‑1 (MQ=255) ggTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGAccc < 1:205507/149‑1 (MQ=255) ggTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGAccc < 4:214127/149‑1 (MQ=255) gtgtgtCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCAGCGGCTTGAGGCCGGTGGag < 6:26779/137‑2 (MQ=255) gtgtgtCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCAGCGGCTTGAGGCCGGTGGag > 5:26779/1‑136 (MQ=255) gtCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAAcg > 7:232328/1‑149 (MQ=255) cGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAAcgcg < 2:147588/149‑1 (MQ=255) ggAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACgcgc > 2:276241/1‑149 (MQ=255) ggAGCTGTTCTTTGGCATGACCT‑GGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCACCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACgcgc < 3:2083/148‑1 (MQ=255) gAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGcc > 8:137702/1‑149 (MQ=255) ttCTTTGGCATGACCTGTGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTg < 5:118330/148‑1 (MQ=255) ttCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTg < 5:204914/148‑1 (MQ=255) gCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGa > 6:42462/1‑148 (MQ=255) cATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGaaa < 8:232328/149‑1 (MQ=255) aCCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGcc > 3:243754/1‑149 (MQ=255) cTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCCCCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCgg > 6:350939/1‑149 (MQ=255) cTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCgg < 4:13944/149‑1 (MQ=255) ggcggcCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGa < 3:174126/149‑1 (MQ=255) gcggcCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTTCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGAc < 2:371987/149‑1 (MQ=255) gcggcCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGAc > 1:78525/1‑149 (MQ=255) ggcCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTg > 3:154371/1‑127 (MQ=255) ggcCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTg < 4:154371/127‑1 (MQ=255) ggcCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCCGCCTCAAGCCGCTGGACCAGGAAGACCCGAACGCGCCCCATGGCGGGGAAAAGCCGGTGGACt > 2:405185/1‑148 (MQ=255) cccGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGTACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCa > 5:261103/1‑149 (MQ=255) cccGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCa < 2:35429/149‑1 (MQ=255) gATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCt > 7:125726/1‑149 (MQ=255) gAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTgg > 4:382043/1‑148 (MQ=255) gCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAAcc < 7:137702/149‑1 (MQ=255) gCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAAc > 1:344909/1‑148 (MQ=255) gCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACACTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAAcc > 1:99303/1‑149 (MQ=255) cGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAgc < 1:276241/149‑1 (MQ=255) cGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTTGACTTCACCTGGAACCAGctgctg < 3:41504/148‑1 (MQ=255) cGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGATCCAGCTGCTgg > 1:343040/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTggg < 2:343040/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGc > 5:401805/1‑149 (MQ=255) ccTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTg < 4:218314/116‑1 (MQ=255) ccTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTg > 3:218314/1‑116 (MQ=255) ccTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGa < 3:382043/148‑1 (MQ=255) ccTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGAt < 4:243754/149‑1 (MQ=255) cTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATg > 5:110961/1‑149 (MQ=255) ttGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGTCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGc > 8:39186/1‑149 (MQ=255) cACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTg > 8:353112/1‑149 (MQ=255) ctggcctggcACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGt > 6:349852/1‑149 (MQ=255) ctggcctggcACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGt > 7:374791/1‑149 (MQ=255) cctggcACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAg < 1:405185/149‑1 (MQ=255) ctggcACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAg < 5:114581/121‑1 (MQ=255) ctggcACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAg > 6:114581/1‑121 (MQ=255) ctggcACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGt > 7:298744/1‑149 (MQ=255) tggcACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTg > 8:303620/1‑149 (MQ=255) tggcACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGCACCAGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCCCGTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTg > 8:274946/1‑149 (MQ=255) gcACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGTTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTg < 2:78525/147‑1 (MQ=255) gcACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCg < 8:125726/149‑1 (MQ=255) gcACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGCCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCg < 5:349852/149‑1 (MQ=255) aCCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCgg > 7:269001/1‑148 (MQ=255) ccgccgTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAAc > 3:331583/1‑112 (MQ=255) ccgccgTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAAc < 4:331583/112‑1 (MQ=255) ccgccgTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTa < 8:269001/149‑1 (MQ=255) cgccgTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTa > 5:356833/1‑148 (MQ=255) cTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCAtgt < 6:110961/149‑1 (MQ=255) ttCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCAtgtg > 6:234276/1‑149 (MQ=255) ggcggcggcCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGcc < 2:344909/148‑1 (MQ=255) ggcggcCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGc < 6:356833/149‑1 (MQ=255) gcggcCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGcc < 6:261103/149‑1 (MQ=255) ggcCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCtt < 7:227172/149‑1 (MQ=255) cGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGc > 5:129973/1‑149 (MQ=255) cGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGc < 7:303620/149‑1 (MQ=255) tCCAGCGGCTTGAGGCCGGTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGCCGc > 4:131727/1‑149 (MQ=255) aggCCGGTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGCCGCTGGCCAGCCGtt < 3:131727/147‑1 (MQ=255) aaGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGCCGCTGGCCAGCCGtt > 8:167097/1‑149 (MQ=255) cGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGCCGCTGGCCAGCCGTTGAAc > 5:399077/1‑149 (MQ=255) | GGCGTGCTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGCCGCTGGCCAGCCGTTGAAC > NC_002947/373263‑373553 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |