Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,322,154 | C→T | 6.1% | S366S (TCG→TCA) | mrcB ← | transglycosylase/transpeptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,322,154 | 0 | C | T | 6.1% | 197.3 / 2.1 | 65 | S366S (TCG→TCA) | mrcB | transglycosylase/transpeptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/29); new base T (2/2); total (34/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 |
GCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTCGGGGTGACGCCGCG > NC_002947/5322006‑5322302 | gcTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCCGGCCTTCTTCGGTCTAGTCCTCGTCGCGGTATTGCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAAc < 4:333686/149‑1 (MQ=255) ttGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAAc > 8:44581/1‑147 (MQ=255) gAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGc > 1:316444/1‑149 (MQ=255) ctcGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCgg > 3:65710/1‑149 (MQ=255) tcGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGc > 2:9392/1‑149 (MQ=255) gCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGc > 3:274586/1‑147 (MQ=255) aTCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAgg < 8:32813/147‑1 (MQ=255) tCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTg > 1:303838/1‑149 (MQ=255) cGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGc > 2:179732/1‑149 (MQ=255) gAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGc < 4:99504/148‑1 (MQ=255) aGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCa > 3:353135/1‑149 (MQ=255) cGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCtt < 2:303838/148‑1 (MQ=255) ggCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTgg < 1:9392/149‑1 (MQ=255) ggCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTgg < 3:122355/149‑1 (MQ=255) ggCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTg < 2:206342/148‑1 (MQ=255) aTCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACg < 2:225775/147‑1 (MQ=255) aTCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACg > 1:225775/1‑147 (MQ=255) cAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCa < 1:39215/146‑1 (MQ=255) tAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCAtt > 1:73923/1‑149 (MQ=255) tAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCAtt < 2:73923/149‑1 (MQ=255) gggTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCAttt < 1:45632/148‑1 (MQ=255) ggTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTttc > 8:193861/1‑149 (MQ=255) gTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTttct > 8:347558/1‑149 (MQ=255) gAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTttcttc < 6:395616/148‑1 (MQ=255) gAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTttcttc < 4:274586/148‑1 (MQ=255) gAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTttcttc < 6:389874/148‑1 (MQ=255) gAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTttcttc < 1:206658/148‑1 (MQ=255) gAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTcg > 3:30996/1‑149 (MQ=255) gCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTcgccg < 4:65710/149‑1 (MQ=255) gTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGTATTTTCTTCGCCGCAt < 4:201284/148‑1 (MQ=255) gTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATc > 4:181671/1‑149 (MQ=255) gTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATc > 4:175455/1‑149 (MQ=255) tGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCt < 8:17554/149‑1 (MQ=255) aGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTGGTCGCGGTAATCCTGGCGCAAGTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGGTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCctg < 3:226461/149‑1 (MQ=255) aGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGCCCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCATGGTCACGCCCAGCGGCATTTTATTCGCCGCATAGACTTCGGCctg > 2:92869/1‑149 (MQ=255) ttcttcGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCctggctgg > 6:64913/1‑149 (MQ=255) cttcGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCtggctggc < 5:64913/148‑1 (MQ=255) cGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGcc < 4:353135/146‑1 (MQ=255) tCAGGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTcgccgc > 3:238381/1‑121 (MQ=255) tCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTcgccgc < 4:238381/121‑1 (MQ=255) tcgtagCGGTAAACCTGGCGCAACTCTCGCTTGACAAGGTCGAGGAAGGCAGGGAACGAGCTGTCCGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACACCCATCGGCATTTTCTTCTCCTCATAGACTTCTGCCTGCCTGGCCACGCCCTGcaccgc > 4:138434/1‑144 (MQ=255) gcgGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGccacca < 7:347558/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGc < 4:30996/148‑1 (MQ=255) gcgcAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAATGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCAc > 4:32455/1‑147 (MQ=255) gcgcAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAATGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCAc > 4:27100/1‑147 (MQ=255) gcgcAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCAcc < 7:44581/148‑1 (MQ=255) cTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTgc > 7:258816/1‑149 (MQ=255) tCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAATGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTgcg < 3:27100/147‑1 (MQ=255) tCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAATGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTgcg < 3:32455/147‑1 (MQ=255) gCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTgcggc > 8:64156/1‑147 (MQ=255) cTTGACCAGGTCGATGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAg > 5:228193/1‑149 (MQ=255) ttGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGc > 2:262494/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCTgg > 5:112034/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAgg < 1:92869/149‑1 (MQ=255) aaGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTCggg < 7:55684/149‑1 (MQ=255) ggCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTCGGGGt > 5:397769/1‑149 (MQ=255) ggCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTCGGGGt < 5:362676/149‑1 (MQ=255) ggCTGGGAACGAGCGGGCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTCGGGGt < 2:249375/149‑1 (MQ=255) cTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTCGGGGTGa > 5:215681/1‑149 (MQ=255) cTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTCGGGGTGa > 5:221239/1‑149 (MQ=255) cTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTCGGGGTGa > 1:169444/1‑149 (MQ=255) cTGGGAACCAGCTGTCCGCCAGCCTCCCACGCTACGACACGCCCAGCGCCAATTTCTTCGCCCCATCGACTTCAGCCTGGCAGGCCACCCCCTGCTCGGCCACCAGCTCGAGCACCACGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTcccggaga > 2:238000/1‑142 (MQ=255) tGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTCGGGGTGAc > 8:308913/1‑149 (MQ=255) ggAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTCGGGGTGAc < 1:238000/147‑1 (MQ=255) gAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTCGGGGTGAcgcc > 2:277487/1‑149 (MQ=255) gAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTCGGGGTGAcgcc > 8:194466/1‑149 (MQ=255) aaCGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTCGGGGTGAcgccg > 3:244245/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTCGGGGTGACGCcgcg < 1:277487/149‑1 (MQ=255) | GCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCTGGTAAAGATGCGCAGGCCTTCTTCGGTCAAGTCCTCGTCGCGGTAATCCTGGCGCAACTGTCGCTTGACCAGGTCGAGGAAGGCTGGGAACGAGCTGTCGGCCAGGCTGCCACGCTTGGTCACGCCCAGCGGCATTTTCTTCGCCGCATCGACTTCTGCCTGGCTGGCCACGCCCTGCTCGGCCACCAGGTCGAGCACCAGGTTGCGGCGAGCCAGGGCCCGCTCGGGGTGACGCCGCG > NC_002947/5322006‑5322302 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |