| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,344,252 | T→C | 5.5% | F498L (TTC→CTC) | pgi‑II → | glucose 6‑phosphate isomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,344,252 | 0 | T | C | 5.5% | 189.5 / 2.2 | 72 | F498L (TTC→CTC) | pgi‑II | glucose 6‑phosphate isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/38); new base C (2/2); total (32/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.59e-01 | |||||||||||
GCGCTAAAGGCCTCAACGAAGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAA > NC_002947/5344106‑5344397 | gcgcTAAAGGCCTCAACGAAGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTc > 6:47706/1‑149 (MQ=32)gcgcTAAAGGCCTCAACGAAGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTc < 1:87704/149‑1 (MQ=32)gcgcTAAAGGCCTCAACGAAGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTc < 2:119125/149‑1 (MQ=32) cTAAAGGCCTCAACGAAGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTa < 8:47030/149‑1 (MQ=32) tAAAGGCCTCAACGAAGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTc > 3:356428/1‑145 (MQ=32) tAAAGGCCTCAACGAAGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTc < 4:356428/145‑1 (MQ=32) ggCCTCAACGAACCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAACACCTTGTGCTCGTA‑Catgg < 4:310046/149‑4 (MQ=11) ccTCAACGAAGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGGTCCCGGGTAACCGCCCGAGCACCACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTCGGTGCCCTGGTGGCCATGTTCGAGCAGAAGGTGTACGTA‑CAGAGCg > 2:104141/1‑149 (MQ=11) ccTCAACGAAGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCg < 7:51722/149‑1 (MQ=32) ccTCAACGAAGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCg < 7:236744/149‑1 (MQ=32) ccTCAACGAAGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTCATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCg > 4:158168/1‑149 (MQ=17) cTCAACGAAGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTAGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGAGCGCAGCTGCCCATGTACGAGCACAACGTGTTCGTA‑CAGACCGt > 7:73170/1‑149 (MQ=11) cTCAACGAAGCAGACATCAAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGt < 2:41885/149‑1 (MQ=17) aaCGAAGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAATGTGTTCGTA‑CAGAGCGt > 4:28767/1‑146 (MQ=17) caGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTgg < 1:393016/148‑1 (MQ=17) aaGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTgg < 3:158168/149‑1 (MQ=32) aGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTggg < 6:26477/149‑1 (MQ=32) aGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTggg < 5:47706/149‑1 (MQ=32) gCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCAGAAGGTGGTCCCTGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCTCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTTCGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTgggg < 1:104141/149‑1 (MQ=11) 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aGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCTGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTc < 8:218652/149‑1 (MQ=17) aGCTGGCCCCGCACAAGGTGAGCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTc < 8:218650/149‑1 (MQ=17) gCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTc > 5:339694/1‑115 (MQ=32) gCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTc < 6:339694/115‑1 (MQ=32) gCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGAt < 1:745/147‑1 (MQ=32) ccctcGCACACTGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACCCGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGTCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCa < 8:355495/145‑1 (MQ=11) gCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTggg < 4:233980/149‑1 (MQ=32) acaAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTAt < 2:235965/118‑1 (MQ=32) acaAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTAt > 1:235965/1‑118 (MQ=32) acaAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGc > 1:162767/1‑149 (MQ=32) aaGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGt > 1:211680/1‑149 (MQ=32) aTCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCgagct < 2:211680/149‑1 (MQ=32) tCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCgagctg > 4:63826/1‑149 (MQ=32) cGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCg < 7:360303/126‑1 (MQ=32) cGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCg > 8:360303/1‑126 (MQ=32) cGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCgagctggg > 2:60405/1‑148 (MQ=32) cGGGTAACCGCCAGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGACATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCGTCGATCAGTGGGGCGTCgagctggg > 6:367372/1‑148 (MQ=12) gTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATTTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCgagctgggcaag < 3:63826/149‑1 (MQ=17) gTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCgagctgggcaag > 7:278416/1‑149 (MQ=32) aCCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCgagctgggcaaggag > 7:346696/1‑149 (MQ=32) gCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAAc < 4:310770/110‑1 (MQ=32) gCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAAc > 3:310770/1‑110 (MQ=32) cccGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCgagctgggcaaggagctgg < 2:29487/149‑1 (MQ=34) aaCTCGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGAGCTGGTGGCCTTGTTCGAGCACAAGGTGTTCGTA‑GAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGagctgggcaaggagctgggcaagg < 8:73170/148‑1 (MQ=11) acacGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAggg > 5:23239/1‑148 (MQ=35) acacGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAggg < 6:23239/148‑1 (MQ=35) ggtggaCGACCGGATCAGGCCGCGCGCGGTCGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTAc < 2:162767/148‑1 (MQ=11) gtggtggtgCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAATGGCGTTTACCa < 3:378718/149‑1 (MQ=255) tCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAgcgc > 4:365114/1‑149 (MQ=34) gcgcacccAGCCGGCGCGGGCT‑GATGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTgg > 4:179108/8‑149 (MQ=11) gcacccAGCCGGCGCGGGCT‑GATGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTc < 3:179108/144‑1 (MQ=11) cgcATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGt < 8:346696/149‑1 (MQ=34) cccGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGcc > 8:104408/1‑149 (MQ=34) gcgcCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTAGCAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTg > 1:95184/1‑149 (MQ=21) ggTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAgcgc < 2:95184/149‑1 (MQ=34) tggCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGt < 3:28767/149‑1 (MQ=34) gCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTc > 1:21493/1‑149 (MQ=34) ctctGTACGAACACCTTGTGCTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTcc > 5:225929/4‑149 (MQ=11) ccATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTc > 5:16165/1‑148 (MQ=34) tctGTACGAACACCTTGTGCTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGtt < 5:131018/144‑1 (MQ=11) tctGTACGAACACCTTGTGCTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGtt > 6:131018/3‑146 (MQ=11) tGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCAcc < 6:415929/149‑1 (MQ=34) gTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCAcc > 5:61215/1‑148 (MQ=34) gAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCaa < 3:392225/147‑1 (MQ=34) gAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTAGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCaa > 4:392225/1‑147 (MQ=21) caAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGa < 2:220179/149‑1 (MQ=34) ggTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGT‑GGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCaa < 7:354698/149‑1 (MQ=21) | GCGCTAAAGGCCTCAACGAAGCAGACATCGAAAAGCTGGCCCCGCACAAGGTGATCCCGGGTAACCGCCCGAGCAACACGTTGGTGGTCGAGCGCATCAGCCCGCGCCGGCTGGGTGCGCTGGTGGCCATGTACGAGCACAAGGTGTTCGTA‑CAGAGCGTTATCTGGGGTATCAACGCCTTCGATCAGTGGGGCGTCGAGCTGGGCAAGGAGCTGGGCAAGGGCGTTTACCAGCGCTTGGTCGGTAGCCTGGAAGACAGCGCCGAAGACGGTTCCACCCAAGGCCTGATCAA > NC_002947/5344106‑5344397 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |