| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,331,399 | G→C | 7.2% | G54G (GGC→GGG) ‡ | PP_4692 ← | aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,331,399 | 0 | G | C | 7.2% | 256.9 / 6.8 | 80 | G54G (GGC→GGG) ‡ | PP_4692 | aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/38); new base C (4/2); total (40/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.94e-01 | |||||||||||
CGGAGCCACCGGGGGTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCGGCTGCGCGCACTG > NC_002947/5331254‑5331546 | cGGAGCCACCGGGGGTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTggccg < 1:275781/149‑1 (MQ=255) aGCCACCGGGGGTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTggccggcc > 5:157246/1‑149 (MQ=255) aGCCACCGGGGGTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTggccggcc < 8:368706/149‑1 (MQ=255) aGCCACCGGGGGTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTggccggcc < 2:181338/149‑1 (MQ=255) gCCACCGGGGGTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGgccggccg > 5:107451/1‑149 (MQ=255) ccACCGGGGGTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCcgc > 4:323434/1‑149 (MQ=255) aCCGGGGGTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGcga > 5:8397/1‑149 (MQ=255) aCCGGGGGTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGcga < 8:235972/149‑1 (MQ=255) ccGGGGGTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCGGCCAGGCcgcgct < 5:280854/149‑3 (MQ=255) cGGGGGTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGcgac > 5:396650/1‑148 (MQ=255) ggggTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGAt < 6:4227/149‑1 (MQ=255) gggTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATg < 1:212167/149‑1 (MQ=255) ggTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATgg < 7:368307/149‑1 (MQ=255) ggTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATgg > 1:213302/1‑149 (MQ=255) ggTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCAGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATgg < 5:254948/149‑1 (MQ=255) taataaGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGt < 6:265223/149‑1 (MQ=255) taataaGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGt < 4:286359/149‑1 (MQ=255) aataaGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCcgc > 4:178705/1‑138 (MQ=255) aataaGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCcgc < 3:178705/138‑1 (MQ=255) taaGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCAAAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGAGGGGTGCg > 5:276787/1‑149 (MQ=255) aaGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTgg < 2:104671/127‑1 (MQ=255) aaGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTgg > 1:104671/1‑127 (MQ=255) ggATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGcc < 8:114753/149‑1 (MQ=255) gATGCGTTACGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGAAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGCCGATGGGTGCGGCCg > 6:2321/1‑149 (MQ=255) tGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCgtg < 6:107451/149‑1 (MQ=255) gCGTTCGGGGTCGATGTTCAGCCAATAGGGCTG‑CCAAAAAAACCGGTAAATTCCCCCTACGACCCCCCCCATAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCgt < 1:335084/149‑1 (MQ=255) cGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCgtggt > 6:210205/1‑149 (MQ=255) gTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGGCCGCGCTggccgcagggc < 8:265127/128‑7 (MQ=255) gTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCgtggt > 2:300033/1‑148 (MQ=255) gTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCgtg > 1:265361/1‑146 (MQ=255) gTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCgtg < 2:265361/146‑1 (MQ=255) ttCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCgtggtg < 8:212194/148‑1 (MQ=255) ttCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCgtggtg > 7:212194/1‑148 (MQ=255) ggTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTcc < 6:271428/149‑1 (MQ=255) 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cccATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATc < 5:328298/148‑1 (MQ=255) cccATAAAAACCGG‑CAATTGACTC‑ACT‑CACTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGACTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGAAGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCa > 4:173721/1‑149 (MQ=255) aaaCCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTg < 7:207842/149‑1 (MQ=255) aaCCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGc > 5:352405/1‑149 (MQ=255) cGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCg > 4:384312/1‑149 (MQ=255) c‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGccc < 7:308481/136‑1 (MQ=255) c‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGccc > 8:308481/1‑136 (MQ=255) g‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGGGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCg < 5:2321/149‑1 (MQ=255) cAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGt < 6:396650/149‑1 (MQ=255) aGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGtt < 3:384312/149‑1 (MQ=255) gTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTg < 3:86393/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGAT‑GGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGccc > 6:197862/1‑149 (MQ=255) ggCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCg < 5:396243/149‑1 (MQ=255) ggCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCg > 7:212827/1‑149 (MQ=255) ggCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCg > 6:396243/1‑149 (MQ=255) gCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCgg < 6:352405/149‑1 (MQ=255) gCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCgg > 2:193780/1‑149 (MQ=255) tAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCgg > 7:381626/1‑129 (MQ=255) tAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCgg < 8:381626/129‑1 (MQ=255) gCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGa < 5:129526/149‑1 (MQ=255) cGAGTGTGCCCTGCGGCCAGTGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAg > 4:171834/1‑83 (MQ=255) 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gCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAg > 6:260838/1‑139 (MQ=255) gCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAg > 6:255033/1‑139 (MQ=255) gCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAg < 5:255033/139‑1 (MQ=255) cGGCCAGGCCGCGCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGgcg > 3:271176/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCAGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGcgcg > 3:133455/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCAGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCgg < 4:133455/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGAGGCCGGGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGGGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCGGCAACTCGGTGGCCCCGGCCAGCAGCGCCATGACGGGGAAAGGTACGAAGGAGCgg > 3:244529/1‑149 (MQ=255) cAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCGGc < 1:193780/149‑1 (MQ=255) tcgcgGCCGGCCAGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTgg < 8:121589/101‑1 (MQ=255) tcgcgGCCGGCCAGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTgg > 7:121589/2‑102 (MQ=255) tcgcgGCCGGCCAGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCGGCTg > 1:322646/2‑149 (MQ=255) gcgcGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCGGCTg > 7:190483/1‑149 (MQ=255) cgcgGCCGGCCAGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCGGCTgc > 6:332532/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCGGCTGCGCGCAc > 4:346082/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCGGCTGCGCGCAc < 3:346082/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCGGCTGCGCGCAc > 7:181359/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCGGCTGCGCGCACt > 6:361304/1‑149 (MQ=255) gccggccgCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCGGCTGCGCGCACTg > 1:211025/1‑148 (MQ=255) | CGGAGCCACCGGGGGTAATAAGGATGCGTTCCGGGTCGATGTTCAGGCCATAGCGCTGCCCATAAAAACCGG‑CAATTGCCTC‑ACG‑CAGTGCCGGCAGACCGCGTGCGGCGGTGTAGCGAGTGTGCCCTGCGGCCAGCGCGGCCTGGCCGGCCGCGACGATGGGTGCGGCCGTGGTGAAGTCCGGCTCGCCGATTTCCAGGTGGATCACGTCGTGCCCGGCCGCCTGCAGCTCGTTGGCCCGGGCCAGCAGCGCCATGACGTGGAAAGGTTCGATGGCGCGGCTGCGCGCACTG > NC_002947/5331254‑5331546 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |