| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 384,498 | G→A | 5.4% | A326T (GCA→ACA) | PP_0320 → | methyl‑accepting chemotaxis transducer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 384,498 | 0 | G | A | 5.4% | 227.7 / 2.1 | 74 | A326T (GCA→ACA) | PP_0320 | methyl‑accepting chemotaxis transducer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/35); new base A (2/2); total (37/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.39e-01 | |||||||||||
GTGCCAGAGTCGGAAATTTACGCGCAAATGCATCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCGGCGAGGTGTTGAGTACCTCC > NC_002947/384354‑384644 | gTGCCAGAGTCGGAAATTTACGCGCAAATGCATCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCAtt < 4:250696/149‑1 (MQ=255) ccAGAGTCGGAAATTTACGCGCAAATGCATCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTgg < 2:157526/148‑1 (MQ=255) agTCGGAAATTTACGCGCAAATGCATCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAg < 1:219663/149‑1 (MQ=255) agTCGGAAATTTACGCGCAAATGCATCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCATGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGtt > 4:251879/1‑146 (MQ=255) tCGGAAATTTACGCGCAAATGCATCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGAt < 7:120355/149‑1 (MQ=255) cGGAAATTTACGCGCAAATGCATCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGAt < 7:55335/148‑1 (MQ=255) ggAAATTTACGCGCAAATGCATCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGAtt < 6:379109/148‑1 (MQ=255) ggAAATTTACGCGCAAATGCATCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTg > 3:200099/1‑149 (MQ=255) cAAATGCATCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCggg < 4:200099/149‑1 (MQ=255) aaaTGCATCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGt > 7:246614/1‑149 (MQ=255) tGCATCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGAt < 8:53450/149‑1 (MQ=255) tcATCAGGCCGTCTGGCTGACCTGCCTGATCGGTGGCGCCTTCGGGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTTCTGCTGGCGCGTGGCCTGGTTGGGCCTATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGAt < 3:300757/147‑1 (MQ=255) aTCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCTTTGGTGTCGCTGCTGTTCGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGACGATCCGC‑CGCGTTACAGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGAtct > 4:354451/1‑148 (MQ=255) aTCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGt > 7:343285/1‑143 (MQ=255) aTCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGt < 8:343285/143‑1 (MQ=255) aTCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCACATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGAtct > 5:229498/1‑148 (MQ=255) aTCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCACATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGAtct > 3:340222/1‑148 (MQ=255) tCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGAtct > 2:116838/1‑147 (MQ=255) cAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAg > 7:170882/1‑149 (MQ=255) aGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGc < 8:73296/149‑1 (MQ=255) gCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTg > 2:6250/1‑148 (MQ=255) tGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGAc > 6:54750/1‑149 (MQ=255) tGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCCTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGAc > 3:209860/1‑149 (MQ=255) aCCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGa < 8:246341/149‑1 (MQ=255) cAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGGCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGAtt < 6:178124/149‑1 (MQ=255) gCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTcg > 8:64373/1‑149 (MQ=255) aTCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTc < 5:388328/148‑1 (MQ=255) gcgcCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGa < 3:338445/148‑1 (MQ=255) cGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTgg > 1:312127/1‑149 (MQ=255) cGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTgg > 8:371591/1‑149 (MQ=255) gTTTGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGAcc > 8:247736/1‑149 (MQ=255) gtgtCGCTGCTGTTGGTGGTTCTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGc < 5:395985/149‑1 (MQ=255) tgtCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTgg < 3:169323/147‑1 (MQ=255) tgtCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTgg > 4:169323/1‑147 (MQ=255) gtCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGccc > 3:352314/1‑149 (MQ=255) gctgctGTTGGTGGTACTGCTGGAGCGTGGCGTGGTGCGGGCGATCGGC‑CGCGTTACCGCCGGATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTg < 3:354451/149‑1 (MQ=255) ctgctgTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGAtt > 1:138276/1‑115 (MQ=255) ctgctgTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGAtt < 2:138276/115‑1 (MQ=255) ctgctgTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTgg < 5:54750/149‑1 (MQ=255) ctgctgTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTgg < 2:312127/149‑1 (MQ=255) tgctgTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGCGCGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTgg > 1:88856/1‑133 (MQ=255) tgctgTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTgg < 2:88856/132‑1 (MQ=255) tgctgTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGt < 3:251879/149‑1 (MQ=255) gctgTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGtt > 4:156224/1‑149 (MQ=255) ctgTTGGTGTTCGTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGTGTGACCTGGCCCGTGGtt < 4:209860/148‑1 (MQ=255) ctgctgGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑TGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCt > 2:308971/1‑149 (MQ=255) ctgctgGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCACATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTcc < 4:340222/148‑1 (MQ=255) ctgctgGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCACATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTcc < 6:229498/148‑1 (MQ=255) gTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCaa < 1:6250/149‑1 (MQ=255) tGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCTGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAAc < 8:170882/149‑1 (MQ=255) gCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACg > 3:381137/1‑148 (MQ=255) ccTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACg > 8:102789/1‑147 (MQ=255) cTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAgg > 8:123245/1‑94 (MQ=255) cTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAgg < 7:123245/94‑1 (MQ=255) tGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGc > 2:279907/1‑149 (MQ=255) gTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGc < 4:381137/147‑1 (MQ=255) gTGCGGCCGATCAGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCAAGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCt > 1:106550/1‑149 (MQ=255) gCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCg > 2:224490/1‑149 (MQ=255) ccGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACg > 4:122428/1‑73 (MQ=255) ccGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCgg < 3:156224/149‑1 (MQ=255) cGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCGGc > 3:128020/1‑149 (MQ=255) cGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCGGc > 1:12022/1‑149 (MQ=255) gATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGTGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCGGc > 2:238500/1‑148 (MQ=255) gATACGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTGCCTGGACCT‑CCAACGCAGCCTGATCGGc > 8:101682/1‑148 (MQ=255) aTCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCGGc > 7:206303/1‑147 (MQ=255) tCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGGGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCGGCGAg < 7:371591/149‑1 (MQ=255) gc‑cgcGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCGGCGAGgtg > 6:226904/1‑149 (MQ=255) gc‑cgcGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCGGCGAGgtg > 3:366729/1‑149 (MQ=255) cgcgTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGCCCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCGGCGAGGTGtt < 1:116838/149‑1 (MQ=255) cgcgTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCGGCGAGGTGtt < 4:128020/149‑1 (MQ=255) gcgTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAGCCCAACGCAGCCTGATCGGCGAGGTGtt < 1:224490/149‑1 (MQ=255) cgTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCGGCGAGGTGTTGa < 1:308971/149‑1 (MQ=255) gTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCGGCGAGGTGTTGAg > 6:155512/1‑149 (MQ=255) ttACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCGGCGAGGTGTTGAGt < 7:64373/149‑1 (MQ=255) ccgcATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCGGCGAGGTGTGGAGTACCTcc > 8:55077/1‑149 (MQ=255) | GTGCCAGAGTCGGAAATTTACGCGCAAATGCATCAGGCCGTCTGGCTGACCAGCCTGATCGGTGGCGCCGTCGCGTTGGTGTCGCTGCTGTTGGTGGTACTGCTGGCGCGTGGCCTGGTGCGGCCGATCCGC‑CGCGTTACCGCCGCATTGGTTCAGATTGGCAGTGGAGCGGGTGATCTCAGCCACCGCCTGGACGATTCGCGTCAGGATGAGCTGGGTGACCTGGCCCGTGGTTTCAACCGCTTCCTGGACAG‑CCAACGCAGCCTGATCGGCGAGGTGTTGAGTACCTCC > NC_002947/384354‑384644 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |