Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 79,895 | C→A | 5.5% | P217Q (CCG→CAG) | PP_0069 → | rossmann fold nucleotide‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 79,895 | 0 | C | A | 5.5% | 233.1 / 3.0 | 72 | P217Q (CCG→CAG) | PP_0069 | rossmann fold nucleotide‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/41); new base A (2/2); total (29/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.21e-01 |
GGGCCGCGTTGCAGGCTGGCGGCGGCACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACGGCGCGTCTGGCGGCGGAACAAGGCCGCGAGGTGTACGCCATTC > NC_002947/79748‑80038 | gggCCGCGTTGCAGGCTGGCGGCGGCACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCg > 4:263718/1‑149 (MQ=255) ggCCGCGTTGCAGGCTGGCGGCGGCACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCAGGCAGc > 7:275066/1‑149 (MQ=255) cgcgTTGCAGGCTGGCGGCGGCACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCAGGCAGCGGc > 3:316869/1‑149 (MQ=255) ggTTGCAGGCTGGCGGATGCACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGATTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACGTTTCGCAGGATATTATCGACAAAGGCAGTT‑CTCTGGTTTCCGAGTATCCCGTGGATGCCGGGCCGCTTCCt < 2:232194/148‑1 (MQ=255) cgTTGCAGGCTGGCGGCGGCACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCt < 2:3048/149‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCGGCACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCaa < 3:87435/149‑1 (MQ=255) aGGCTGGCGGCGGCACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAAc > 4:61788/1‑149 (MQ=255) ggCTGGCGGCGGCACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCAGGCAGCGGCCCGGCatcc < 8:275066/149‑4 (MQ=255) gCTGGCGGCGGCACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACtt > 3:226584/1‑149 (MQ=255) gCTGGCGGCGGCACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCAGGCAGCGGCCCGGCatcca < 4:316869/149‑5 (MQ=255) cggcACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGgc < 4:226584/149‑1 (MQ=255) cggcACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGgc < 1:37856/149‑1 (MQ=255) cggcACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGgc < 3:250753/149‑1 (MQ=255) cggcACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGgc < 6:175952/149‑1 (MQ=255) ggcACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGgcg > 3:180192/1‑149 (MQ=255) cACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGgcgc > 8:222018/1‑148 (MQ=255) gCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATAGGGACCTAGCGCAGGCGATGATCGACAAAGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCACAGGATGACGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCACCCGGCGCAACCgga > 7:385287/1‑146 (MQ=255) ccGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGcatc < 2:103890/149‑1 (MQ=255) gTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGcatcat < 7:222018/149‑1 (MQ=255) tGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCatcatc < 3:61349/149‑1 (MQ=255) ggTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTgg < 4:196867/149‑1 (MQ=255) ggTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTg < 5:418313/148‑1 (MQ=255) ggTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTg < 3:261442/148‑1 (MQ=255) gTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTggg < 6:9401/149‑1 (MQ=255) gTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTggg < 3:263718/149‑1 (MQ=255) ggCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCg > 3:143856/1‑131 (MQ=255) ggCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCg < 4:143856/131‑1 (MQ=255) cAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCgg > 5:360276/1‑149 (MQ=255) aaaaaCTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCCGTGGGCTGTCGCTCGgt > 7:292072/1‑149 (MQ=255) aaaaaCTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGgt > 3:149323/1‑149 (MQ=255) aaaaaCTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGgt > 1:160515/1‑149 (MQ=255) aaaaaCTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGgt < 5:371575/149‑1 (MQ=255) aCTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGc < 6:175354/149‑1 (MQ=255) tttATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTGTCGCTGGTTTCCGATTATCCCATGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCAACAGTGGGCTGTCCCACGGAGTGCt > 1:105621/1‑149 (MQ=255) tttATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCtg < 4:180192/149‑1 (MQ=255) tttATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCtg > 1:404078/1‑149 (MQ=255) tATCCACAGCGCCAGCGGGCCCTTGCGCAGGCGCTGATCGACAACGGGCGTG‑CGCTGGTTTCCGAGGATCCCCTGGCTGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCtg < 5:391736/147‑1 (MQ=255) aTCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCtggt < 4:148032/148‑1 (MQ=255) tCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCTGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCtggtgg < 8:292072/149‑1 (MQ=255) tCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCtggtgg < 1:15097/149‑1 (MQ=255) acaGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGc < 7:341234/86‑1 (MQ=255) acaGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGc > 8:341234/1‑86 (MQ=255) acaGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTc > 5:79404/1‑148 (MQ=255) caGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGa < 4:149323/149‑1 (MQ=255) aGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAg < 2:134682/149‑1 (MQ=255) aGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAg < 6:310944/149‑1 (MQ=255) gcCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGG‑CGAGGctt < 6:360276/149‑3 (MQ=255) gggACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTc < 3:197225/149‑1 (MQ=255) gggACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTc < 1:380306/149‑1 (MQ=255) ccTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGc > 8:234318/1‑147 (MQ=255) cTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAg < 3:61788/149‑1 (MQ=255) cTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAg < 2:105621/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCgg > 5:405603/1‑149 (MQ=255) gatCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCa > 6:111879/1‑149 (MQ=255) tcgtaaaCGCCAGTG‑CGCTGTTATCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTTGCAACTTCCCCCGGCGCAACCCCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAATCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACg < 8:365418/144‑1 (MQ=255) tCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACg > 2:357394/1‑149 (MQ=255) gACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACGgc < 6:79404/149‑1 (MQ=255) gACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTACGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACgg < 6:405603/148‑1 (MQ=255) tGGTTTCCGAGTATCGCCTGGATGCCGGGTCGCTGGCTGTCAACTTCCCACGGCGCAACCGGATATTCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGATGCAAGCGTCGCCAGCGGGTCTCTGATGACGGCTCGTCTGGCGGCGGaa < 8:385287/149‑1 (MQ=255) gTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACGGCGCGTCTGGCGGCGGaa < 5:111879/147‑1 (MQ=255) tttCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACGGCGCGTCTGGCGGCGGAACaa < 2:404078/149‑1 (MQ=255) ttCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACGGCGCGTCTGGCGGCGGAACAAg > 2:257568/1‑149 (MQ=255) ttCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGGCGAGGctt > 2:267109/1‑99 (MQ=255) ttCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGGCGAGGctt < 1:267109/101‑3 (MQ=255) tCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACGGCGCGTCTGGCGGCGGAACAAg < 7:234318/148‑1 (MQ=255) tCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACGGCGCGTCTGGCGGCGGAACAAg < 1:357394/148‑1 (MQ=255) tCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCACCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACGGCGCGTCTGGCGGCGGAACAAgg > 6:174504/1‑149 (MQ=255) ccccTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACGGCGCGTCTGGCGGCGGAACAAGGCCGCGAGgt > 3:377194/1‑149 (MQ=255) ccTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACGGCGCGTCTGGCGGCGGAACAAGGCCGCGAGgtg > 6:398781/1‑148 (MQ=255) cTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACGGCGCGTCTGGCGGCGGAACAAGGCCGCGAGGTGTa > 2:18964/1‑149 (MQ=255) tGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACGGCGCGTCTGGCGGCGGAACAAGGCCGCGAGGTGTAc > 8:195797/1‑149 (MQ=255) cGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACGGCGCGTCTGGCGGCGGAACAAGGCCGCGAGGTGTACGCCATTc > 4:132244/1‑149 (MQ=255) | GGGCCGCGTTGCAGGCTGGCGGCGGCACGATTGCCGTGCTCGGTACGGGCTTGCAAAAACTTTATCCACAGCGCCATCGGGACCTTGCGCAGGCGATGATCGACAACGGCAGTG‑CGCTGGTTTCCGAGTATCCCCTGGATGCCGGGCCGCTGCCTGGCAACTTCCCCCGGCGCAACCGCATCATCAGTGGGCTGTCGCTCGGTGTGCTGGTGGTCGAGGCAAGCCTCGCCAGCGGCTCGCTGATCACGGCGCGTCTGGCGGCGGAACAAGGCCGCGAGGTGTACGCCATTC > NC_002947/79748‑80038 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |